Jacques II (roi d'Angleterre)

Les Cinq Enfants aînés
de Charles I^er
Mary, James, Charles, Elizabeth et Anne par Antoine van Dyck, 1637.
National Portrait Gallery, Londres.

Jacques avec son père Charles I^er par Peter Lely, 1647.

Membre de la maison Stuart, le prince Jacques est né le 14 octobre 1633 au palais Saint James de Londres. Il était le second fils du roi Charles I^er et de Henriette-Marie de France[2] et, à ce titre, n'était pas appelé à ceindre la couronne. Il fut baptisé par l'archevêque de Cantorbéry William Laud quelques mois plus tard[3]. Jacques fut éduqué par des tuteurs avec son frère aîné, le futur roi Charles II, et les deux fils du duc de Buckingham, George et Francis Villiers[4]. Il fut nommé au sein de l'ordre de la Jarretière dès 1642[5] et fait duc d'York le 22 janvier 1644[3].

Alors que l'opposition entre le roi et le Parlement d'Angleterre dégénérait en guerre civile, le prince Jacques, âgé de 10 ans, resta dans le bastion royaliste d'Oxford[6]. Lorsque la ville tomba aux mains des parlementaires en 1646, âgé de 13 ans, il fut enfermé dans le palais Saint James[7]. Son frère cadet Henri Stuart âgé de 5 ans et sa sœur Élisabeth étaient gardés à vue à Londres puis en divers lieux. La jeune princesse mourut à l'âge de 15 ans. Sa mère, qui venait de donner le jour à une petite fille, s'était réfugiée en France, son pays natal, dans des conditions particulièrement difficiles. En 1648, Jacques, âgé de 15 ans, s'échappa du palais et rejoignit secrètement La Haye dans les Provinces-Unies[8]. Lorsque son père, le roi Charles I^er, fut décapité par les rebelles en 1649, son frère aîné fut proclamé roi par les royalistes sous le nom de Charles II[9]. Il fut reconnu par les Parlements d'Écosse et d'Irlande et couronné roi d'Écosse à Scone en 1651. Cependant, même s'il fut proclamé roi à Jersey, Charles II, âgé d'à peine 20 ans, ne parvint pas à sécuriser la couronne d'Angleterre et fut contraint de se réfugier en France[9] où sa tante la reine Anne d'Autriche, proclamée régente, devait également lutter non seulement contre les parlementaires mais aussi contre la noblesse.

Comme son frère Charles, Jacques rejoignit la France et servit dans l'armée française sous le commandement de Turenne contre les frondeurs puis contre leurs alliés espagnols[10]. Il participa aux affrontements et selon un observateur, « s'exposa lui-même et chargea courageusement où tout devait être fait[10] ». En 1656, quand Charles II forma une alliance avec l'Espagne alors en guerre contre la France, Jacques fut expulsé de France et obligé de quitter l'armée de Turenne[11]. Il s'opposa à son frère au sujet de cette alliance mais les deux hommes avaient peu d'influence sur la scène diplomatique. Jacques se rendit finalement à Bruges où, avec son jeune frère Henri, il rejoignit l'armée espagnole menée par le prince de Condé et affronta ses anciens compagnons français lors de la bataille des Dunes[12]. Au sein de l'armée espagnole, Jacques se rapprocha de deux frères catholiques irlandais de l'entourage royal, Peter (en) et Richard Talbot, et s'éloigna des conseillers anglicans de son frère[13]. En 1659, les Français et les Espagnols signèrent le traité des Pyrénées. Doutant des chances de son frère de recouvrer son trône, Jacques envisagea d'accepter l'offre de devenir amiral dans la flotte espagnole[14]. Il déclina la proposition l'année suivante car la situation en Angleterre s'était stabilisée, et Charles II fut proclamé roi[15].

Anne Hyde et Jacques dans les années 1660 par Peter Lely.

Après la démission de Richard Cromwell de la fonction de lord-protecteur en 1659 et l'effondrement du Commonwealth d'Angleterre en 1660, la monarchie anglaise fut rétablie avec Charles II à sa tête. Même si Jacques était l'héritier présomptif, il semblait peu probable qu'il devienne roi à son tour, car Charles II était jeune et aurait certainement des enfants[16]. Lors de la restauration de son frère, Jacques fut fait duc d'Albany en Écosse et porta ce titre avec celui de duc d'York. À son retour en Angleterre, Jacques provoqua une controverse en annonçant ses fiançailles avec Anne Hyde, la fille du principal conseiller du roi, Edward Hyde[17]. Ils s'étaient secrètement mariés en 1659, et Anne était enceinte en 1660 ; mais après la Restauration, aucun membre de la cour ne s'attendait à voir un prince épouser une roturière[18]. Malgré les nombreuses réticences, y compris celles d'Edward Hyde, Jacques et Anne se marièrent officiellement le 3 septembre 1660 à Londres. Leur premier enfant, Charles, naquit deux mois plus tard, mais mourut en bas âge, comme cinq autres de ses frères et sœurs[18]. Seules deux filles atteignirent l'âge adulte : Marie (née le 30 avril 1662) et Anne (née le 6 février 1665)[19]. Samuel Pepys écrivit que Jacques adorait ses enfants et son rôle de père et qu'il jouait avec eux « comme un père ordinaire » alors que la coutume royale de l'époque était de confier leur éducation à d'autres[20]. Anne Hyde était dévouée à Jacques et elle influença beaucoup de ses décisions[21]. Malgré cela, Jacques eut de nombreuses maîtresses dont Arabella Churchill et Catherine Sedley et il avait la réputation de « voyeur le plus invétéré de son époque[22] ». Anne Hyde mourut en mars 1671, probablement d'un cancer du sein.

Après la Restauration, Jacques fut nommé lord-grand-amiral[23] et commanda la Royal Navy durant les deuxième (1665 – 1667) et troisième guerres anglo-néerlandaise (1672 – 1674). À la suite du raid sur la Medway de 1667, Jacques supervisa la modernisation des fortifications de la côte sud[24]. La fonction de lord-grand-amiral, associée à ses revenus issus du service postal et des taxes sur les vins (accordés par Charles II au moment de la Restauration), donna à Jacques les moyens d'entretenir une large cour[25].

En 1664, les Anglais s'emparèrent de la colonie hollandaise de Nouvelle-Néerlande et de son port principal, La Nouvelle-Amsterdam. Charles II accorda ces territoires américains situés entre les fleuves Delaware et Connecticut à son frère. En l'honneur du prince Jacques d'York, ils furent respectivement renommés province et ville de New York. Jacques céda le contrôle de la colonie à George de Carteret et John Berkeley. Fort Orange, situé à 240 km au nord sur le fleuve Hudson, fut renommé Albany d'après le titre écossais de Jacques[18]. En 1683, il devint gouverneur de la Compagnie de la Baie d'Hudson mais resta à l'écart de sa gestion[18]. Jacques présida également la Compagnie royale d'Afrique impliquée dans la traite négrière[26].

En septembre 1666, son frère Charles II le chargea des opérations durant le grand incendie de Londres en raison du manque de réactivité du maire Thomas Bloodworth et ses actions furent saluées. Un témoin écrivit, le 8 septembre : « le duc d'York a gagné le cœur du peuple avec ses efforts continus et infatigables pour aider à éteindre l'incendie[27] ».

Marie de Modène, la seconde épouse de Jacques par Willem Wissing.

Durant son séjour en France, Jacques avait découvert la foi et les cérémonies catholiques et son épouse et lui furent attirés par cette religion[28]. Jacques reçut l'eucharistie au sein de l'Église catholique en 1668 ou 1669 mais sa conversion fut gardée secrète quelque temps et il continua d'assister aux offices anglicans jusqu'en 1676[29]. Malgré cela, Jacques continua de fréquenter essentiellement des anglicans comme John Churchill, 1^er duc de Marlborough, George Legge et des protestants français comme Louis de Duras[30].

Les inquiétudes concernant l'influence catholique à la cour royale poussèrent le Parlement d'Angleterre à adopter un nouveau Test Act en 1673[31]. Selon ce texte, tous les responsables civils et militaires devaient prêter un serment par lequel ils reniaient la doctrine de la transsubstantiation et d'autres doctrines catholiques et devaient recevoir l'eucharistie selon les règles de l'Église d'Angleterre[32]. Jacques refusa ces conditions et préféra abandonner sa fonction de lord-grand-amiral ; sa conversion fut par conséquent rendue publique[31].

Charles II s'opposa à la conversion et ordonna que les filles de Jacques soient élevées dans la foi protestante[33]. Il autorisa néanmoins Jacques à épouser la princesse italienne catholique Marie de Modène alors âgée de quinze ans[34]. Jacques et Marie furent mariés par procuration lors d'une cérémonie catholique le 20 septembre 1673[35]. Le 21 novembre, Marie arriva en Angleterre et l'évêque d'Oxford, Nathaniel Crew (en), réalisa une brève cérémonie anglicane qui reconnut simplement le mariage catholique[36]. De nombreux Britanniques considéraient la nouvelle duchesse d'York comme une espionne au service du pape Clément X[37].

James Scott, 1^er duc de Monmouth, fut impliqué dans plusieurs complots contre Jacques. Peinture de Willem Wissing.

En 1677, Jacques accepta à contre-cœur le mariage de sa fille Marie avec le prince protestant Guillaume III d'Orange (qui était son neveu par sa sœur Marie-Henriette Stuart) après que l'union avait été décidée par Charles II et Guillaume III[38]. Malgré ce mariage protestant, les craintes anglaises concernant la possible instauration d'une dynastie catholique furent exacerbées par le fait que Charles II et son épouse Catherine de Bragance ne parvenaient pas à avoir d'enfants. Titus Oates, un prêtre anglican défroqué, évoqua l'existence d'un prétendu « complot papiste » visant à assassiner Charles II pour permettre l'accession au trône du duc d'York[39]. Ces fausses accusations entraînèrent une vague d'hystérie anti-catholique dans le royaume.

En Angleterre, le comte de Shaftesbury, un ancien ministre et meneur des opposants aux catholiques, tenta d'évincer Jacques de l'ordre de succession[40]. Certains parlementaires proposèrent même que la couronne soit transmise au fils illégitime de Charles II, James Scott, 1^er duc de Monmouth[41]. En 1679, craignant le passage de l'Exclusion Bill, Charles II dissout le Parlement[42]. Deux nouvelles assemblées élues en 1680 et 1681 furent également dissoutes pour la même raison[43]. La crise liée à cette législation contribua au développement du système bipartisan anglais entre les whigs défendant l'Exclusion Bill et les tories qui y étaient opposés. Finalement, la succession ne fut pas modifiée mais Jacques fut convaincu de se retirer des organismes législatifs et d'accepter un rôle réduit dans le gouvernement de son frère[44].

Sur les ordres du roi, Jacques quitta l'Angleterre et se rendit à Bruxelles[45]. En 1680, il fut nommé lord haut-commissaire d'Écosse et s'installa au palais de Holyrood d'Édimbourg pour réprimer un soulèvement et superviser l'administration[46]. Jacques retourna quelque temps en Angleterre car Charles II était gravement malade et semblait proche de la mort[47]. L'hystérie anti-catholique s'apaisa mais les relations de Jacques avec de nombreux membres du Parlement anglais dont Thomas Osborne, 1^er duc de Leeds, un ancien allié, restèrent tendues et une bonne partie du Parlement lui était opposée[48].

En 1683, un complot visant à assassiner Charles II et Jacques pour lancer une révolution républicaine et restaurer un gouvernement cromwellien fut découvert[49]. Ce complot de Rye-House se retourna contre les conspirateurs car il provoqua une vague de sympathie pour le roi et son frère[50]. Plusieurs whigs influents dont Arthur Capel, 1^er comte d'Essex, et le duc de Monmouth étaient impliqués dans la conspiration[49]. Monmouth avoua sa complicité et dénonça d'autres membres mais se rétracta par la suite[49]. Essex se suicida et Monmouth et d'autres furent obligés de quitter les îles Britanniques[51]. Charles réagit au complot en accroissant la répression contre les whigs et les dissidents anglais[49]. Profitant du regain de popularité de Jacques, Charles II l'autorisa à revenir au sein du Conseil privé en 1684[52]. Si certains parlementaires continuaient de s'inquiéter de la possibilité d'un monarque catholique, la possibilité que Jacques soit écarté du trône s'était éloignée.

Portrait du roi Jacques II par Godfrey Kneller.

Charles II mourut le 6 février 1685 après s'être converti au catholicisme sur son lit de mort[53]. Comme il n'avait pas d'enfants légitimes, son frère Jacques lui succéda sous le nom de Jacques II en Angleterre et en Irlande et de Jacques VII en Écosse. Il y eut peu d'opposition à son accession au trône, et de nombreuses sources indiquent que l'opinion se réjouit de cette succession en bon ordre[54]. Jacques II voulait être rapidement couronné et la cérémonie eut lieu le 23 avril 1685 dans l'abbaye de Westminster[55]. Le nouveau Parlement, qui se rassembla en mai 1685 et reçut le nom de « Parlement loyal », était initialement favorable à Jacques, et le nouveau roi indiqua que les anciens partisans de l'Exclusion Bill seraient pardonnés s'ils acceptaient son autorité[54]. La plupart des hauts fonctionnaires de Charles II restèrent en place, même si Jacques II promut ses beaux-frères, les comtes de Clarendon et de Rochester, et s'il démit Halifax[56]. Le Parlement accorda des revenus généreux à Jacques dont tous les bénéfices des taxes douanières[57]. Jacques II se consacra plus à son rôle de roi que son frère mais il était moins prêt à accepter des compromis en cas de désaccord avec ses conseillers[58].

Peu après son accession au trône, Jacques II affronta une révolte dans le sud de l'Angleterre menée par son neveu, le duc de Monmouth, et une autre en Écosse avec Archibald Campbell, 9^e comte d'Argyll, à sa tête[59]. Argyll et Monmouth lancèrent tous deux leurs expéditions depuis les Provinces-Unies où son neveu et beau-fils Guillaume III d'Orange n'avait rien fait pour s'opposer à leurs efforts de recrutement[60]. Argyll navigua jusqu'en Écosse et recruta de nombreux membres de son propre clan des Campbell[61]. Le soulèvement fut rapidement écrasé et Argyll fut capturé le 18 juin 1685[61]. Arrivé avec moins de 300 hommes et incapable d'en recruter beaucoup plus, Argyll ne fut jamais une menace crédible pour Jacques II[62]. Il fut emprisonné à Édimbourg et le roi confirma sa condamnation à mort lors d'un précédent procès ; Argyll fut ainsi décapité le 30 juin.

La rébellion de Monmouth fut lancée conjointement avec celle d'Argyll mais elle représenta une plus grande menace contre le pouvoir de Jacques II. Monmouth s'était proclamé roi le 11 juin à Lyme Regis[63] mais ne parvint pas à rassembler suffisamment de troupes pour battre même la faible armée de métier de Jacques II[64]. Malgré une attaque nocturne surprise, les forces de Monmouth furent battues lors de la bataille de Sedgemoor[64]. Les troupes royales commandées par Louis de Duras et John Churchill chassèrent rapidement les rebelles sous-équipés[64]. Monmouth fut capturé et exécuté à la tour de Londres le 15 juillet[65]. Durant les procès qui suivirent, appelés « Assises sanglantes », les juges — dont George Jeffreys — condamnèrent de nombreux rebelles à la déportation et au servage dans les Antilles[66] et 250 autres furent exécutés[65]. Les deux révoltes furent assez facilement écrasées mais elles renforcèrent la détermination de Jacques et accrurent sa méfiance envers les Hollandais[67].

Pour se prémunir contre de futures révoltes, Jacques chercha à accroître la taille de l'armée de métier[68]. Cela alarma ses sujets, non seulement du fait des troubles que causaient les soldats en ville mais parce qu'il n'était pas dans la tradition anglaise de maintenir une armée professionnelle en temps de paix[69]. Le Parlement s'inquiéta encore plus de l'emploi des prérogatives royales par Jacques II pour autoriser des catholiques à commander plusieurs régiments sans qu'ils prêtent le serment imposé par le Test Act[68]. Le Parlement, qui lui était auparavant favorable, s'opposa à ses mesures ; Jacques ordonna sa suspension en novembre 1685 et il ne se rassembla plus jusqu'à la fin de son règne[70]. Au début de l'année 1686, deux papiers rédigés par Charles II furent trouvés dans son coffre-fort et son placard et listaient les arguments en faveur de la supériorité du catholicisme sur le protestantisme. Jacques II publia ces documents avec une déclaration défiant l'archevêque de Cantorbéry et tout le clergé anglican de réfuter les arguments de Charles II : « Donnez-moi une réponse solide à la manière d'un gentilhomme ; et qu'elle ait l'effet que vous désirez tant de me ramener au sein de votre église ». L'archevêque refusa en avançant le respect qu'il devait au roi défunt[71].

Portrait de Jacques II par Godfrey Kneller.

Jacques II défendit l'abrogation des lois pénales qui discriminaient les non-anglicans et en particulier les catholiques, mais refusa d'autoriser certaines croyances protestantes comme le presbytérianisme[72]. Jacques II envoya une lettre au Parlement écossais lors de sa première réunion en 1685 pour indiquer son souhait de nouvelles lois pénales contre les presbytériens réfractaires et se lamenta que personne ne fût prêt à défendre une telle législation. En réponse, le Parlement adopta un texte qui spécifiait que « quiconque prêcherait dans un lieu de culte avec un toit ou assisterait en tant que prêcheur ou auditeur à un rassemblement religieux en plein air s'exposerait à la mort et à la confiscation de ses biens[73] ». En mars 1686, Jacques II écrivit au Conseil privé écossais pour défendre la tolérance envers les catholiques et la persécution des covenantaires presbytériens[74]. Les conseillers répondirent qu'ils n'accorderaient une plus grande liberté aux catholiques que si des actions similaires étaient menées pour les covenantaires, et Jacques II promit de ne plus rien faire qui menacerait la foi protestante. Jacques II accepta une certaine tolérance envers les presbytériens mais inférieure à celle qu'il voulait pour les catholiques, en déclarant que la religion protestante était fausse et qu'il ne pouvait promettre ne pas réprimer une fausse religion[74].

Jacques II autorisa les catholiques à occuper les plus hautes fonctions de ses royaumes et reçut à sa cour le nonce apostolique Ferdinando d'Adda, premier représentant de Rome à Londres depuis le règne de Marie I^re[75]. Le confesseur de Jacques, le jésuite Edward Petre (en), était particulièrement haï par les protestants[76]. Alors que les catholiques représentaient environ 2 % de la population anglaise[77], le secrétaire d'État du roi, Robert Spencer, 2^e comte de Sunderland, commença à remplacer les fonctionnaires de la cour par des catholiques[78]. La purge de Sunderland toucha même les beaux-frères anglicans du roi et leurs partisans et Jacques II commença à perdre la confiance de beaucoup de ses soutiens anglicans[78]. En mai 1686, Jacques II chercha à obtenir un jugement de la part des tribunaux anglais qui l'autoriserait à passer outre les décisions du Parlement. Il limogea les juges qui s'opposaient à lui sur ce sujet ainsi que l'avocat général Heneage Finch[79]. Lors du jugement Godden v. Hales[80], onze des douze juges se prononcèrent en faveur de l'autorité du roi[81].

En 1687, Jacques II délivra la Déclaration d'indulgence (en) qui abrogeait les lois discriminant les catholiques et les dissidents protestants[82]. Il essaya de rassembler des soutiens pour cette politique de tolérance en réalisant une tournée dans l'Ouest de l'Angleterre à l'été 1687. Il donna un discours à Chester dans lequel il déclara « Supposez… qu'il y ait une loi qui ordonnerait l'emprisonnement de toutes les personnes noires, elle serait déraisonnable et nous avons aussi peu de raisons de nous quereller avec des hommes qui ont des d'opinions [religieuses] différentes qu'avec ceux qui ont un teint différent[83] ». Dans le même temps, Jacques II utilisa son autorité royale pour accorder une plus grande tolérance envers les catholiques écossais et dans une moindre mesure aux presbytériens[84].

Pièce à l'effigie de Jacques II, 1686.

En 1688, Jacques II ordonna que la Déclaration soit lue dans toutes les églises anglicanes, ce qui ulcéra encore plus les évêques anglicans[85]. Si le texte fut salué par les catholiques et les dissidents, il obligeait l'Église d'Angleterre, l'alliée traditionnelle de la monarchie, à se séparer de certains de ses privilèges[85]. Jacques II tenta également de réduire le monopole anglican sur l'éducation[86] et à l'université d'Oxford, il autorisa des catholiques à tenir des fonctions importantes au Christ Church et à l'University College, deux des plus importantes facultés de la ville. Il tenta de forcer les membres directeurs du Magdalen College à élire Anthony Farmer (en), un homme à la mauvaise réputation et considéré comme secrètement catholique[87], à la présidence du comité de direction en violation du droit des membres à choisir un candidat de leur choix[86].

En 1687, Jacques II se prépara à remplir le Parlement avec des partisans afin d'abroger le Test Act et les lois pénales. Le roi était convaincu qu'il avait le soutien des dissidents, et il lança une vaste purge des hauts-fonctionnaires royaux opposés à son plan[88]. En octobre, il ordonna aux lords lieutenants des provinces de soumettre trois questions à tous les membres de la Commission of Peace : accepteraient-ils l'abrogation du Test Act et des lois pénales ; soutiendraient-ils les candidats qui le feraient et accepteraient-ils la Déclaration d'indulgence. Durant les trois premiers mois de 1688, tous ceux qui avaient donné des réponses négatives furent limogés et remplacés par des partisans pour sécuriser les nominations parlementaires[89]. Finalement, le 24 août 1688, Jacques II ordonna l'organisation d'une élection législative[90]. Néanmoins, après avoir réalisé en octobre que Guillaume III d'Orange allait débarquer en Angleterre et pour apaiser les tensions, il annula ces ordres et écrivit aux lords lieutenants pour leur demander d'enquêter sur les abus commis durant la préparation de l'élection[91].

Le neveu et gendre de Jacques II, Guillaume III d'Orange, fut invité en Angleterre pour « sauver la religion protestante ».

Lorsque Jacques II ordonna en avril 1688 aux évêques anglicans de lire la Déclaration d'indulgence dans leurs églises[92], sept d'entre eux dont l'archevêque de Cantorbéry, William Sancroft, soumirent une pétition demandant au roi de réévaluer sa politique religieuse ; ils furent arrêtés et jugés pour sédition[93]. Les inquiétudes de l'opinion publique s'accrurent quand la reine Marie donna naissance à un fils, Jacques François Stuart, le 10 juin 1688[94]. Aussi longtemps que les seuls successeurs possibles de Jacques II étaient ses deux filles protestantes, les anglicans pouvaient croire que sa politique pro-catholique ne serait que temporaire mais quand la naissance du prince ouvrit la possibilité d'une dynastie catholique, ils furent obligés de reconsidérer leur position[95]. Plusieurs anglicans influents avancèrent que l'enfant était illégitime et avait été amené dans la chambre de la reine dans une bassinoire[96]. Ils étaient déjà entrés en contact avec Guillaume III d'Orange après l'annonce de la grossesse de la reine et la naissance de Jacques Stuart renforça leurs convictions[97].

Le 30 juin 1688, un groupe de sept nobles protestants invita le prince d'Orange à venir en Angleterre avec une armée[98]. En septembre, il était devenu clair que Guillaume III avait l'intention de débarquer dans les îles Britanniques[99]. Considérant que sa propre armée serait suffisante et craignant les réactions anglaises, Jacques II refusa les propositions d'aide du roi de France Louis XIV[99]. Lorsque Guillaume III débarqua le 5 novembre 1688 à Brixham, de nombreux officiers protestants dont John Churchill firent défection et rejoignirent l'envahisseur, de même que la propre fille de Jacques II, Anne[100]. Le roi, soucieux de ne pas faire de victimes, refusa d'attaquer l'armée d'invasion malgré la supériorité numérique de son armée[101]. Le 11 décembre, il tenta de rejoindre la France après avoir jeté le grand sceau d'Angleterre dans la Tamise[102]^,[103]. Il fut arrêté dans le Kent quelques jours plus tard et placé en détention. N'ayant aucun désir d'en faire un martyr, Guillaume III le laissa s'échapper le 23 décembre[102]. Jacques II fut accueilli par son cousin et allié, Louis XIV de France, qui l'autorisa à résider avec sa cour de "Jacobites" au château de Saint-Germain-en-Laye et lui alloua une pension.

Guillaume III convoqua un Parlement pour décider de la manière de gérer l'absence de Jacques II. Si le Parlement refusa de le déposer, il déclara qu'en s'étant réfugié en France et en ayant jeté le grand sceau dans la Tamise, Jacques II avait de fait abdiqué ; par conséquent le trône était devenu vacant[104] et les parlementaires confièrent la couronne à la fille de Jacques, Marie, qui gouverna conjointement avec Guillaume III d'Orange sous les noms de Marie II et de Guillaume III. Le 11 avril 1689, le Parlement d'Écosse déclara que Jacques II avait abandonné le trône[105]^,[106]. Le Parlement anglais adopta la Déclaration des droits qui condamnait Jacques II pour abus de pouvoir. Les accusations concernaient la suspension des Test Acts, le procès des sept évêques pour avoir simplement pétitionné la couronne, la mise en place d'une armée de métier et la condamnation à des châtiments cruels[107]. La Déclaration spécifiait également qu'aucun catholique ne pourrait devenir roi d'Angleterre et qu'aucun roi d'Angleterre ne pourrait épouser une catholique[108]. Ainsi une forme de sectarisme religieux permettait-il l'accès de souverains étrangers au trône d'Angleterre.

Avec le soutien de troupes françaises, Jacques débarqua en Irlande en mars 1689[109]. Le Parlement irlandais ne suivit pas l'exemple du Parlement anglais ; il déclara que Jacques était resté roi et il adopta une loi qualifiant de traîtres ceux qui avaient rallié Guillaume III[110]. Sous la pression de Jacques, le Parlement irlandais vota une loi accordant la liberté de religion à tous les catholiques et protestants irlandais[111]. Jacques s'efforça de lever des troupes en Irlande mais fut finalement battu lors de la bataille de la Boyne le 1^er juillet 1690 par une armée menée personnellement par Guillaume III[112]. Le conflit se termine par la signature du Traité de Limerick le 13 octobre 1691 (3 octobre dans le calendrier julien). Jacques se réfugia à nouveau en France et ne revint plus jamais dans ses anciens royaumes[112].

Le château de Saint-Germain-en-Laye où résida Jacques durant son exil en France.

En France, Jacques fut autorisé à habiter dans la résidence royale du château de Saint-Germain-en-Laye[113]. Son épouse et certains partisans le suivirent et presque tous étaient catholiques[114]. Il eut un dernier enfant avec Marie de Modène, Louise Marie Thérèse Stuart, en 1692[115]. Certains partisans anglais tentèrent de restaurer Jacques en projetant d'assassiner Guillaume III en 1696 mais le complot échoua, et le procès et les réactions qui s'ensuivirent réduisirent la popularité de leur cause[116]. Jacques refusa la proposition de Louis XIV de le faire élire roi de Pologne la même année car il craignait que cela ne l'empêche de redevenir roi d'Angleterre. En septembre 1697, Louis XIV signa le traité de Ryswick mettant un terme à la guerre de la Ligue d'Augsbourg à laquelle participaient entre autres la France, l'Angleterre et les Provinces-Unies. Dans l'une des clauses, le roi de France reconnaissait la légitimité de Guillaume III sur le trône d'Angleterre et il retira une grande partie de son soutien à Jacques[117].

Durant ses dernières années, Jacques vécut comme un pénitent austère[118]. Il rédigea un mémorandum pour son fils le conseillant sur la manière de gouverner l'Angleterre, en soulignant le fait que les catholiques devraient contrôler l'un des secrétariats d'État, un des commissariats au Trésor, le secrétariat à la Guerre et la majorité des postes d'officiers dans l'armée[119].

Le fils de Jacques II, Jacques François Édouard, était appelé Jacques III et Jacques VIII par ses partisans et le « Vieux Prétendant » par ses adversaires.

Jacques mourut d'une hémorragie cérébrale le 16 septembre 1701 à Saint-Germain-en-Laye[120]^,[121]. Son corps fut exposé dans un cercueil dans la chapelle Saint-Edmond de l'église bénédictine de la rue Saint-Jacques de Paris et l'oraison funèbre fut réalisée par Henri-Emmanuel de Roquette[120]. Jacques ne fut pas enterré mais placé dans l'une des chapelles latérales. Des bougies furent laissées allumées autour de son cercueil jusqu'à la Révolution française. En 1734, l'archevêque de Paris chercha des témoignages en vue d'une canonisation de Jacques mais aucune procédure ne fut lancée[120].

Durant la Révolution française, la tombe de Jacques fut pillée[122]. Comme beaucoup d'autres églises de Paris, l'église des Bénédictins anglais a été profanée et vandalisée pendant la Révolution française. Selon un texte de Jules Janin, écrit en 1844, les restes de la princesse Louise Marie et de son père, le roi Jacques II, reposent depuis à l'hôpital militaire du Val-de-Grâce[123].

Au moment de sa mort, il était le dernier enfant de Charles I^er et de la reine Henriette-Marie.

La plus jeune fille de Jacques II, Anne, monta sur le trône à la mort de Guillaume III en 1702. L'Acte d'établissement de 1701 spécifiait que si la ligne de succession établie par la Déclaration des droits s'épuisait, la couronne serait transmise à sa cousine allemande Sophie de Hanovre et à ses héritiers protestants[124]. Sophie était la petite-fille de Jacques I^er d'Angleterre par sa fille aînée Élisabeth Stuart, la sœur du roi Charles I^er. Ainsi quand Anne mourut en août 1714, deux mois après la mort de Sophie, la couronne fut transmise à son fils aîné George de Hanovre qui monta sur le trône sous le nom de George I^er[124].

Le fils de Jacques II, Jacques François Édouard, fut reconnu comme roi d'Angleterre par Louis XIV à la mort de son père ; ses partisans, appelés jacobites, l'appelaient Jacques III d'Angleterre et Jacques VIII d'Écosse[125]. Il mena un soulèvement en Écosse en 1715 peu après l'accession au trône de George I^er, mais il fut battu[126]. Il se réfugia alors en Lorraine puis en terre papale, en Avignon, avant de se rendre à Urbino puis à Rome où il décèdera. Les jacobites se révoltèrent à nouveau en 1745 sous le commandement de Charles Édouard Stuart, le petit-fils de Jacques II, et furent également défaits[127]. Depuis lors, il n'y eut pas d'autres véritables tentatives pour restaurer la dynastie Stuart. Les revendications de Charles furent ensuite défendues par son frère cadet Henri Benoît Stuart, le doyen du Collège des cardinaux de l'Église catholique[128]. Henri fut le dernier descendant légitime de Jacques II et aucun de ses proches n'a publiquement revendiqué le trône depuis sa mort en 1807[129].