Rouille (maladie)

Les rouilles sont des maladies cryptogamiques des végétaux supérieurs. Les agents pathogènes responsables en sont des champignons basidiomycètes parasites biotrophes, de l'ordre des Pucciniales (anciennement Uredinales) (la plupart des rouilles). Elles se manifestent par des macules foliaires ou des sortes de pustules apparaissant sur les feuilles.

Pour les articles homonymes, voir Rouille.

rouille
Nom vulgaire ou nom vernaculaire ambigu :
l'appellation « rouille » s'applique en français à plusieurs taxons distincts.
Puccinia recondita
sur feuille de blé (Triticum aestivum)

Taxons concernés

Plusieurs phylums sont concernés : Voir texte

Certaines rouilles sont dues à des Oomycota de l'ordre des Peronosporales (rouille blanche due à Albugo).

Histoire

Les rouilles affectent l'agriculture probablement depuis que l'homme a commencé à tenter de dompter les plantes pour les cultiver, en particulier les céréales telles que le blé et l'orge[1].

Des preuves archéologiques montrent que les cultures de céréales galloromaines étaient constamment touchées par des rouilles et mildious.
Au IVe siècle, les Romains sacrifiaient des bovins roux, des renards et des chiens au dieu Robigus en espérant qu'il éloigne les épidémies de rouilles de céréale des cultures[1].

Ces pathogènes fongiques sont mieux connus et l'on commence à comprendre comment ils peuvent contourner le système immunitaire de la plante via la sécrétion de petites protéines dites « effectrices ». On espère que mieux connaitre ces effecteurs et leurs mécanismes permettra de mieux anticiper la propagation mondiale des rouilles du blé[1] et leur adaptation aux pesticides.

Biologie

Rouille noire du blé : les divers stades.

Les rouilles sont provoquées par des champignons produisant en abondance des spores de 5 à 10 µm de diamètre en moyenne, de couleur claire, hyalines le plus souvent, jaune orangées, légèrement verdâtres ou brunâtres (couleurs caractéristiques à l’origine de la dénomination de ces maladies), parfois mélanisées à des degrés variables, surtout chez les spores de résistance, la mélanine qui indure leur paroi ayant des propriétés antilytiques qui leur permet de passer la mauvaise saison[2].

La plupart des spores sont éjectées dans l'air (autochorie) dans le but de les éloigner « de la colonie mère et de favoriser la dispersion en traversant la zone calme laminaire (quelques millimètres), qui entoure la surface de tout objet, pour tomber dans la zone turbulente ». Les autres facteurs de dispersion sont la distance ; la déposition : les petites spores sont dispersées par le vent (anémochorie, mode de dispersion le plus fréquent, les spores pouvant parcourir des milliers kilomètres) ou les gouttes de pluie (effet splash caractéristique de l'ombrochorie (de)), les plus grosses tombent par gravitation (barochorie) ; l'impaction (en) ; potentiel d'inoculation (vitesse de la germination, abondance de spores, capacité de surmonter les compétiteurs, etc.) qui dépend des réserves nutritives contenues dans la spore[3]. La dispersion des spores par les graines de plantes est plus fréquente qu'on ne l'imagine[4], de même que celle par l'homme (anthropochorie), agent de propagation de plus en plus efficace[5].

Ces champignons phytopathogènes sont des parasites obligatoires, ne pouvant se développer que sur un végétal vivant, et dont les espèces sont hautement spécialisées, au niveau du genre, de l’espèce, ou de la sous-espèce.

Le cycle de vie de ces champignons est complexe, caractérisé par l’émission successive de plusieurs sortes de spores naissant dans les organes différents.

Liste des maladies appelées « rouilles » en français

Nom de la maladie Agent pathogène code OEPP
fausse rouille du mûrierMycosphaerella mori MYCOMO
rouille américaine du groseillierEndocronartium pini ENDCPI
rouille américaine du sojaPhakopsora meibomiae PHAKME
rouille asiatique du groseillierCronartium ribicola CRONRI
rouille asiatique du sojaPhakopsora pachyrhiziPHAKPA
rouille blanche de la patate douceAlbugo ipomoeae-pandurataeALBUIP
rouille blanche de la scorsonèreAlbugo tragopogonis ALBUTR
rouille blanche de l'épinardAlbugo occidentalisALBUOC
rouille blanche des composéesAlbugo tragopogonis ALBUTR
rouille blanche des crucifèresAlbugo candida ALBUCA
rouille blanche du chrysanthèmePuccinia horianaPUCCHN
rouille blanche du salsifisAlbugo tragopogonis ALBUTR
rouille blanche du tournesolAlbugo tragopogonis ALBUTR
rouille brunePuccinia reconditaPUCCRE
rouille brune de l'orgePuccinia hordeiPUCCHD
rouille brune du bléPuccinia triticina PUCCRT
rouille brune du chrysanthèmePuccinia chrysanthemi PUCCCH
rouille brune du haricotUromyces appendiculatus UROMAP
rouille brune du seiglePuccinia recondita f. sp. reconditaPUCCRR
rouille commune de la pomme de terrePuccinia pittierianaPUCCPT
rouille commune du chrysanthèmePuccinia chrysanthemi PUCCCH
rouille commune du trèfleUromyces trifolii UROMTR
rouille courbeuse des rameaux du pinMelampsora pinitorqua MELMPP
rouille couronnée de la bourdainePuccinia coronata f. sp. calamagrostidisPUCCCM
rouille couronnée de la fétuquePuccinia coronata f. sp. festucaePUCCCF
rouille couronnée de l'agrostidePuccinia coronata f. sp. agrostidisPUCCCG
rouille couronnée de l'avoinePuccinia coronata PUCCCO
rouille couronnée de l'avoinePuccinia coronata f. sp. avenae PUCCCA
rouille couronnée des graminéesPuccinia coronata PUCCCO
rouille couronnée du ray-grassPuccinia coronata f. sp. lolii PUCCCL
rouille couronnée du vulpinPuccinia coronata f. sp. alopecuri PUCCCC
rouille crustacée du framboisierPucciniastrum americanumPUCIAM
rouille de la betteraveUromyces betae UROMBE
rouille de la bruyèreThekopsora fischeri THEKFI
rouille de la canne à sucrePuccinia kuehnii PUCCKU
rouille de la canne à sucrePuccinia melanocephala PUCCML
rouille de la chicoréePuccinia hieraciiPUCCHI
rouille de la cinéraireColeosporium tussilaginis f. sp. senecionisCOLSSE
rouille de la crotalaireUromyces decoratus UROMDE
rouille de la fétuqueUromyces dactylidisUROMDA
rouille de la feuille du caféierHemileia vastatrix HEMIVA
rouille de la fèveUromyces viciae-fabaeUROMVF
rouille de la laituePuccinia hieraciiPUCCHI
rouille de la luzerneUromyces striatus UROMST
rouille de la menthePuccinia menthae PUCCME
rouille de la pivoineCronartium flaccidum CRONFL
rouille de la raiponceColeosporium tussilaginis f. sp. campanulae-rapunculoidisCOLSCP
rouille de la rhubarbePuccinia phragmitis PUCCPH
rouille de la scabieusePuccinia verruca PUCCVE
rouille de la tigePuccinia graminisPUCCGR
rouille de la tige de l'airellePucciniastrum goeppertianumPUCIGO
rouille de la tige de l'avoinePuccinia graminis f. sp. avenaePUCCGA
rouille de la tige de l'orgePuccinia graminis f. sp. secalisPUCCGS
rouille de la tige du bléPuccinia graminis f. sp. tritici PUCCGT
rouille de la tige du milPuccinia graminis subsp. graminicolaPUCCGM
rouille de la tige du seiglePuccinia graminis f. sp. secalisPUCCGS
rouille de la vignePhakopsora euvitisPHLLAM
rouille de l'abricotierTranzschelia pruni-spinosaeTRANPS
rouille de l'ailPuccinia alliiPUCCAL
rouille de l'aloèsUromyces aloesUROMAL
rouille de l'amandierMelampsora amygdalinaeMELMAM
rouille de l'amandierTranzschelia pruni-spinosaeTRANPS
rouille de l'anémone pulsatilleColeosporium tussilaginis f. sp. pulsatillaeCOLSPU
rouille de l'arachidePuccinia arachidisPUCCAR
rouille de l'aspergePuccinia asparagi[11]PUCCAS
rouille de l'asterPuccinia asterisPUCCAT
rouille de l'aubépineGymnosporangium clavariiforme GYMNCF
rouille de l'aubépineGymnosporangium confusumGYMNCO
rouille de l'aubépineGymnosporangium globosum GYMNGL
rouille de l'auberginePuccinia substriataPUCCSU
rouille de l'endivePuccinia hieraciiPUCCHI
rouille de l'épilobe du feu sur sapinPucciniastrum epilobii f. sp. abieti-chamaenerii PUCIEA
rouille de l'hortensiaPucciniastrum hydrangeaePUCIHY
rouille de l'œilletPuccinia arenariae PUCCAE
rouille de l'œilletUromyces dianthiUROMDI
rouille de l'Oregon des rosacéesGymnosporangium juniperinumGYMNJU
rouille de Plowright du poirierGymnosporangium confusumGYMNCO
rouille de Virginie du poirierGymnosporangium globosum GYMNGL
rouille de Virginie du pommierGymnosporangium juniperi-virginianae GYMNJV
rouille des aiguilles de l'épicéaChrysomyxa abietis CHMYAB
rouille des aiguilles de l'épicéaChrysomyxa weirii CHMYWE
rouille des alliacées sur peuplierMelampsora allii-populinaMELMAP
rouille des arbres fruitiers à noyauTranzschelia pruni-spinosae TRANPS
rouille des euphorbiacéesMelampsora riciniMELMRI
rouille des feuilles de bouleauMelampsoridium betulinum MELDBE
rouille des feuilles du bléPuccinia triticina PUCCRT
rouille des feuilles du cotonnierPuccinia schedonnardi PUCCSC
rouille des feuilles du mûrierMycosphaerella mori MYCOMO
rouille des feuilles du peuplierMelampsora medusaeMELMME
rouille des feuilles du seiglePuccinia recondita f. sp. reconditaPUCCRR
rouille des irisPuccinia iridisPUCCIR
rouille des malvacéesPuccinia malvacearum [12]PUCCMA
rouille des nervures du trèfleUromyces striatus UROMST
rouille des ombellifèresPuccinia pimpinellaePUCCPI
rouille des rameaux du pinCronartium filamentosum CRONFI
rouille des rosacéesPhragmidium tuberculatum PHRATU
rouille du balisierPuccinia thaliaePUCCTH
rouille du bananierUromyces musaeUROMMU
rouille du buisPuccinia buxi
rouille du caféierHemileia vastatrix HEMIVA
rouille du carthamePuccinia carthamiPUCCCR
rouille du carviPuccinia cari-bistortae PUCCCB
rouille du céleriPuccinia apii PUCCAP
rouille du cerisierPuccinia cerasi PUCCCE
rouille du cerisierPucciniastrum areolatum PUCIAR
rouille du chrysanthèmePuccinia chrysanthemi [12]PUCCCH
rouille du cognassierGymnosporangium clavipesGYMNCL
rouille du colletPuccinia coronata PUCCCO
rouille du cotonnierPhakopsora gossypii PHAKGO
rouille du cotonnierPuccinia cacabataPUCCSK
rouille du crocusPuccinia croci PUCCCI
rouille du crocusUromyces croci UROMCR
rouille du cytiseUromyces laburni UROMLA
rouille du cytiseUromyces laburni f. sp. genistae-tinctoriae UROMLG
rouille du dactyleUromyces dactylidisUROMDA
rouille du doliqueUromyces dolicholi UROMDO
rouille du figuierCerotelium fici KUEHFI
rouille du framboisierPhragmidium rubi-idaeiPHRARU
rouille du fuchsiaPucciniastrum epilobii PUCIEP
rouille du fuchsiaPucciniastrum epilobii f. sp. palustrisPUCIEL
rouille du fusain sur saule marsaultMelampsora epitea f. sp. euonymi-capraearum MELMEP
rouille du genêt d'AngleterreUromyces laburni f. sp. anglicaeUROMLN
rouille du genêt des teinturiersUromyces laburni f. sp. genistae-tinctoriaeUROMLG
rouille du genévrierGymnosporangium juniperi-virginianae GYMNJV
rouille du géraniumUromyces geranii UROMGE
rouille du glaïeulPuccinia gladioli PUCCGL
rouille du glaïeulUromyces gladioli UROMGL
rouille du glaïeulUromyces transversalis [12]UROMTV
rouille du goyavierPuccinia psidiiPUCCPS
rouille du grand chiendentPuccinia cynodontis PUCCCY
rouille du groseillierPuccinia ribisPUCCRI
rouille du groseillier sur l'osierMelampsora ribesii-viminalisMELMRV
rouille du haricotUromyces appendiculatus UROMAP
rouille du laiteronColeosporium tussilaginis f. sp. sonchi COLSSO
rouille du linMelampsora lini MELMLI
rouille du linMelampsora lini var. liniperdaMELMLL
rouille du mahoniaUropyxis mirabilissimaCUMMMI
rouille du maïsPuccinia polysoraPUCCPY
rouille du maïsPuccinia sorghi PUCCSO
rouille du maniocUromyces manihotisUROMMA
rouille du mélèze sur peuplierMelampsora larici-populinaMELMLP
rouille du milletPuccinia substriataPUCCSU
rouille du muflier des jardinsPuccinia antirrhini [12]PUCCAN
rouille du mûrierCerotelium fici KUEHFI
rouille du néflierGymnosporangium confusumGYMNCO
rouille du pâturinPuccinia poarumPUCCPR
rouille du pâturinUromyces dactylidis var. poaeUROMDP
rouille du pêcherPuccinia cerasi PUCCCE
rouille du pêcherTranzschelia discolor TRANDI
rouille du pêcherTranzschelia pruni-spinosae TRANPS
rouille du pélargoniumPuccinia pelargonii-zonalisPUCCPZ
rouille du pélargonium zonalPuccinia pelargonii-zonalisPUCCPZ
rouille du persilPuccinia nitida PUCCNI
rouille du persilPuccinia rubiginosa PUCCRU
rouille du peuplierMelampsora larici-populinaMELMLP
rouille du peuplierMelampsora populnea MELMPO
rouille du peuplier sur la mercurialeMelampsora rostrupii MELMPR
rouille du peuplier sur le mélèzeMelampsora larici-tremulae MELMPL
rouille du pinCronartium comandraeCRONCO
rouille du pin à cinq feuillesCronartium ribicola CRONRI
rouille du pin du LordCronartium ribicola CRONRI
rouille du pin WeymouthCronartium ribicola CRONRI
rouille du pistachierPileolaria terebinthi UROMTE
rouille du poireauPuccinia porri PUCCPO
rouille du poirier japonaisGymnosporangium asiaticumGYMNAS
rouille du poirier japonaisGymnosporangium haraeanum GYMNHA
rouille du poisUromyces pisi UROMPS
rouille du poisUromyces viciae-fabaeUROMVF
rouille du pois à vacheUromyces vignaeUROMVI
rouille du pois cajanUredo cajani UREDCA
rouille du pois-chicheUromyces ciceris-arietiniUROMCA
rouille du prunierTranzschelia pruni-spinosae TRANPS
rouille du rhododendronChrysomyxa ledi var. rhododendriCHMYRH
rouille du ricinMelampsora riciniMELMRI
rouille du roseauPuccinia phragmitis PUCCPH
rouille du rosierPhragmidium mucronatum PHRAMU
rouille du salsifisPuccinia jackyana PUCCJA
rouille du sapinPucciniastrum goeppertianumPUCIGO
rouille du sarrasinColeosporium tussilaginis f. sp. melampyriCOLSME
rouille du saule argentéMelampsora salicis-albae MELMSA
rouille du sojaPhakopsora pachyrhiziPHAKPA
rouille du sorghoPuccinia purpureaPUCCPU
rouille du teckOlivea tectonaeOLIVTE
rouille du tournesolPuccinia helianthiPUCCHE
rouille du trèfleUromyces trifolii UROMTR
rouille écidienne du groseillierPuccinia caricina var. pringsheimiana PUCCCP
rouille écidienne du groseillierPuccinia ribesii-caricisPUCCRC
rouille en colonnettes du cassissierCronartium ribicola CRONRI
rouille européenne du poirierGymnosporangium sabinaeGYMNFU
rouille européenne du pommierGymnosporangium juniperinumGYMNJU
rouille européenne du pommierGymnosporangium tremelloidesGYMNTR
rouille grillagée du poirierGymnosporangium sabinae[13]GYMNFU
rouille grillagée du pommierGymnosporangium juniperinumGYMNJU
rouille grillagée du pommierGymnosporangium tremelloidesGYMNTR
rouille grise de la feuille du caféierHemileia coffeicola HEMICO
rouille japonaise du chrysanthèmePuccinia horianaPUCCHN
rouille japonaise du pommierGymnosporangium yamadaeGYMNYA
rouille jaune de l'orgePuccinia striiformis PUCCST
rouille jaune des graminéesPuccinia striiformis PUCCST
rouille jaune du bléPuccinia striiformis PUCCST
rouille jaune du dactylePuccinia striiformis var. dactylidis PUCCSD
rouille jaune du framboisierPhragmidium rubi-idaeiPHRARU
rouille jaune du pâturinPuccinia brachypodii var. poae-nemoralisPUCCBP
rouille jaune du pâturinPuccinia striiformis PUCCST
rouille jaune du seiglePuccinia striiformis PUCCST
rouille jaune striée de l'orgePuccinia striiformis PUCCST
rouille jaune striée du bléPuccinia striiformis PUCCST
rouille jaune tardive du framboisierPucciniastrum americanumPUCIAM
rouille linéaire des céréalesPuccinia graminisPUCCGR
rouille naine de l'orgePuccinia hordeiPUCCHD
rouille naine des feuilles de l'orgePuccinia hordeiPUCCHD
rouille noirePuccinia graminis[14] (Ug99)PUCCGR
rouille noire de la fléolePuccinia graminis subsp. graminicolaPUCCGM
rouille noire de l'agrostidePuccinia graminis subsp. graminicolaPUCCGM
rouille noire de l'avoinePuccinia graminis f. sp. avenaePUCCGA
rouille noire des céréalesPuccinia graminisPUCCGR
rouille noire des roncesPhragmidium bulbosumPHRABU
rouille noire des roncesPhragmidium violaceum PHRAVI
rouille noire du bléPuccinia graminis f. sp. tritici PUCCGT
rouille noire du chrysanthèmePuccinia chrysanthemi PUCCCH
rouille noire du dactylePuccinia graminis subsp. graminicolaPUCCGM
rouille noire du groseillierPuccinia ribisPUCCRI
rouille noire du seiglePuccinia graminis f. sp. secalisPUCCGS
rouille noire européenne du framboisierPhragmidium rubi-idaeiPHRARU
rouille orangée de la patate douceColeosporium ipomoeaeCOLSIP
rouille orangée du framboisierGymnoconia interstitialis GYMCIN
rouille pâle des roncesKuehneola uredinisKUEHUR
rouille péruvienne de la pomme de terreAecidium cantenseAECICT
rouille poudreuse du caféierHemileia coffeicola HEMICO
rouille tordeuse des rameaux du pinMelampsora pinitorqua MELMPP
rouille tropicale du maïsPhysopella zeaePHLLZE
rouille vésiculaire des aiguillesMelampsorella caryophyllacearumMELRCA
rouille vésiculaire des aiguilles de l'épicéaChrysomyxa ledi var. rhododendriCHMYRH
rouille vésiculeuse de l'écorce du pinCronartium flaccidumCRONFL
rouille vésiculeuse des aiguilles du pinColeosporium tussilaginisCOLSTU
rouille vésiculeuse du chêneCronartium fusiforme CRONFU
rouille vésiculeuse du pinCronartium fusiforme CRONFU
rouille vésiculeuse du pin blancCronartium ribicola CRONRI

Traitement

Les moyens de lutte contre les rouilles furent longtemps cantonnés à la tentative d'éradication des hôtes écidiens.

Traitements naturels

Le traitement classique consiste à supprimer puis brûler les feuilles atteintes et à pulvériser préventivement de la bouillie bordelaise ou avec une décoction de prêle, qui est aussi curative et utilisée en potager bio[15],[16],[17].

La méthode de lutte en agriculture biologique consiste à planter des cultivars résistants ou, à défaut, d'augmenter la distance entre les rangées de plants et d'orienter celles-ci pour que l'humidité stagnante soit limitée par une exposition judicieuse aux vents dominants[11].

Traitements phytosanitaires

L'arsenal phytopharmaceutique actuel est plus efficace avec les molécules[18]:

Note: Certains de ces produits ne sont plus autorisés à la vente en Europe, et ne peuvent l'être que sur certaines espèces cultivées.

Notes et références

  1. Matthew J. Moscou, H. Peter van Esse (2017), The quest for durable resistance Science 22 Dec 2017: Vol. 358, Issue 6370, pp. 1541-1542 DOI: 10.1126/science.aar4797 (résumé
  2. Roger Corbaz, Principes de phytopathologie et de lutte contre les maladies des plantes, Presses polytechniques et universitaires romandes, (lire en ligne), p. 21
  3. Roger Corbaz, op. cit., p. 23-29
  4. Roger Corbaz, op. cit., p. 31
  5. Roger Corbaz, op. cit., p. 33
  6. Cette défense se traduit par l'accumulation de tannins rouges toxiques (des anthocyanes à l'origine des macules foliaires) dans les vacuoles des cellules colonisées, mais elle reste sans effet. En effet, le suçoir de ce parasite pompe des petites molécules de la cellule, sans altérer sa membrane et sa vacuole, restées intactes, les tannins n'étant ainsi pas libérés. Marc-André Selosse, Les Goûts et les couleurs du monde. Une histoire naturelle des tannins, de l'écologie à la santé, Actes Sud Nature, , p. 87
  7. Elles sont noires en automne (processus de mélanisation des spores de résistance).
  8. Petites cavités thallines dans lesquelles des hyphes particulières, produisent pas mitoses successives, des spermaties (les « spores » ayant une grande analogie avec ces gamètes) expulsées à maturité par l'ostiole sommital.
  9. Surinvestissement dans la reproduction en raison de la discontinuité dans l'espace et dans le temps des milieux que représentent l'hôte de ce parasite. Claude Combes, Interactions durables. Écologie et évolution du parasitisme, Masson, , p. 19
  10. Ce halo peut être la « graisse à halo » (allusion à son aspect huileux), conséquence d'une action toxique de bactéries telles que Pseudomonas syringae qui, en produisant la phaséolotoxine (phytotoxine qui est un inhibiteur enzymatique), provoquent des symptômes semblables à ceux du feu bactérien (centre nécrosé et halo chlorotique). Charles-Marie Messiaen, Dominique Blancard, Francis Rouxel, Les maladies des plantes maraîchères, éditions Quæa, , p. 268-269
  11. La production des asperges biologiques
  12. Jacques Barnouin, Ivan Sache et al. (préf. Marion Guillou), Les maladies émergentes : Épidémiologie chez le végétal, l'animal et l'homme, Versailles, Quæ, coll. « Synthèses », , 444 p. (ISBN 978-2-7592-0510-3, ISSN 1777-4624, lire en ligne), I. Facettes et complexité de l'émergence, chap. 2 (« Les maladies émergentes affectant les végétaux »), p. 25, accès libre.
  13. La rouille grillagée du poirier, une maladie disgracieuse
  14. Rouille noire des Graminées
  15. Quels traitements naturels utiliser pour un potager bio ? sur le site Bioaddict, consulté en novembre 2011
  16. Guide Clause, 13° édition, 1952, p. 369
  17. Rustica 18/12/2011
  18. Index phytosanitaire ACTA des années 1977, 1985 & 2006 ; Association de coordination technique agricole, Paris

Voir aussi

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