Microbiote buccal humain

L'environnement buccal (température, humidité, pH, présence constante de salive et de nutriment et de résidus muqueux y sélectionne des populations adaptées (et parfois pathogènes) de micro-organismes[13].

Chez une personne jeune ou adulte en bonne santé et avec une alimentation saine, les microbes résidents de la bouche adhèrent aux muqueuses, dents (y compris émail[14] et certains implants artificiels[15]^,[16]) et gencives pour résister au lessivage par la salive, mais sont ensuite pour la plupart détruits par leur passage dans l'estomac (par la sécrétion d'acide chlorhydrique)[13]^,[17].

Le flux salivaire[18] et les conditions locorégionales de l'intérieur de la bouche varient[19] et elles varient aussi selon l'heure de la journée et le fait de dormir ou non bouche ouverte. De l'enfance à la vieillesse, les surfaces respectives des différentes zones de la cavité buccale (ainsi que leur qualité) dont celles des dents évoluent au cours de la vie[20], en interagissant avec la microbiologie de la bouche, selon des facteurs que la science explore[21].

Via le larynx, nombre de ces bactéries peuvent migrer vers le tractus respiratoire où un mucus est chargé de les repousser.

Une partie de ce microbiote est impliqué ou co-impliqué dans la production de facteurs (cellules γδ T ou γδT17) qui favorise les maladies auto-immunes comme le psoriasis, l'arthrite, mais aussi le cancer du colon, des poumons et du sein[22].

Le microbiote buccal occupe plusieurs niches écologiques[23] :

• la salive ;
• le plancher de la bouche ;
• la langue et notamment sa face dorsale hérissée de papilles ;
• les versants internes des lèvres et des joues ;
• les gencives et le palais, recouverts d'un épithélium kératinisé ;
• les dépressions à la surface des dents ;
• les sillons à la base des dents ;
• chez l'enfant, la pseudo-poche de la dent (en cours d'éruption).

Chacune de ces niches a ses caractères physicochimiques propres (acidité, teneur en oxygène, voire température), ce qui induit un microbiote particulier.

Les niches écologiques du microbiote buccal sont essentiellement constituée de surfaces, mais la salive en fait aussi partie et influence considérablement ce microbiote[24]. Plus de 800 espèces de bactéries colonisent la muqueuse buccale, 1 300 se partagent la crevasse abritée qui sépare la gencive de la dent et près de 1 000 constituent la plaque dentaire, biofilm plus exposé au flux salivaire [25]. La salive est un milieu riche de centaines d'espèces de bactéries, dont la concentration va de 10 à 1 000 millions de germes par millilitre, ce qui explique que lors du baiser amoureux, pas moins de 80 millions de bactéries sont échangés en une dizaine de secondes par le mélange des salives, mais l'effet est transitoire, chaque individu retrouvant rapidement la composition de son microbiote salivaire[26]^,[27].

Grâce aux progrès des outils d'analyse de la biologie moléculaire, cette niche et plus généralement les territoires dessinés dans la bouche par l'écologie buccale commencent à être mieux cartographiés (les territoires respectifs des faces et côté de la langue, les dents, gencives, intérieur des joues, glandes salivaires, etc. accueillent en effet des communautés ou consortiums de microorganismes différents[28] ;

Un très efficace système de défense (inné) de l'hôte contrôle en permanence la colonisation bactérienne et prévient l'invasion bactérienne locale des tissus.
Un équilibre dynamique existe notamment entre les bactéries de la plaque dentaire et les défenses immunitaires de l'hôte[29].

En équilibre, le biofilm bactérien produit par fermentation une acidification du milieu (en faisant fondre un petit morceau de sucre en bouche, à la douceur initiale succède une faible acidité persistante, issue de la fermentation bactérienne du sucre), vite balayée par le pouvoir tampon de la salive et la déglutition, sauf au niveau de la plaque dentaire. En cas de déséquilibre (en particulier en présence de dents fragiles en raison d'un déficit de certains nutriments in utero ou dans la prime enfance) ou en raison d'une alimentation trop riche en sucres et d'un mauvais brossage dentaire, des micro-organismes oraux se développent anormalement et causent deux grandes maladies bucco-dentaires modernes : la carie dentaire et la maladie parodontale[29]. De nombreuses études ont aussi corrélés une mauvaise hygiène buccale à la capacité du microbiote buccal à devenir pathogène et à envahir le corps en affectant par exemple la santé cardiaque ou encore la fonction cognitive[30].

C'est un matériau issu du biofilm bactérien et qui adhère fortement aux dents. Il se compose de cellules bactériennes salivaires (principalement S. mutans et S. sanguis), de résidus alimentaires, de biopolymères et d'autres produits extracellulaires sécrétés ou catalysés par des bactéries.

Sa teneur en micro-organismes soumet les dents et les tissus gingivaux à de fortes concentrations de métabolites bactériens qui entraînent des maladies buccales et dentaire. Sans brossage et éventuellement passage d'un fil dentaire entre les dents, ce biofilm se transformer en tartre dentaire qui favorise la gingivite ou la parodontite.^{[citation nécessaire]}

La plupart des espèces bactériennes trouvé dans la bouche appartiennent à des communautés microbiennes formant des biofilms, ce qui implique une capacité de communication inter-bactérienne. Le contact cellule-cellule est médié par des protéines spécifiques (adhésines) et souvent, comme par exemple dans les cas d’agrégation inter-espèces par des récepteurs polysaccharides complémentaires)[41].

Une autre forme de communication intercellulaire passe par des molécules de signalisation cellulaire, que l'on classe en deux catégories : 1) celles qui sont utilisées pour les échanges et signalisations intra-espèces, et 2) celles qui permettent des communications entre espèces proches ou différentes.

Un exemple de communication intra-espèces est le quorum sensing. Des bactéries buccales se montrent capables de produire de petits peptides (Competence stimulating peptides), qui aident à la formation de biofilms monospécifiques (constitués d'une seule et même espèce). Une forme de signalisation entre espèces différentes est basée sur une molécule 4, 5-dihydroxy-2, 3-pentanédione (DPD), aussi connue comme autoinducteur-2 (Al-2)[42].

Elle est envisagée depuis longtemps contre la carie dentaire, et les protéines impliquées dans la colonisation de dents par Streptococcus mutans peuvent produire des anticorps qui inhibent le processus cariogène [43], mais de tels vaccins peinent à se développer ou être mis sur le marché.

Des espèces de bactéries habituellement associées à la flore buccale ont été trouvées dans le tube digestif, ou impliquées dans diverses pathologies respiratoires, articulaires (arthrites[44]), osseuses ou cardiaques, ainsi que dans des maladies sexuellement transmissibles (bactéries retrouvées chez les femmes souffrant de vaginose bactérienne[45]).

La recherche a mis en évidence des corrélations entre une mauvaise hygiène dentaire et la capacité du microbiote buccal à alors envahir le corps et affecter la santé cardiaque, respiratoire ou même la fonction cognitive[30].