Pathologie végétale

Exemple :

• Virus mosaïque

Le terme maladie cryptogamique est utilisé pour les maladies parasitaires causées par un ou des champignons microscopiques. Ce terme est resté même si certains des micro-organismes responsables ne sont plus classés parmi les champignons.

Feuilles de vigne atteinte par la flavescence dorée due à un phytoplasme.

Les phytoplasmes et spiroplasmes sont un genre de bactéries dépourvues de parois cellulaires, apparentées aux mycoplasmes qui sont des pathogènes pour l'homme. Ensemble, tous ces organismes forment la classe des mollicutes. Ils ont aussi tendance à avoir un génome plus petit que celui des bactéries proprement dites. Ils sont normalement transmis par des insectes suceurs de sève, qui les injectent dans le phloème des plantes où il se reproduisent.

Il existe plus de 5000 espèces de nématodes dans le sol. Beaucoup sont pathogènes. Certains provoquent des gales au niveau des racines des Solanacées. Le moyen de prévention le plus efficace en lutte biologique est l'introduction de tagètes (œillets d'Inde), qui, grâce à leurs exsudats racinaires, auraient un effet nématifuge^{[réf. nécessaire]}.

Des pratiques préventives sont possibles dans certains cas :

• éviter l’excès d’humidité par drainage ou un contrôle intelligent de l’irrigation,
• éliminer des plantes malades, les débris,
• éviter d’endommager les tissus végétaux,
• pratiquer la rotation longue,
• désinfecter les semences (hypochlorite de Na/Ca, formaldéhyde, oxychlorure de cuivre, traitement à la chaleur),
• désinfecter le matériel (hypochlorite de Na/Ca, détergents, formol),
• désinfecter le sol par traitement vapeur – solarisation,
• choisir des variétés résistantes.

C'est le recours aux fongicides de synthèse ou aux bactéricides (antibiotiques). La lutte chimique contre les maladies cryptogamiques remonte à la fin du XIX^e siècle avec la découverte de l'action du cuivre contre le mildiou de la vigne. Pour bénéficier de l'activité des sels de cuivre sans trop nuire à la culture (phytotoxicité) l'utilisation de la bouillie bordelaise (sulfate de cuivre neutralisé à la chaux) se généralisa dès le début du XX^e siècle. Rapidement apparurent des bouillies bordelaises industrialisées, c'était le début du développement de l'industrie phytosanitaire qui depuis n'a pas cessé de mettre au point de nouvelles formulations associant diverses matières actives mises au point par la recherche des grands groupes de la pharmacie pour la plupart.

Vers 1950 apparurent les premières molécules de synthèse qui permirent d'améliorer les produits disponibles. Des carbamates (zinèbe, manèbe, mancozèbe...)des phtalimides (captafol, folpel...) furent utilisés seuls ou associés à des sels de cuivre. Ces produits faciles d'emploi constituent la première génération des grandes spécialités anti-mildiou (Cuprosan, Trimiltox, Moloss sont des noms commerciaux fort connus des viticulteurs). Il fallut attendre les années 1970 pour que des matières actives nouvelles permettent de s'affranchir des contingences climatiques, elles sont pénétrantes (cymoxanil) ou systémiques (anilides, phosétyl-al). Elles permirent de développer le concept de lutte raisonnée, les traitements peuvent maintenant intervenir en fonction de l'évolution des parasites.

De nos jours, toutes les productions agricoles intensives (grandes cultures, arboriculture, cultures légumières) ont recours à des applications de fongicides pour protéger leur potentiel. Dans le cadre de systèmes de lutte raisonnée, le producteur définit un itinéraire cultural avec un objectif de rendement. Plus celui-ci est élevé, plus il faut être vigilant face au développement des maladies. La lutte raisonnée basée sur l'observation méticuleuse des cultures permet d'intervenir à bon escient avec une palette d'outils (chimiques et autres) performants, ayant, dans le cadre d'une bonne pratique agricole, un impact limité sur l'environnement, sans risque pour le consommateur (les conditions de mise en marché et d'emploi des spécialités phytosanitaires sont strictement encadrées par une règlementation rigoureuse basée sur des textes règlementaires européens et nationaux).

Pour la protection des cultures, les antibiotiques sont très peu autorisés (donc d'usage interdit) dans la plupart des pays pour les risques de sélection de gènes de résistance qui pourraient passer aux bactéries pathogènes chez l'homme. On y trouve des produits comme la Streptomycine, la Terramycine, l'Agrimycine, la Kasugamycine.

Des alternatives aux traitements chimiques sont peu à peu mises au point et arrivent sur le marché. Cette catégorie des éliciteurs-phytostimulants apporte des solutions qui ont déjà donné des résultats.

On peut volontairement introduire dans une parcelle infectée une bactérie ou un champignon inoffensif pour la plante mais qui présente des antagonismes forts avec une bactérie ou un champignon particulièrement pathogène. Par exemple on utilise Erwinia herbicola contre Erwinia amylovora

On peut aussi combiner les différentes techniques en prenant plus en compte le facteur environnemental.

Les maladies des plantes sont dues à deux séries de facteurs, qui peuvent agir conjointement :

• des facteurs liés au milieu dans lequel poussent ou évoluent les plantes et végétaux libres (phytoplancton), qui peuvent provoquer des maladies physiologiques à la suite d'agressions de facteurs physiques (acidité, UV, déshydratation, radioactivité, pollutions) ou de carences minérales du sol.
• des organismes parasites qui peuvent déterminer des maladies parasitaires d'origine végétale, cryptogamique, bactérienne, virale ou animale. Dans certains cas, plus que de maladie, il s'agit de déprédations (exemple des animaux, bactéries ou champignons phytophages). L'absence d'organismes symbiotes (bactéries, champignons, pollinisateurs..) est aussi une cause de maladies ou de mort des plantes.

Le manque d'eau induit un dessèchement, un ralentissement, et son excès peut provoquer une asphyxie radiculaire. Les problèmes sont liés au pH de l'eau, à sa température, à la salinité (salinisation) ou à sa qualité (pollution chimique ou organique, par exemple par de pathovars de la bactérie Pseudomonas).

Les constituants minéraux nécessaires à la plante peuvent être en quantité ou en disponibilité insuffisante au point de provoquer de véritables symptômes extérieurs et pas seulement une production limitée (voir : carence).

• N (azote minéral) : le manque d'azote provoque le jaunissement de la plante, et son excès peut provoquer de façon indirecte une verse sur les céréales,
• K (potassium) : « faim de potasse »,
• Mg (magnésium).
• Ca (calcium)

• Fe (fer) : une carence en fer (souvent par blocage en sol calcaire) provoque des chloroses,
• De nombreux autres oligo-éléments interviennent ainsi que les toxiques naturels ou polluants introduits par l'homme (plomb, arsenic par exemple...)

Un climat anormalement pluvieux à une saison donnée peut provoquer un déficit de lumière et un ralentissement de la croissance et de la production. Le manque de lumière comme après une forte éruption volcanique empoussiérant l'atmosphère a les mêmes effets.

Un excès de chaleur s'identifie avec un échaudage du végétal, insolation souvent liée à une diminution de l'hygrométrie provoquant un double stress pour la plante et en ville une diminution du phénomène de rosée.

Le gel a lui aussi un effet important. Il provoque des roulures, une fente des troncs et des écorces éclaté par l'eau. Le poids de la neige ou du givre provoque aussi la fracture des branches ou des tiges. Certaines bactéries présentes sur les feuilles comme pseudomonas peuvent induire la cristallisation de glace à la surface des végétaux un peu avant le 0 °C.

Les poussières et substances grasses qui encrassent les feuilles, freinent la photosynthèse tout en favorisant la colonisation de surface par des champignons ou bactéries épiphytes éventuellement pathogènes. Certaines substances véhiculées par l'atmosphère sont très nocives pour les végétaux telle que, par exemple, l'Anhydride sulfureux et de manière générale les acides émis par l'activité humaine (l'industrie, la combustion des chauffages, les gaz d'échappements des véhicules…), l'ozone, les PAN, et autres oxydants émis par l'industrie, le chauffage, les véhicules, agissant le jour et/ou la nuit. On peut citer l'effet des éruptions volcaniques émettrices de cendres fines: celles-ci recouvrent les végétaux proches et si elles ne sont pas lavées par des pluies, ceux-ci n'ont plus assez de lumière et souffrent.

Sont à prendre en compte : les effets du vent (bris, blessures, tensions...), les précipitations (pluie, neige, grêle), la foudre, la longitude, la latitude, relief, masses d'air froides, masses d'air chaudes...

• Diagnostic (pathologie végétale)
• Épidémiologie végétale
• Prévision des maladies des plantes
• Maladie végétale émergente
• Maladie du flétrissement
• Énation (botanique)
• Société française de phytopathologie
• Jaunisse de l'aster
• Tératologie végétale
• Apoplexie
• Résistance des plantes aux maladies
• Échelle Horsfall–Barratt
• Chronologie de la phytopathologie
• Désordre physiologique des plantes
• Sol suppressif
• Année internationale de la santé des végétaux
• Maladie végétale d'origine tellurique

• Philippe Lepoivre, Phytopathologie : bases moléculaires et biologiques des pathosystèmes et fondements des stratégies de lutte, Bruxelles/Paris/s.l., éditions De Boeck, 2003, 427 p. (ISBN 2-8041-4115-2).
• (en) Green, J. L., Capizzi, J., & Townsend, L., Diagnosing Plant Problems Kentucky Master Gardener Manual - Chapter 7, J. Hartman, Ed., 16 mars 2016 (lire en ligne), p. 83-110.
• Jean Semal, Pathologie des végétaux et géopolitique : Une étude de l'interaction entre les phénomènes pathologiques des végétaux, les évènements historiques et l'évolution des mœurs, des sciences et des techniques, La Maison Rustique, coll. « Techniques d'avenir », 1982, 270 p. (ISBN 978-2-7066-0137-8).

• (en) J.M. Waller, J.M. Lenné & S.J. Waller, Plant Pathologist’s Pocketbook, CABI Publishing, 2002, 3^e éd., 516 p. (ISBN 9780851994598, lire en ligne).

• Base de données sur la protection des plantes (pathologie), INRA
• Identifier une maladie ou un bio-agresseur sur Ephytia
• Société française de phytopathologie
• Introduction à la pathologie des plantes
• Bulletin de santé du végétal (BSV jardin) sur le site Jardiner autrement

• Sur les maladies des arbres : Bugwood Wiki

• Portail de l’agriculture et l’agronomie
• Portail de la botanique
• Portail de la protection des cultures