Proteobacteria
Les protéobactéries sont un groupe très important de bactéries. Ce groupe inclut des bactéries pathogènes, telles Escherichia, Salmonella, Vibrio et Helicobacter. D'autres interviennent dans la fixation biologique de l'azote ou la production d'acide acétique (bactéries acétiques).
| Règne | Bacteria |
|---|
Embranchement
Classes de rang inférieur
- Voir texte
Classification phylogénétique
- Eubactéries
- Protéobactéries
- groupe :
- Firmicutes
- groupe Bacillus / Clostridium
- Actinobactéries
- groupe :
- Firmicutes
- groupe :
- Bactéries vertes sulfureuses
- groupe :
- Flavobactéries
- Bactéroïdes
- groupe :
- Spirochètes
- Chlamydiales
- Planctomycétales
- Bactéries vertes non sulfureuses
- Aquificales
- Thermotogales
Le terme protéobactéries provient du dieu grec Protée, une divinité marine qui avait la capacité de se métamorphoser, en référence à la grande variété de formes au sein de ce groupe.
La plupart des protéobactéries sont mobiles grâce à un flagelle, mais d'autres peuvent être immobiles ou se déplacer par glissement. Ces derniers sont les Myxobacteria, un groupe unique de bactéries capables de s'agréger formant des corps fructifiants multicellulaires ; elles présentent aussi une grande variété de métabolismes. La plupart sont anaérobies et hétérotrophes, comme les animaux, mais les exceptions sont nombreuses. Certaines protéobactéries, les bactéries pourpres, sont autotrophes et photosynthétiques. Les protéobactéries sont à Gram négatif, c’est-à-dire qu'elles possèdent une membrane externe composée de lipopolysaccharides (LPS) mais pauvre en peptidoglycane.
Selon la théorie endosymbiotique, les mitochondries présentes dans les eukaryotes, et qui leur permettent de "gérer" l'énergie grâce à l'ATP, proviennent de protéobactéries incorporées au sein d'archéobactéries par endosymbiose.
Subdivisions
L'analyse de la séquence du gène codant l'Acide ribonucléique ribosomique 16S permet de diviser les protéobactéries en 5 catégories, allant de α à ε. (6 en 2007 avec ζ)
Rhodobacteria
Alpha Proteobacteria
- Caulobacterales — par exemple Caulobacter
- Parvularculales
- Rhizobiales — par exemple Rhizobium
- Rhodobacterales
- Rhodospirillales — par exemple Acetobacter
- Rickettsiales — par exemple Rickettsia
- Sphingomonadales — par exemple Sphingomonas
Chromatibacteria
Beta Proteobacteria
- Burkholdériales — par exemple Bordetella
- Hydrogenophilales
- Methylophilales
- Neisseriales — par exemple Neisseria
- Nitrosomonadales
- Rhodocyclales
- Procabacteriales
- Comamonadaceae - Par exemple Ideonella sakaiensis
Gamma Proteobacteria
- Acidithiobacillales
- Aeromonadales — par exemple Aeromonas
- Alteromonadales — par exemple Pseudoalteromonas
- Cardiobactériales
- Chromatiales — bactéries poupres
- Enterobactériales — par exemple Escherichia
- Legionellales — par exemple Legionella
- Methylococcales
- Oceanospirillales
- Pasteurellales — par exemple Haemophilus
- Pseudomonadales — par exemple Pseudomonas
- Thiotrichales — par exemple Thiomargarita
- Vibrionales — par exemple Vibrio
- Xanthomonadales — par exemple Stenotrophomonas
Delta Proteobacteria
- Bdellovibrionales — par exemple Bdellovibrio
- Desulfobacterales
- Desulfovibrionales
- Desulfurellales
- Desulfuromonadales — par exemple Geobacter
- Myxococcales — Myxobactéries
- Syntrophobacterales
Epsilon Proteobacteria
- Campylobacterales — par exemple Helicobacter ou Campylobacter jejuni
- Nautiliales
Zeta Proteobacteria
Phylogénie
Notes et références
Bibliographie
- (en) David Emerson, Jeremy A. Rentz, Timothy G. Lilburn, Richard E. Davis, Henry Aldrich, Clara Chan & Craig L. Moyer, 2007 : « A Novel Lineage of Proteobacteria Involved in Formation of Marine Fe-Oxidizing Microbial Mat Communities » PLoS ONE 2(8). Texte original
Liens externes
- (en) Référence BioLib : Proteobacteria E.Stackebrandt,E.G.E.Murray & H.G.Trüper,1988 (consulté le )
- Référence Catalogue of Life : Proteobacteria (consulté le )
- (fr+en) Référence ITIS : Proteobacteria Garrity & al., 2005 ( ) (consulté le )
- (en) Référence Tree of Life Web Project : Proteobacteria (consulté le )
- (en) Référence uBio : Proteobacteria Cavalier-Smith 2002, (consulté le )
- (en) Référence World Register of Marine Species : taxon Proteobacteria (+ liste classes + liste ordres) (consulté le )
