Oryza

Oryza est un genre de plantes monocotylédones de la famille des Poaceae, sous-famille des Oryzoideae[2],[3]. Ce genre comprend une vingtaine d'espèces acceptées, dont les deux espèces de riz cultivé, Oryza sativa et Oryza glaberrima, qui figurent parmi les principales plantes alimentaires.

Oryza
Oryza sativa (riz cultivé)
Classification APG III (2009)
Règne Plantae
Clade Angiospermes
Clade Monocotylédones
Clade Commelinidées
Ordre Poales
Famille Poaceae
Sous-famille Oryzoideae
Tribu Oryzeae
Sous-tribu Oryzinae

Genre

Oryza
L., 1753[1]

Les espèces du genre Oryza sont des graminées poussant dans les zones humides, qui peuvent atteindre 1 à 2 mètres de haut. Le genre comprend des espèces annuelles et vivaces[4].

Plusieurs espèces de riz sauvage (non cultivées), notamment Oryza perennis, Oryza nivara, Oryza rufipogon, Oryza latifolia, Oryza punctata, très proches biologiquement des riz cultivés, se comportent parfois dans les rizières comme des mauvaises herbes difficiles à extirper et sont considérées comme nuisibles[5].

Caractéristiques générales

Les espèces du genre oryza regroupent des plantes herbacées, annuelles ou vivaces, poussant en touffes. Les tiges (chaumes) sont dressées ou ascendantes. Les feuilles, principalement caulinaires, ont un limbe linéaire, plat, relativement large, et une ligule membraneuse[6].

L'inflorescence est une panicule rameuse, souvent penchée, généralement composée de multiples rameaux spiciformes, les ramifications inférieures habituellement verticillées, faiblement ou non ramifiées. Les épillets, portés par un pédicelle court, sont fortement comprimés latéralement. Ils se désarticulent à maturité sous les lemmes stériles, et sont persistants chez les variétés cultivées. Ils comptent trois fleurons, dont seul le fleuron supérieur est fertile. Les fleurons stériles se réduisent à deux lemmes étroites à la base du fleuron fertile. Les glumes, à l'état de vestiges, subsistent après la désarticulation comme une collerette lobée, peu profonde, à l'apex du pédicelle. Toutefois, les écailles étroites situées à la base du fleuron fertile sont parfois considérées comme des glumes plutôt que des lemmes stériles, et la collerette à l'apex du pédicelle tout simplement comme un tissu de ce dernier. La lemme fertile carénée, scarieuse, étroitement papillée, parfois couverte de fines épines, rarement lisse, présente cinq nervures très visibles et un apex non aristé ou portant une arête droite. La paléole, semblable à la lemme, mais plus étroite, présente trois nervures et un apex se terminant en bec. Les fleurons fertiles présentent six étamines. Le fruit est un caryopse de forme variable, avec un embryon dont la longueur est 25 % de celle du caryopse, et un hile linéaire aussi long que le caryopse[6].

Taxinomie

Synonymes

Selon GRIN (5 mars 2015)[7] :

  • Padia Moritzi ;
  • Porteresia Tateoka.

Liste d'espèces

Plus de 300 noms ont été proposés comme espèces, sous-espèces et autres taxons infraspécifiques au sein du genre Oryza. Le nombre d'espèces distinctes acceptées varie selon les auteurs. Selon Kew World Checklist, seules les 19 espèces listées ci-dessous doivent être retenues comme distinctes[8].

Selon World Checklist of Selected Plant Families (WCSP) (22 avril 2017)[9] :

Génome

On a déterminé chez les espèces du genre Oryza dix types de génomes (parfois 11), dont six génomes diploïdes (AA, BB, CC, EE, FF et GG) et quatre ou cinq génomes allotétraploïdes (BBCC, CCDD, HHKK, HHJJ[10] et KKLL[11]. La répartition des espèces entre ces différents types de génomes est présentée ci-après[12]. La plupart des espèces du genre Oryza ont été groupées en complexes d'espèces, en nombre variable selon les auteurs. La section Oryza sativa se subdivise en deux complexes, le complexe Oryza sativa, qui comprend sept espèces morphologiques partageant toutes le génome diploïde AA, et le complexe Oryza officinalis, qui regroupe des espèces ayant quatre génomes différents, BB, CC, DD et EE, avec à la fois des espèces diploïdes et des espèces tétraploïdes[13].

Complexe d'espècesType de
génome		Nombre de
chromosomes (2n)		EspècesDistribution[14]Caractères utiles[15]Commentaires[16]
Section Sativa
Complexe Oryza sativaAA 24Oryza sativacosmopolitecultigène, rendement élevé
AA 24Oryza glaberrimaAfrique occidentalecultigène ; tolérance à la sécheresse, à l'acidité du sol, à la toxicité ferreuse, à la carence en phosphore ; résistance à la nielle bactérienne (Xanthomonas oryzae pv oryzae), à la pyriculariose (Magnaporthe grisea), au virus de la marbrure jaune du riz (RYMV), à la cécidomyie du riz (Orseolia oryzivora), aux nématodes ; compétitivité vis-à-vis des adventices
AA 24Oryza barthii (Oryza breviligulata)Afriquerésistance à la cicadelle verte, à la nielle bactérienne ; évitement de la sécheresse ; tolérance à la chaleur et à la sécheresse
AA 24Oryza glumipatulaAmérique centrale et Amérique du Sudaptitude à l'élongation ; source de stérilité mâle cytoplasmique (CMS) ; tolérance à la chaleur
AA 24Oryza longistaminataAfriquerésistance à la nielle bactérienne, aux nématodes, aux foreurs des tiges ; évitement de la sécheresse
AA 24Oryza meridionalisAustralieaptitude à l'élongation ; évitement de la sécheresse ; tolérance à la chaleur et à la sécheresse
AA 24Oryza nivaraAsie tropicale et subtropicalerésistance au virus du rabougrissement herbacé du riz (RGSV), à la nielle bactérienneécotype annuel d'Oryza rufipogon
AA 24Oryza rufipogonAsie tropicale et subtropicale, Australie tropicalerésistance à la nielle bactérienne, à la pyriculariose, à la cicadelle brune, au virus du tungro ; tolérance modérée à la pourriture de la gaine (Thanatephorus cucumeris, anamorphe : Rhizoctonia solani) ; tolérance à l'aluminium et à l'acidité du sol ; élongation accrue sous hautes eaux ; loci d'augmentation du rendement
Complexe Oryza officinalisBB, BBCC 24, 48Oryza punctataAfriquerésistance à la cicadelle brune, à la nielle bactérienne, à la cicadelle zigzag (Recilia dorsalis) ; tolérance à la chaleur et à la sécheresse
CC 24Oryza officinalisAsie tropicale et subtropicale, Australie tropicalerésistance aux thrips, à la cicadelle brune, à la cicadelle verte, à la pourriture des tiges (Magnaporthe salvinii) ; tolérance à la chaleur
CC 24Oryza rhizomatisSri Lankaévitement de la sécheresse ; résistance à la pyriculariose ; tolérance à la chaleur
CCDD 48Oryza malampuzhaensisInderace tétraploïde d'Oryza officinalis
BBCC 48Oryza minutaPhilippines, Papouasie Nouvelle-Guinéerésistance à la nielle bactérienne, à la pyriculariose, à la cicadelle brune, à la cicadelle verte
BBCC 48Oryza schweinfurthianaAfriquerace tétraploïde d'Oryza punctata
BBCC 48Oryza eichingeriAfrique orientale, Sri Lankarésistance à la cicadelle brune (Nilaparvata lugens), à la cicadelle à dos blanc (Sogatella furcifera), à la cicadelle verteseule espèce présente à la fois en Asie et en Afrique
CCDD 48Oryza altaAmérique centrale et Amérique du Sudrésistance à la pyrale rayée du riz (Chilo suppressalis) ; production élevée de biomasse
CCDD 48Oryza grandiglumisAmérique du Sudproduction de biomasse élevée
CCDD 48Oryza latifoliaAmérique centrale et Amérique du Sudrésistance à la cicadelle brune, à la nielle bactérienne ; production élevée de biomasse
Section Australiensis
EE 24Oryza australiensisAustralie tropicalerésistance à la pyriculariose, à la nielle bactérienne, à la cicadelle brune ; évitement de la sécheresse ; tolérance à la chaleur et à la sécheressemembre du complexe Oryza officinalis
Section Brachyantha
FF 24Oryza brachyanthaAfriquetolérance à l'ombre ; stolonifère
Section PadiaSection basale ou primitive du genre Oryza
HHKK 48Oryza schlechteriPapouasie Nouvelle-Guinéestolonifère
KKLL 48Oryza coarctataAsie du sudtolérance au sel ; stolonifère
Section Ridleyanae
Complexe Oryza ridleyiHHJJ48Oryza longiglumisIran Jaya, Indonésie, Papouasie Nouvelle-Guinéerésistance à la pyriculariose, à la nielle bactérienne
HHJJ48Oryza ridleyiAsie du Sud, Papouasie Nouvelle-Guinéerésistance à la pyriculariose, à la nielle bactérienne, au virus du tungro, aux foreurs des tiges et à la mineuse du riz (Hydrellia philippina)
Section Granulata
Complexe Oryza meyerianaGG 24Oryza granulataAsie du Sudtolérance à l'ombre ; adaptation aux sols aérobiesvariété dOryza meyeriana
GG 24Oryza meyerianaAsie du Sud-Esttolérance à l'ombre ; adaptation aux sols aérobies
GG 24Oryza neocaledonicaNouvelle-Calédonie

Phylogénie

Notes et références
  1. Tropicos.org. Missouri Botanical Garden., consulté le 5 mars 2015
  2. (en) Robert J. Soreng, Paul M. Peterson, Konstantin Romaschenko, Gerrit Davidse, Fernando O. Zuloaga, Emmet J. Judziewicz, Tarciso S. Filgueiras, Jerrold I. Davis et Osvaldo Morrone, « A worldwide phylogenetic classification of the Poaceae (Gramineae) », Journal of Systematics and Evolution (JSE), vol. 53, no 2,‎ , p. 117–202 (lire en ligne).
  3. (en) « Oryza L. », Tropicos (consulté le ).
  4. (en) « 稻属 dao shu Oryza Linnaeus, Sp. Pl. 1: 333. 1753. », sur Flora of China (consulté le ).
  5. A. Ferrero, « Le riz nuisible, caractères biologiques et contrôle », dans R. Labrada, Gestion des mauvaises herbes pour les pays en développement: Addendum 1, Rome, FAO, (lire en ligne), p. 92-114.
  6. (en) « 37. Oryza Linnaeus, Sp. Pl. 1: 333. 1753. », sur Flora of China (eFloras.org) (consulté le ).
  7. USDA, Agricultural Research Service, National Plant Germplasm System. 2021. Germplasm Resources Information Network (GRIN Taxonomy). National Germplasm Resources Laboratory, Beltsville, Maryland., consulté le 5 mars 2015
  8. (en) « Oryza L., Sp. Pl.: 333 (1753). », sur World Checklist of Selected Plant Families (WCSP), Royal Botanic Gardens, Kew (consulté le ).
  9. WCSP. World Checklist of Selected Plant Families. Facilitated by the Royal Botanic Gardens, Kew. Published on the Internet ; http://wcsp.science.kew.org/, consulté le 22 avril 2017
  10. (en) Fei Lu et al., « Comparative sequence analysis of MONOCULM1-orthologous regions in 14 Oryza genomes », National Academy of Sciences of the USA, (consulté le ).
  11. (en) J. Maclean, B. Hardy, G. Hettel, Rice Almanac : Source Book for One of the Most Important Economic Activities on Earth, IRRI, , 4e éd., 283 p. (ISBN 978-971-22-0300-8, lire en ligne), p. 7-10.
  12. (en) Song Ge, Tao Sang, Bao-Rong Lu et De-Yuan Hong, « Evolution Phylogeny of rice genomes with emphasis on origins of allotetraploid species », Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), vol. 96, no 25,‎ , p. 14400–14405 (PMCID PMC24448, lire en ligne).
  13. (en) Jonathan Gressel, Crop Ferality and Volunteerism, CRC Press, , 448 p. (ISBN 978-1-4200-3799-9, lire en ligne), p. 258-259.
  14. (en) Hiro-Yuki Hirano, Atshushi Hirai, Yoshio Sano, Takuji Sasaki, Rice Biology in the Genomics Era, volume 62 de Biotechnology in Agriculture and Forestry, Berlin, Springer Science & Business Media, , 381 p. (ISBN 978-3-540-74250-0, lire en ligne), p. 239-240.
  15. (en) Paul L. Sanchez, Rod A. Wing, et Darshan S. Brar, « The Wild Relative of Rice: Genomes and Genomics », dans Qifa Zhang, Rod A. Wing, Genetics and Genomics of Rice, volume 5 de Plant Genetics and Genomics: Crops and Models, Springer Science & Business Media, , 402 p. (ISBN 9781461479031, lire en ligne), p. 9-24.
  16. (en) Jay Maclean, Bill Hardy et Gene Hettel, Rice Almanac, 4e édition, Institut international de recherche sur le riz (IRRI), , 298 p. (ISBN 978-971-22-0300-8, lire en ligne).

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