Xanthomonas oryzae pv oryzae

Xanthomonas oryzae pathovar oryzae est l'un des deux pathovars rattachés à Xanthomonas oryzae, espèce de protéobactéries, appartenant à la famille des Xanthomonadaceae.

Xanthomonas oryzae
pathovar oryzae
Symptômes de la maladie bactérienne due à Xanthomonas oryzae pv oryzae sur riz.
Classification
Règne Bacteria
Embranchement Proteobacteria
Classe Gammaproteobacteria
Ordre Xanthomonadales
Famille Xanthomonadaceae
Genre Xanthomonas
Espèce Xanthomonas oryzae

Pathovar

Xanthomonas oryzae pathovar oryzae
(ex ?Ishiyama 1922) Swings et al., 1990[1]

Cette bactérie, dont l'hôte principal est le riz (Oryza sativa), est responsable d'une des plus graves maladies du riz, appelée maladie bactérienne du riz (ou bactériose du riz), ou « kresek » en Asie du Sud-Est . Elle est présente dans la plupart des régions rizicoles du monde, à l'exception du bassin méditerranéen[2].

Dans des conditions favorables à la maladie, les pertes de rendement peuvent atteindre 70 %.

Le génome de cette bactérie (souche MAFF 311018) a été séquencé en 2005 par une équipe japonaise. Ce génome, constitué d'un seul chromosome circulaire, a une taille de 4 940 217 pb. Sa structure se caractérise par un grand nombre de gènes effecteurs (avr). Cette bactérie est considérée comme un organisme modèle pour l'analyse de l'interaction plante-pathogène car on en connaît plus de 30 races différentes par leur virulence et que 25 gènes de résistance ont été identifiés chez le riz (dont le génome a également été séquencé)[3].

Synonymes
  • Pseudomonas oryzae,
  • Xanthomonas itoana,
  • Xanthomonas kresek,
  • Xanthomonas oryzae,
  • Xanthomonas translucens f.sp. oryzae
  • Xanthomonas campestris pathovar oryzae (Ishiyama 1922) Dye 1978b[4],[5].

Gamme d'hôtes

Outre le riz cultivé, Xanthomonas campestris pathovar oryzae admet comme plantes hôtes diverses espèces de Poaceae (Graminées) et de Cyperaceae (Carex).

Parmi les Poaceae, figurent notamment : Cenchrus ciliaris (cenchrus de Rhodésie), Cynodon dactylon (chiendent pied de poule), Echinochloa crus-galli (panic pied-de-coq), Leersia hexandra, Leersia japonica, Leersia oryzoides (leersie faux-riz), Leersia sayanuka, Leptochloa chinensis, Leptochloa panicea, Oryza sp. (espèces du genre Oryza, en particulier Oryza rufipogon et Oryza australiensis en Australie), Panicum maximum (herbe de Guinée), Paspalum scrobiculatum (herbe à épée), Urochloa mutica (herbe de Para), Zizania aquatica (riz sauvage), Zizania palustris (riz sauvage) et Zoysia japonica (zoysia du Japon) ;

et parmi les Cyperaceae : Cyperus difformis (souchet à petites fleurs), Cyperus rotundus (souchet officinal)[6],[5].

Leersia sayanuka est au Japon l'hôte le plus important car cette espèce assure la survie de la bactérie pendant l'hiver et se rencontre communément dans les zones où la maladie est endémique[7].

Notes et références
  1. Roskov Y., Ower G., Orrell T., Nicolson D., Bailly N., Kirk P.M., Bourgoin T., DeWalt R.E., Decock W., van Nieukerken E.J., Penev L. (eds.) (2020). Species 2000 & ITIS Catalogue of Life, 2020-12-01. Digital resource at www.catalogueoflife.org. Species 2000: Naturalis, Leiden, the Netherlands. ISSN 2405-8858, consulté le 26 octobre 2014
  2. « Fiche informative sur les organismes de quarantaine - Xanthomonas oryzae », OEPP (consulté le ).
  3. (en) Hirokazu Ochiai, Yasuhiro Inoue, Masaru Takeya, Aeni Sasaki et Hisatoshi Kaku, « Genome Sequence of Xanthomonas oryzae pv. oryzae Suggests Contribution of Large Numbers of Effector Genes and Insertion Sequences to Its Race Diversity », Japan Agricultural Research Quarterly (JARQ), vol. 39, no 4,‎ 2005), p. 275–287 (lire en ligne).
  4. (en) « bacterial leaf blight of rice - Xanthomonas oryzae pv. oryzae (ex. Ishiyama 1922) Swings et al. 1990 », sur Invasive.org (consulté le ).
  5. (en) « Xanthomonas oryzae pv. oryzae », sur Cooperative Agricultural Pest Survey (CAPS) (consulté le ).
  6. (en) « Risk assessment: Xanthomonas oryzae pv . oryzae, bacterial leaf blight or kresek disease », NCSU/APHIS Plant Pest Forecast (NAPPFAST) (consulté le ).
  7. (en) Shu Huang Ou, Rice Diseases, CAB International / IRRI, , 380 p. (ISBN 978-0-85198-545-9, lire en ligne), p. 79.

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