Code de couleurs CPK
En chimie, le code de couleurs CPK est un ensemble de couleurs permettant la distinction des atomes de différents éléments chimiques dans les modèles moléculaires. Le code est nommé d'après les modèles CPK conçus par les chimistes Robert Corey et Linus Pauling, et améliorés par Walter Koltun.
Histoire
En 1952, Corey et Pauling publient la description de modèles compacts de protéines et d'autres biomolécules qu'ils ont construit au Caltech[1]. Leurs modèles représentent les atomes sous la forme de boules de bois, peintes de diverses couleurs pour indiquer leur élément chimique respectif. Le code de couleurs inclut :
Ils assemblent également des modèles plus petits à partir de boules de plastique, avec le même code de couleurs.
En 1965, Koltun fait breveter une version améliorée de la technique de modélisation de Corey et Pauling[2]. Dans son brevet, il mentionne les couleurs suivantes :
- blanc pour l'hydrogène ;
- noir pour le carbone ;
- bleu pour l'azote ;
- rouge pour l'oxygène ;
- jaune profond pour le soufre ;
- violet pour le phosphore ;
- vert clair, intermédiaire, intermédiaire sombre et sombre pour les halogènes (fluor, chlore, brome, iode) ;
- argent pour les métaux (cobalt, fer, nickel, cuivre).
Table
La table suivante présente les couleurs assignées à chaque élément par le code CPK et des variantes plus modernes. La colonne C est l'attribution originale des couleurs par Corey et Pauling[1] et K est celle du brevet de Koltun[2]. La colonne J est le code couleur utilisé par Jmol[3]. La colonne R est celui utilisé par Rasmol (quand deux couleurs sont signalées, la seconde est valide pour les versions 2.7.3 et suivantes)[3],[4]. Toutes les couleurs sont approximatives et peuvent dépendre de la configuration de l'écran et des conditions de lecture.
Notes et références
- (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « CPK coloring » (voir la liste des auteurs).
- (en) Robert B. Corey and Linus Pauling (1953): Molecular Models of Amino Acids, Peptides, and Proteins. Review of Scientific Instruments, Volume 24, Issue 8, pp. 621-627. DOI:10.1063/1.1770803.
- (en) Walter L. Koltun (1965), Space filling atomic units and connectors for molecular models. U. S. Patent 3170246.
- (en) Jmol color table sur sourceforge.net.
- (en) Rasmol color table sur bio.cmu.edu.
Portail de la chimie