Marcel Salathé

Marcel Salathé, né en 1975 à Bâle, est un épidémiologiste numérique suisse. Il est actuellement professeur associé à l'École polytechnique fédérale de Lausanne[1] et directeur du labo d'épidémiologie numérique, basé sur le campus de Genève de l'EPFL[2]. Durant la première année de la pandémie de Covid-19, Salathé a été le scientifique le plus cité dans les médias suisses[3].

Marcel Salathé
Marcel Salathé aux Al for Good Global Summit 2018.
Naissance
Bâle (Suisse)
Nationalité Suisse
Domaines Épidémiologie
Épidémiologie numérique
Institutions École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL)
Formation Université de Bâle
ETH Zurich
Influencé par Sebastian Bonhoeffer
Site www.epfl.ch/labs/salathelab/
digitalepidemiologylab.org

Carrière

De 1995 à 2002, Salathé a étudié la biologie à l'université de Bâle. En 2007, il obtient un doctorat en biologie et sciences de l'environnement à l'école polytechnique fédérale de Zurich sur la génétique des populations et la biologie évolutive dans le groupe de Sebastian Bonhoeffer, où il poursuit ensuite des études postdoctorales pendant un an[4]. En 2008, Salathé a reçu une bourse de la Société pour la Science Branco Weiss[5]. La même année, il rejoint le groupe de Marcus Feldman à l'université Stanford en tant que chercheur post-doctoral[6],[7]. En 2010, il devient professeur adjoint au Centre de dynamique des maladies infectieuses de l'université d'État de Pennsylvanie[8].

En 2015, il a été nommé professeur associé à l'école polytechnique fédérale de Lausanne (EPFL) avec une double nomination à la School of Computer and Communication Sciences et à la School of Life Sciences[1], où il agit en tant que directeur fondateur du laboratoire d'épidémiologie numérique[2]. En 2016, il a fondé la EPFL Extension School, l'école en ligne de l'EPFL pour les compétences numériques appliquées, et en est depuis le directeur académique[9].

Au cours de la pandémie de COVID-19, Salathé s'est fait connaître d'un plus large public principalement par de multiples apparitions à la télévision suisse[10], aux médias[11],[12] et dans des conférences publiques[13],[14],[15]. En novembre 2020, il est nommé directeur du comité de pilotage du programme national de recherche suisse COVID-19[16]. En février 2021, il cofonde un lobby numérique CH++[17]

Recherche

Salathé s'intéresse aux problèmes épidémiologiques, notamment aux réseaux de contacts. Il analyse les flux de données numériques (par exemple Twitter ou les téléphones portables) afin d'obtenir des informations épidémiologiques[18]. Il est l'auteur principal de l'article Digital Epidemiology publié en 2012 introduisant le terme épidémiologie numérique (e-épidémiologie)[7]. Ces dernières années, ses recherches ont commencé à se concentrer sur l'épidémiologie nutritionnelle, en utilisant des outils numériques et basés sur l'intelligence artificielle pour permettre un suivi alimentaire à haute résolution dans des cohortes médicales[19],[20].

Depuis la pandémie de COVID-19, son travail s'est également concentré sur la recherche numérique des contacts. Il a été membre du groupe développant l'algorithme de Decentralized Privacy-Preserving Proximity Tracing[21] et le responsable scientifique de l'application pour téléphone mobile SwissCovid lancée par l'administration fédérale suisse. Cette dernière est la première application numérique de recherche de contacts développée par un gouvernement qui utilise le système de notification d'exposition de Google/ Apple (GAEN).


Distinctions

De 2008 à 2013, Salathé a été un Branco Weiss Society in Science Fellow[5] et en 2018, puis en 2020, il a été nommé Switzerland Digital Shaper[22],[23].

En 2020, il intègre de la Swiss National COVID-19 Science Task Force, du conseil consultatif scientifique Corona du Conseil fédéral et des cantons[24]. Il préside le groupe d'experts en épidémiologie numérique[25]. Il démissionne en févier 2021[17].

En novembre 2020, Salathé a été nommé président du comité de pilotage du Fonds national suisse de la recherche scientifique (FSN) pour le programme national de recherche "Covid-19"[16].

Il est cofondateur de la startup AIcrowd qui entretient une plateforme de collaboration pour data scientist spécialisée dans le crowdsourcing de solutions intelligence artificielle (AI)[6].

Publications
  • Mohanty, S.P., Hughes, D.P. et Salathé, M., 2016. Utilisation de l'apprentissage profond pour la détection des maladies des plantes basée sur l'image. Frontiers in plant science, 7, p. 1419.[26]
  • Salathé, M., Kazandjieva, M., Lee, J.W., Levis, P., Feldman, M.W. et Jones, J.H., 2010. Un réseau de contacts humains à haute résolution pour la transmission des maladies infectieuses. Proceedings of the National Academy of Sciences, 107(51), p. 22020-22025.[27]
  • Salathé, M. et Khandelwal, S., 2011. Évaluation des sentiments de vaccination avec les médias sociaux en ligne : implications pour la dynamique et le contrôle des maladies infectieuses. PLoS Comput Biol, 7(10), p.e1002199.[28]
  • Marcel Salathé, Christian L Althaus, Nanina Anderegg, Daniele Antonioli, Tala Ballouz, Edouard Bugnion, Srjan Capkun, Dennis Jackson, Sang-Il Kim, James Larus, View ORCID ProfileNicola Low, Wouter Lueks, Dominik Menges, Cedric Moullet, Mathias Payer, Julien Riou, Theresa Stadler, Carmela Troncoso, Effy Vayena, Viktor von Wyl, 2020. Premières preuves de l'efficacité de la recherche numérique des contacts pour le SRAS-CoV-2 en Suisse. MedRXiv.[29]

Références
  1. Sandy Evangelista, « Trois professeurs nommés à la Faculté SV », EPFL,‎ (lire en ligne, consulté le )
  2. (en-GB) « Salathe Lab », sur www.epfl.ch (consulté le )
  3. (de) « Wissenschaft und Virus – «Corona hat mich stark politisiert» », sur Der Bund (consulté le )
  4. (en) Address ETH Zürich Dep of Environmental Systems Science Prof Dr Sebastian Bonhoeffer Institut für Integrative Biologie CHN K. 12 1 Universitätstrasse 16 8092 Zürich Switzerl, « Bonhoeffer, Sebastian, Prof. Dr. | ETH Zurich », sur usys.ethz.ch (consulté le )
  5. (en) « Salathé », sur The Branco Weiss Fellowship - Society in Science (consulté le )
  6. (en) « Stanford research follows spread of flu in high school | Stanford News Release », sur news.stanford.edu, (consulté le )
  7. Marcel Salathé, Maria Kazandjieva, Jung Woo Lee et Philip Levis, « A high-resolution human contact network for infectious disease transmission », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 107, no 51,‎ , p. 22020–22025 (ISSN 0027-8424, PMID 21149721, PMCID 3009790, DOI 10.1073/pnas.1009094108, lire en ligne, consulté le )
  8. (en) « Messages From the Director - The Huck Institutes », sur www.huck.psu.edu (consulté le )
  9. (en) EPFL Extension School, « Our team », sur EPFL Extension School (consulté le )
  10. (de) « Zug und Tram sind nicht genug - Braucht es eine generelle Maskenpflicht, Marcel Salathé? », sur Schweizer Radio und Fernsehen (SRF), (consulté le )
  11. (en) « Swiss soldiers pick up smartphones to fight COVID-19 », sur SWI swissinfo.ch (consulté le )
  12. (de) Larissa Rhyn, « "Epidemiologe Marcel Salathé: Wie weiter nach dem Lockdown?" », sur Neue Zürcher Zeitung
  13. Nik Papageorgiou, « «Il faut gagner du temps pour le développement potentiel d'un vaccin» », EPFL,‎ (lire en ligne, consulté le )
  14. (de) « COVID-19 », sur Reatch (consulté le )
  15. « COVID-19: EPFL's Marcel Salathé course on Feb 26, 2020 » (consulté le )
  16. « Election of Steering Committee of NRP 78 "Covid-19" - SNF », sur www.snf.ch (consulté le )
  17. Annick Chevillot, « Pourquoi Marcel Salathé quitte la task force pour lancer un lobby numérique », sur www.heidi.news,
  18. Marcel Salathé, Linus Bengtsson, Todd J. Bodnar et Devon D. Brewer, « Digital Epidemiology », PLoS Computational Biology, vol. 8, no 7,‎ (ISSN 1553-734X, PMID 22844241, PMCID 3406005, DOI 10.1371/journal.pcbi.1002616, lire en ligne, consulté le )
  19. « AI-assisted food tracking to revolutionize nutritional research - AI For Nutrition », sur www.aifornutrition.org (consulté le )
  20. (en) Gianrocco Lazzari, Yannis Jaquet, Djilani J. Kebaili et Laura Symul, « FoodRepo: An Open Food Repository of Barcoded Food Products », Frontiers in Nutrition, vol. 5,‎ (ISSN 2296-861X, DOI 10.3389/fnut.2018.00057, lire en ligne, consulté le )
  21. DP-3T/documents, DP^3T, (lire en ligne)
  22. (de) « Researchers | BILANZ », sur Handelszeitung (consulté le )
  23. (de) « Marcel Salathé | BILANZ », sur Handelszeitung (consulté le )
  24. (de) « Organisation & Expertengruppen – Swiss National COVID-19 Science Task Force » (consulté le )
  25. (en-US) « Organisation & expert groups – Swiss National COVID-19 Science Task Force » (consulté le )
  26. (en) Sharada P. Mohanty, David P. Hughes et Marcel Salathé, « Using Deep Learning for Image-Based Plant Disease Detection », Frontiers in Plant Science, vol. 7,‎ , p. 1419 (ISSN 1664-462X, PMID 27713752, PMCID 5032846, DOI 10.3389/fpls.2016 .01419, arXiv 1604.03169)
  27. (en) Marcel Salathé, Maria Kazandjieva, Jung Woo Lee, Philip Levis, Marcus W. Feldman et James H. Jones, « Un réseau de contacts humains à haute résolution pour la transmission des maladies infectieuses », Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 107, no 51,‎ , p. 22020-22025 (ISSN 0027-8424, PMID 21149721, PMCID 3009790, DOI 10.1073/pnas.1009094108, Bibcode 2010PNAS..10722020S, arXiv 1006.4622)
  28. (en) Marcel Salathé et Shashank Khandelwal, « Assessing Vaccination Sentiments with Online Social Media : Implications pour la dynamique et le contrôle des maladies infectieuses », PLOS Computational Biology, vol. 7, no 10,‎ , e1002199 (ISSN 1553-7358, PMID 22022249, DOI 10.1371/journal.pcbi.1002199, Bibcode 2011PLSCB...7E2199S, arXiv 1105.4502, S2CID 966975)
  29. (en) Marcel Salathé, Christian L. Althaus, Nanina Anderegg, Daniele Antonioli, Tala Ballouz, Edouard Bugnion, Srjan Capkun, Dennis Jackson, Sang- Il Kim, James Larus et Nicola Low, « Early Evidence of Effectiveness of Digital Contact Tracing for SARS-CoV-2 in Switzerland », MedRxiv,‎ , p. 2020.09.07.20189274 (DOI 10.1101/2020.09.07.20189274, S2CID 221552302, https : //www. medrxiv.org/content/10.1101/2020.09.07.20189274v1)

Liens externes

Voir aussi
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