Sandra L. Baldauf

Sandra Leah Baldauf, née le 15 décembre 1951, est une biologiste américaine.

Parcours

Sandra L. Baldauf a étudié l'évolution moléculaire et la phylogénie depuis 1985, et a reçu un doctorat (PhD) de l'Université du Michigan à Ann Arbor (États-Unis) en 1990. Elle a continué à étudier en profondeur la phylogénie des eucaryotes et l'évolution moléculaire en tant que postdoctorante de l'Université Dalhousie à Halifax en Nouvelle-Écosse (Canada). Elle devient, plus tard, conférencière, puis professeure de bio-informatique au sein de l'Université d'York à York (Royaume-Uni).

Elle mute pour l'Université d'Uppsala à Uppsala (Suède) en 2007 pour prendre la tête du programme de recherche en biologie systématique.

Travaux scientifiques

Son domaine de recherche est une combinaison de phylogénie moléculaire, d'évolution basée sur des modèles de séquence des protéines, et de systématique des principaux taxons orphelins et peu étudiés parmi les organismes eucaryotes, tels que les Dictyostelia et Choanoflagellata.

Arbre phylogénétique des Eucaryotes

Baldauf produit un phylogramme sans racine, ou diagramme en étoile, fondé sur un consensus d'études moléculaires et d'autres données actuelles[1]^,[2]^,[3]. Ses travaux (publiés en 2003)[1] sur la classification phylogénétique des Eucaryotes ont retenu l'attention de Richard Dawkins qui les reprend en référence pour son ouvrage Il était une fois nos ancêtres[4].

Arbre phylogénétique simplifié d'après Baldauf 2003

▲
- Eukaryota
  - …
    - opistochontes ►
      - choanoflagellés
      - animaux
      - microsporidies
      - champignons
      - choanozoaires
    - amoebozoaires ►
      - amibes à lobopodes
      - moisissures visqueuses à dictyostélide
      - moisissures visqueuses à plasmode
      - moisissures visqueuses à protostélide
      - pélobiontes
  - plantes ►
    - algues rouges
    - algues prasinophytes
    - plantes terrestres
    - algues charophytes
    - algues chlorophytes
    - algues glaucophytes
  - rhizariens ►
    - amibes euglyphides
    - foraminifères
    - cercomonades
    - chlorarachniophytes
    - radiolaires
  - …
    - alvéolates
      - ciliés
      - groupe marin I
      - dinoflagellés
      - apicomplexés
      - groupe marin II
    - hétérochontes ►
      - bicosoecides
      - oomycètes
      - diatomées
      - algues brunes
      - autres algues à chlorophylle a et c
      - labyrinthulides
    - …
      - cryptophytes
      - haptophytes
  - …
    - discicristés
      - moisissures visqueuses acrasiales
      - amibes vahlkampfiides
      - euglénoïdes
      - trypanosomes
      - leishmanies
      - jacobides
    - excavobiontes ►
      - diplomonades
      - parabasalides
      - rétortamonades

D'après Dawkins (2007)[4] pour les termes en français.

Après l'analyse de He et al. 2014[5], Baldauf positionne la racine de l'arbre phylogénique des Eucaryotes entre les Excavés et les autres eucaryotes (ensemble formé des Diaphoretickes et des Amorphea)[6].

Publications

(en) Sandra L. Baldauf & Jeffrey D. Palmer, "Evolutionary transfer of the chloroplast tqu gene to the nucleus", Nature, Vol.344, No.6263, March 15, 1990, p. 262-265. DOI:10.1038/344262a0
(en) Sandra L. Baldauf, Jame R. Manhart & Jeffrey D. Palmer, "Different fates of the chloroplast tufA gene following its transfer to the nucleus in green algae", Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Vol.87, No.14, July 1, 1990, p. 5317–5321. DOI:10.1073/pnas.87.14.5317
(en) Sandra L. Baldauf & Jeffrey D. Palmer, "Animals and fungi are each other's closest relatives : Congruent evidence from multiple proteins", Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Vol.90, No.24, December 15, 1993, p. 11558–11562. DOI:10.1073/pnas.90.24.11558
(en) Sandra L. Baldauf, Jeffrey D. Palmer & W. Ford Doolittle, "The root of the universal tree and the origin of eukaryotes based on elongation factor phylogeny", Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Vol. 93, No.15, July 23, 1996, p. 7749-7754. DOI:10.1073/pnas.93.15.7749
(en) Sandra L. Baldauf & W. Ford Doolittle, "Origin and evolution of the slime molds (Mycetozoa)", Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Vol. 94, No.22, October 28, 1997, p. 12007-12012. DOI:10.1073/pnas.94.22.12012
(en) Sandra L. Baldauf, "A Search for the Origins of Animals and Fungi : Comparing and Combining Molecular Data", The American Naturalist, Vol.154 [Supplement, Vol.65], No.S4, October 1999, p.S178-S188. DOI:10.1086/303292
(en) Sandra L. Baldauf, Andrew J. Roger, Ingrid Wenk-Siefert & W. Ford Doolittle, "A Kingdom-Level Phylogeny of Eukaryotes Based on Combined Protein Data", Science, Vol.290, No.5493, November 3, 2000, p. 972-977. DOI:10.1126/science.290.5493.972
(en) Sandie Baldauf, "The tree of life is a tree (more or less)", Trends in Ecology & Evolution, Vol.17, No.10, October 1, 2002, p. 450-451. DOI:10.1016/S0169-5347(02)02598-3
(en) Sandra L. Baldauf, "The deep roots of eukaryotes", Science, Vol.300, No.5626, June 13, 2003, p. 1703-1706. DOI:10.1126/science.1085544
(en) Emma T. Steenkamp, Jane Wright & Sandra L. Baldauf, "The Protistan Origins of Animals and Fungi", Molecular Biology and Evolution, Vol.23, No.1, January 2006, p. 93-106. DOI:10.1093/molbev/msj011
(en) Pauline Schaap, Thomas Winckler, Michaela Nelson, Elisa Alvarez-Curto, Barrie Elgie, Hiromitsu Hagiwara, James Cavender, Alicia Milano-Curto1, Daniel E. Rozen, Theodor Dingermann, Rupert Mutzel & Sandra L. Baldauf, "Molecular Phylogeny and Evolution of Morphology in the Social Amoebas", Science, Vol.314, No.5799, October 27, 2006, p. 661-663. DOI:10.1126/science.1130670
(en) Sandra L. Baldauf, "An overview of the phylogeny and diversity of eukaryotes", Journal of Systematics and Evolution, Vol.46, No.3, May 18, 2008, p. 263-273. DOI:10.3724/SP.J.1002.2008.08060
(en) Martin Carr, Barry S.C. Leadbeater, Ruhana Hassan, Michaela Nelson & Sandra L. Baldauf, "Molecular phylogeny of choanoflagellates, the sister group to Metazoa", Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Vol.105, No.43, October 28, 2008, p. 16641–16646. DOI:10.1073/pnas.0801667105
(en) Martin Carr & Sandra L. Baldauf, "The Protistan Origins of Animals and Fungi", in Karl Esser, Stefanie Pöggeler & Johannes Wöstemeyer (ed.), The Mycota : A Comprehensive Treatise on Fungi as Experimental Systems for Basic and Applied Research, Volume XIV : Evolution of Fungi and Fungal-Like Organisms, Springer Verlag, Heidelberg, Dordrecht, London, New York, 2011, p. 3-23. (ISBN 978-3-642-19973-8) DOI:10.1007/978-3-642-19974-5_1

Notes et références

(en) Sandra L. Baldauf, « The Deep Roots of Eukaryotes », Science, vol. 300, n^o 5626,‎ 13 juin 2003, p. 1703-1706 (ISSN 0036-8075, DOI 10.1126/science.1085544, résumé)
(en) Johanna Fehling, Diane Stoecker et Sandra L. Baldauf, « Chapter 6 : Photosynthesis and the Eukaryote Tree of Life », dans Paul G. Falkowski et Andrew H. Knoll (dir.), Evolution of Primary Producers in the Sea, Boston, Elsevier Academic Press, 2007, xiii + 441 p. (ISBN 978-0-12-370518-1), p. 75-107
(en) Sandra L. Baldauf, « An overview of the phylogeny and diversity of eukaryotes », Journal of Systematics and Evolution, vol. 46, n^o 3,‎ 18 mai 2008, p. 263-273 (ISSN 0529-1526, DOI 10.3724/SP.J.1002.2008.08060, résumé, lire en ligne [PDF])
Richard Dawkins (trad. Marie-France Desjeux), « Rendez-vous 37 : Zone de brume », dans Il était une fois nos ancêtres : Une histoire de l'évolution [« The Ancestor's Tale »], Paris, Robert Laffont, 2007, 798 p. (ISBN 978-2-221-10505-4), p. 625-630 (graphique p.628)
(en) Ding He, Omar Fiz-Palacios, Cheng-Jie Fu, Johanna Fehling, Chun-Chieh Tsai et Sandra L. Baldauf, « An Alternative Root for the Eukaryote Tree of Life », Current Biology, vol. 24, n^o 4,‎ 17 février 2014, p. 465-470 (ISSN 0960-9822, DOI 10.1016/j.cub.2014.01.036, résumé, lire en ligne)
(en) Tom A. Williams, « Evolution : Rooting the Eukaryotic Tree of Life », Current Biology, vol. 24, n^o 4,‎ 17 février 2014, R151-R152 (ISSN 0960-9822, DOI 10.1016/j.cub.2014.01.026, lire en ligne)

Liens externes

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[sb2003-1] (en) Sandra L. Baldauf, « The Deep Roots of Eukaryotes », Science, vol. 300, n^o 5626,‎ 13 juin 2003, p. 1703-1706 (ISSN 0036-8075, DOI 10.1126/science.1085544, résumé)

[jf2007-2] (en) Johanna Fehling, Diane Stoecker et Sandra L. Baldauf, « Chapter 6 : Photosynthesis and the Eukaryote Tree of Life », dans Paul G. Falkowski et Andrew H. Knoll (dir.), Evolution of Primary Producers in the Sea, Boston, Elsevier Academic Press, 2007, xiii + 441 p. (ISBN 978-0-12-370518-1), p. 75-107

[sb2008-3] (en) Sandra L. Baldauf, « An overview of the phylogeny and diversity of eukaryotes », Journal of Systematics and Evolution, vol. 46, n^o 3,‎ 18 mai 2008, p. 263-273 (ISSN 0529-1526, DOI 10.3724/SP.J.1002.2008.08060, résumé, lire en ligne [PDF])

[rd2007-4] Richard Dawkins (trad. Marie-France Desjeux), « Rendez-vous 37 : Zone de brume », dans Il était une fois nos ancêtres : Une histoire de l'évolution [« The Ancestor's Tale »], Paris, Robert Laffont, 2007, 798 p. (ISBN 978-2-221-10505-4), p. 625-630 (graphique p.628)

[dh2014-5] (en) Ding He, Omar Fiz-Palacios, Cheng-Jie Fu, Johanna Fehling, Chun-Chieh Tsai et Sandra L. Baldauf, « An Alternative Root for the Eukaryote Tree of Life », Current Biology, vol. 24, n^o 4,‎ 17 février 2014, p. 465-470 (ISSN 0960-9822, DOI 10.1016/j.cub.2014.01.036, résumé, lire en ligne)

[tw2014-6] (en) Tom A. Williams, « Evolution : Rooting the Eukaryotic Tree of Life », Current Biology, vol. 24, n^o 4,‎ 17 février 2014, R151-R152 (ISSN 0960-9822, DOI 10.1016/j.cub.2014.01.026, lire en ligne)