Halobacterium

Halobacterium est un genre d'archées halophiles de la famille des Halobacteriaceae. Il regroupe plusieurs espèces aérobies dont le métabolisme nécessite un environnement à forte teneur en sels dissous car de nombreuses enzymes de ces organismes sont inopérantes dans les environnements pauvres en sels. Ces cellules se présentent sous forme de bâtonnets ou de coques de couleur rouge ou violette, avec des parois cellulaires différentes de celles des bactéries car ces dernières ne résistent pas aux environnements trop riches en sels, et se développent en présence d'acides aminés en conditions aérobies. Elle se reproduisent par scissiparité (par constriction) et sont motiles. Leur développement est optimal à 42 °C.

Halobacterium

Halobacterium sp., souche NRC-1,
chaque cellule mesure approx. 5 µm

Classification
Règne	Archaea
Embranchement	Euryarchaeota
Classe	Halobacteria
Ordre	Halobacteriales
Famille	Halobacteriaceae

Genre

Halobacterium
Elazari-Volcani, 1957, emend. Oren et al., 2009[1]

Le génome d’Halobacterium NRC-1 a été séquencé et comprend 2 571 010 paires de bases d'ADN répartis sur trois chromosomes circulaires : un grand de 2 014 239 paires de bases, et deux petits de 191 346 et 365 425 paires de bases.

Les espèces d'archées du genre Halobacterium sont présentes dans le Grand Lac Salé, dans la mer Morte, dans le lac Magadi et plus généralement dans toutes les étendues d'eau à forte teneur en sel. Les espèces d’halobactéries pourpres doivent leur couleur à la bactériorhodopsine, une protéine qui permet à ces cellules de générer un gradient de protons à travers leur membrane plasmique et de produire de l'énergie métabolique par phosphorylation de l'ADP en ATP par couplage chimiosmotique.

Liste des espèces

Selon Catalogue of Life (27 juillet 2017)[2] :

Halobacterium halobium (Petter, 1931) Elazari-Volcani, 1957
Halobacterium jilantaiense Yang & al., 2006
Halobacterium noricense Gruber & al., 2005
Halobacterium piscisalsi Yachai & al., 2008
Halobacterium salinarum (Harrison & Kennedy, 1922) Elazari-Volcani, 1957 emend. Gruber & al., 2004

Notes et références

(en) Référence NCBI : Halobacterium (taxons inclus)
Roskov Y., Ower G., Orrell T., Nicolson D., Bailly N., Kirk P.M., Bourgoin T., DeWalt R.E., Decock W., van Nieukerken E.J., Penev L. (eds.) (2020). Species 2000 & ITIS Catalogue of Life, 2020-12-01. Digital resource at www.catalogueoflife.org. Species 2000: Naturalis, Leiden, the Netherlands. ISSN 2405-8858, consulté le 27 juillet 2017

Bibliographie

(en) DasSarma, S., B.R. Berquist, J.A. Coker, P. DasSarma, J.A. Müller. 2006. Post-genomics of the model haloarchaeon Halobacterium sp. NRC-1. Saline Systems 2:3.

(en) Judicial Commission of the International Committee on Systematics of Prokaryotes:, « The nomenclatural types of the orders Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanomicrobiales, Planctomycetales, Prochlorales, Sulfolobales, Thermococcales, Thermoproteales and Verrucomicrobiales are the genera Acholeplasma, Halanaerobium, Halobacterium, Methanobacterium, Methanococcus, Methanomicrobium, Planctomyces, Prochloron, Sulfolobus, Thermococcus, Thermoproteus and Verrucomicrobium, respectively. Opinion 79 », Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 55, n^o Pt 1,‎ 2005, p. 517–518 (PMID 15653928, DOI 10.1099/ijs.0.63548-0)

(en) A. Oren A et A. Ventosa, « International Committee on Systematic Bacteriology Subcommittee on the taxonomy of Halobacteriaceae. Minutes of the meetings, 16 August 1999, Sydney, Australia », Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 50,‎ 2000, p. 1405–1407 (PMID 10843089, DOI 10.1099/00207713-50-3-1405)

(en) DasSarma, S. 2004. Genome sequence of an extremely halophilic archaeon, in Microbial Genomes, p. 383–399, C.M. Fraser, T. Read, and K.E. Nelson (eds.), Humana Press, Inc, Totowa, NJ.

(en) Lynn Margulis, Karlene V.Schwartz, Five Kingdoms. An Illustrated Guide to the Phyla of Life on Earth (W.H.Freeman, San Francisco, 1982) p. 36–37

(en) NE Gibbons, Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, Baltimore, The Williams & Wilkins Co., 1974, « Family V. Halobacteriaceae fam. nov. »

(en) B Elazari-Volcani, Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, Baltimore, The Williams & Wilkins Co., 1957, 207–212 p., « Genus XII. Halobacterium Elazari-Volcani, 1940 »

(en) B Elazari-Volcani, Studies on the microflora of the Dead Sea, Doctoral dissertation, Hebrew University, Jerusalem, 1940, 1–116 and i–xiii p.

Liens externes

(en) Référence BioLib : Halobacterium B. Elazari-Volcani, 1957 (consulté le 27 juillet 2017)
(en) Référence Catalogue of Life : Halobacterium Elazari-Volcani, 1957 (consulté le 13 décembre 2020)
(fr+en) Référence ITIS : Halobacterium Elazari-Volcani, 1957 (+ version anglaise) (consulté le 27 juillet 2017)
(en) Référence NCBI : Halobacterium (taxons inclus) (consulté le 27 juillet 2017)
(en) Référence uBio : Halobacterium Schoop 1935 (consulté le 27 juillet 2017)
(en) Référence World Register of Marine Species : taxon Halobacterium Elazari-Volcani, 1957 (+ liste espèces) (consulté le 27 juillet 2017)

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[1] (en) Référence NCBI : Halobacterium (taxons inclus)

[CatalogueofLife27_juillet_2017-2] Roskov Y., Ower G., Orrell T., Nicolson D., Bailly N., Kirk P.M., Bourgoin T., DeWalt R.E., Decock W., van Nieukerken E.J., Penev L. (eds.) (2020). Species 2000 & ITIS Catalogue of Life, 2020-12-01. Digital resource at www.catalogueoflife.org. Species 2000: Naturalis, Leiden, the Netherlands. ISSN 2405-8858, consulté le 27 juillet 2017