Recherche:Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes/Fiche/Archées

Fiche mémoire sur Archées

Archées

archeo blocs

Lien tableur: archeo blocs
Légende:
- 23s': possible 23S ribosomal RNA but does not have good blast hits on one or both of the ends.

- 23s°: 23S ribosomal RNA rRNA prediction is too short

- 16s': possible 16S ribosomal RNA but does not have good blast hits on one or both of the ends.

- 16s°: 16S ribosomal RNA rRNA prediction is too short

- thanitrop Nitrososphaerales

- thanitrosp Nitrosopumilales

- thaumu Thaumarchaeota unclas

- Kor Korarchaeota

- crenarcheota crenarcheota

- aciduli Aciduliprofundum

- tcocci thermococci

- tplasma thermoplasma

archeo blocs
clade	lien	blocs	16s	total	avec	sans	total clade	arc001				Notes
Euryarcheota
aciduli	arc001	16,23,5	1	46	0	46			16235s	16, 23, 5	avant
							1	sans	0	1	0

clade	lien	blocs	16s	total	avec	sans	total clade	arc003-9				Notes
archeoglobi	arc003	16gca23, 5	1	46	1	45			16235s	16gca23, 5	avant
	arc006	16gca23, 5	1	53	1	52	5	sans	0	5	0
	arc007	16gca23, 5	1	47	1	46
	arc008	16gca23, 5	1	49	1	48
	arc009	16gca23, 5	1	49	1	48
clade	lien	blocs	16s	total	avec	sans	total clade	arc010-39				Notes
halobacteria	arc010	16gca235-tgc-aag	1	50	3	47			16235s	16gca235	avant
	arc011	16gca235-tgc	3	49	2	47		sans	4	23	2	1-3
		16s23s5s						1-3		11		16gca235-tgc-aag
		16s23s5s-5s					40	total	4	34	2	3*16gca235-tgc-aaa
												16gca235-tgc-tcc
	arc015	16gca235-tgc	1	47	2	45						6*16gca235-tgc
	arc019	2*16gca235	2	57	2	55
	arc021	16gca235	2	53	3	50						avant
		16gca235-tgc										tcc-16gca235
												atc-16gca235
	arc022	16gca235-tgc	3	48	2	46
		2*16s23s5s										autres incomplets
												23s5s
	arc023	16gca235	3	50	6	44
		tcc-16gca235										5s en trop
		16gca235-tgc-aaa										16s23s5s-5s
		5s										3*16gca2355
												2*5s
	arc025	2*16gca235	2	45	2	43
	arc026	16gca235	1	48	1	47
	arc028	16gca235-tgc	1	51	2	49

	arc029	16gca235	2	48	4	44
		16gca235-tgc-aaa

	arc030	16gca235	3	51	6	45
		atc-16gca235
		16gca235-tgc-aaa
		5s

	arc032	2*16gca235	3	50	3	47
		16gca2355
		23s5s

	arc033	2*16gca235	3	49	3	46
		16gca2355

	arc035	3*16gca235	3	51	3	48
	arc036	3*16gca235	4	55	4	51
		16gca2355

	arc037	16gca235-tgc-tcc	1	46	3	43
	arc038	16gca235-tgc	1	47	2	45
	arc039	16gca235	1	47	1	46
			40
clade	lien	blocs	16s	total	avec	sans	total clade	arc042-48				Notes
M.bacteria	arc042	16gca235	2	47	2	45			16235s	16gca235	avant
		16gca2355					10	sans	1	9	0	5s en trop
												2*16gca2355
	arc044	3*16gca235	3	47	3	44
	arc046	16gca235	2	59	2	57
		16gca2355

	arc048	2*16gca235	3	36	2	34
		16s23s5s	10
clade	lien	blocs	16s	total	avec	sans	total clade	arc054-69				Notes
M.cocci	arc054	6aas-16gca235	2	38	13	25			16235s	16gca235	avant
		aca-cca-tac-aaa-5s-gac					4	sans	1	2	1	avant
		16gca23										6aas-16gca235

	arc067	2*16gca235	2	40	2	38						incomplet
		5s										16gca23
												6aas-16s23s
	arc069	16s23s5s	2	35	12	23
		6aas-16s23s										5s en trop
		aca-cca-tac-aaa-5s-gac	6									2*aca-cca-tac-aaa-5s-gac
												5s
clade	lien	blocs	16s	total	avec	sans	total clade	arc070-110				Notes
M.microbia	arc070	2*16gca235	3	54	2	52			16235s	16gca235	avant
		16s23s5s						sans	7	15		1-3
								1-3	1	15		3*16gca235-tgc-5s
	arc073	3*16gca235-tgc-5s	3	51	6	45	38	total	8	30		10*16gca23-tgc-5s
	arc075	3*16gca235	3	53	3	50						2*16gca23-tgc-5s-cgg
	arc076	16gca23-tgc-5s	1	47	2	45						1623-tgc-5s
	arc078	2*16gca23-tgc-5s	2	50	4	46
	arc079	2*16gca23-tgc-5s	3	53	7	46						5s en trop
		16gca23-tgc-5s-cgg										3*16gca235-tgc-5s
												5s-tgc
	arc080	2*16gca235	2	48	3	45						5s
		5s-tgc

	arc081	16gca23-tgc-5s	1	47	2	45
	arc082	2*16gca23-tgc-5s	3	53	7	46
		16gca23-tgc-5s-gcg
		5s

	arc083	2*16gca23-tgc-5s	2	52	4	48
	arc084	1623-tgc-5s	1	49	1	48
	arc086	2*16gca235	2	49	2	47
	arc089	3*16gca235	3	50	3	47
	arc094	2*16s23s5s	3	63	1	62
		16gca235

	arc097	2*16s23s5s	3	58	1	57
		16gca235

	arc110	2*16s23s5s	3	56	1	55
		16gca235	38
clade	lien	blocs	16s	total	avec	sans	total clade	arc180-187				Notes
tcocci	arc180	16gca23	1	46	2	44			16gca23, 5			5s en trop
		5s-gac					3	sans	3			3*5s-gac
		5s

	arc181	16gca23	1	46	2	44
		5s-gac
		5s

	arc187	16gca23	1	46	2	44
		5s-gac
		5s
clade	lien	blocs	16s	total	avec	sans	total clade	arc212-217				Notes
tplasma	arc212	16, 23, 5	1	46	0	46			16, 23, 5			5s en trop
	arc213	16, 23, 5	1	46	0	46	6	sans	6			5s
	arc214	16, 23, 5	1	47	0	47
	arc215	16, 23, 5	1	46	0	46
	arc216	16, 23, 5	1	46	0	46
	arc217	16, 23, 5, 5	1	46	0	46
clade	lien	blocs	16s	total	avec	sans	total clade	Total				Notes
Euryarcheota									16235s	16gca235	avant
		Total		2782	150	2632		sans	13	49	3	1-3
		Moyenne		49	3	46		1-3	1	26	0	3*16gca235-tgc-aaa
		ecartype		5	3	6	92	total	14	75	3	16gca235-tgc-aag
		max		63	13	62	109					16gca235-tgc-tcc
		min		35	0	23						3*16gca235-tgc-5s
												6*16gca235-tgc
												2*16gca23-tgc-5s-cgg
		Synthèse								Notes suite		10*16gca23-tgc-5s
		génomes	63							génomes		1623-tgc-5s
		blocs	109							7*16, 23, 5
		cds	0							8*16gca23,5		autres incomplets
		16gca235	75									23s5s
		16s23s5s	14							avant
										tcc-16gca235		5s en trop
		16gca23-tgc-5s-z	12							atc-16gca235		2*aca-cca-tac-aaa-5s-gac
		16gca235-tgc-z	14							6aas-16gca235		16s23s5s-5s
		16gca23,5	8									3*16gca2355
		16, 23, 5	7							incomplet		5*5s
		6aas-16gca23	1							16gca23		5s-tgc
		6aas-16s23s	1							6aas-16s23s		3*16gca235-tgc-5s
		4aas-5s-gac	2									2*16gca2355
												3*5s-gac
autres archées
clade	lien	blocs	16s	total	avec	sans	total clade	arc119-208				Notes
thanitrop	arc200	1623, 5	1	43	0	43			1623, 5
thanitrosp	arc206	1623, 5	1	46	0	46		sans	20			cds
thaumu	arc208	1623, 5	1	46	0	46		1-3	2			16-cds-23-cds-gcg, 5, 5
							22	total	22
Kor	arc040	1623, 5	1	46	0	46						1-3
												1623s, 5s-atc
crenarcheota
protei	arc119	1623, 5	1	47	0	47						5s en trop
	arc120	1623, 5	1	46	0	46						5s
	arc124	1623, 5	1	48	0	48
	arc126	1623, 5	1	48	0	48
	arc129	1623, 5	1	47	0	47
	arc130	16-cds-23-cds-gcg, 5, 5	1	47	1	46
	arc133	1623, 5	1	47	0	47
	arc136	1623, 5	1	46	0	46
	arc141	1623, 5s-atc	1	48	1	47
	arc143	1623, 5	1	46	0	46
	arc145	1623, 5	1	50	0	50
	arc161	1623, 5	1	49	0	49
	arc163	1623, 5	1	47	0	47
	arc168	1623, 5	1	47	0	47
	arc170	1623, 5	1	46	0	46
	arc172	1623, 5	1	46	0	46
	arc175	1623, 5	1	47	0	47
	arc176	1623, 5	1	46	0	46
clade	lien	blocs	16s	total	avec	sans	total clade	autres				Notes
autres archées									1623, 5
								sans	20			cds
		Moyenne		47	0	47		1-3	2			16-cds-23-cds-gcg, 5, 5
		ecartype		1	0	1	22	total	22
		max		50	1	50						1-3
		min		43	0	43						1623s, 5s-atc

		génomes	22									5s en trop
		blocs	22									5s
		cds	1
		1623, 5	22

archeo notes

Lien tableur: archeo notes
Notice: Les archées présentent aussi des blocs à séquences longues en gènes de tRNA. Ici les 2 seuls M.cocci avec 6aas avant 16s.
arc054 Methanocaldococcus fervens AG86, 6aas-16gca235

comp	1008636..1009604		CDS		122	hp
comp	1009727..1009984		ncRNA		53
comp	1010038..1010152		5s		70
comp	1010223..1013210		23s		114
comp	1013325..1013397		gca		65
comp	1013463..1014943		16s		196
comp	1015140..1015211		cac		11
comp	1015223..1015310		cta		32
comp	1015343..1015417		gaa		13
comp	1015431..1015508		atgi		29
comp	1015538..1015613		aac		8
comp	1015622..1015698		ttc		109
comp	1015808..1016863		CDS			TIGR01177 family methyltransferase

arc069 Methanotorris igneus Kol 5, 6aas-16s23s

	1393589..1394737		cds		211	DNA double-strand break repair nuclease NurA
comp	1394949..1395025		ttc		96	
	1395122..1395197		aac		65	
	1395263..1395337		atgi		62	
	1395400..1395474		gaa		16	
	1395491..1395575		cta		8	
	1395584..1395655		cac		197	
	1395853..1397326		16s		171	
	1397498..1400473		23s		276	
	1400750..1401265		cds			flagella protein

archeo typage

Lien tableur: archeo typage

Halobacteria

halo type 16-y-235 après 16s

Type

type		tableau		av16s	total	%
16s23s5s	4			4	10
gca		34		2	36	90
total		38		2	40

halo type 16235-z après 5s

Type

type	total	%
sans	25	63
tgc	6	15
tgc-aaa	3	8
tgc-aag	1	3
tgc-tcc	1	3
5s	4	10
total	40

tRNAs

tRNA	total	%
sans	25	56
tgc	11	24
aaa	3	7
aag	1	2
tcc	1	2
5s	4	9
total	45

halo type x-16235 avant 16s

Type:

type	
tcc	1
atc	1

M.microbia

microbia type 16-y-235 après 16s

Type

type		tableau	 %
16s23s5s	8	21
gca		30	79
total		38

microbia type 16235-z après 5s

Type

type		total	%
sans		22	58
5s-tgc-5s	3	8
tgc-5s-cgg	2	5
tgc-5s		11	29
total		38

tRNAs

tRNA	total	%
sans	22	50
tgc	17	39
cgg	2	5
5s	3	7
total	44

microbia type x-16235 avant 16s

Type: néant

Euryarcheota

eury type 16-y-235 après 16s

Abrégé

aciduli		16, 23, 5	1
T.plasma			6
		
archeoglobi	16gca23, 5	5
T.cocci				3
		
halobacteria	16gca235	25
		16gca235-z	11
M.microbia	16gca235	15
		16gca235-z	15
		
M.bacteria	16gca235	9
M.cocci				4
		
total abrégé			94
16s23s5s			15
total tableau			109

Type, 16s-y-23s5s

	
type		total	%
16gca23		87	80
16s23s		15	14
16,23,5		7	6
total abrégé	109	100

Les autres archées

autres type 16-y-235 après 16s

Abrégé

type			1623,5	
Nitrososphaerales	1
Nitrosopumilales	1
Thaumarchaeota unclas	1
Korarchaeota		1
crenarcheota		17
		
total abrégé		21
total tableau		22
		
crenarcheota		
16-cds-23-cds-gcg, 5, 5

Tableau des noms archeo

Lien tableur: Tableau des noms archeo
Prélèvement: fait vers le 20.8.19 et mise en forme le 17.8.19 Paris.
Légende:
- rRNAs, 666 ou "10,10,10", sous la forme indiquée par NCBI, (5S, 16S, 23S).

- rupture, sélection des génomes sur les 2 premiers attributs

- fait, dans génomes archeo

- code, utilisé dans les génomes "fait"

- tRNAs, nombre de tRNAs tel qu'il est déduit de la de la construction des noms.
Construction de la liste des noms
Statistiques

tRNAs           total           10372
génomes		ruptures	faits	total
 		172		79	217

Clades

aciduli		Aciduliprofundum	nano		Nanoarchaeum
archeo		archeoglobi		protei		Thermoprotei
halo		halobacteria		tcocci		thermococci
kor		korarcheota		thanitrop	Nitrosopumilales
mbacteria	methanobacteria		thanitrosp	Nitrososphaerales
mcocci		methanococci		thaum		Cenarchaeales
microbia	methanomicrobia		thaumu		unclassified Thaumarchaeota
mpyri		methanopyri		tplasma		thermoplasmata

F. Noms des archeo
ruptures	clade	rRNAs	fait	code	tRNAs	génomes
1	aciduli	1, 1, 1	1	arc001	46	Aciduliprofundum boonei T469
1	aciduli	1, 1, 1		arc002	46	Aciduliprofundum sp. MAR08-339
1	archeo	1, 1, 1	1	arc003	46	Archaeoglobus fulgidus DSM 4304
	archeo	1, 1, 1		arc004	46	Archaeoglobus fulgidus DSM 8774
1	archeo	1, 1, 1		arc005	49	Archaeoglobus profundus DSM 5631
1	archeo	1, 1, 1	1	arc006	53	Archaeoglobus sulfaticallidus PM70-1
1	archeo	1, 1, 1	1	arc007	47	Archaeoglobus veneficus SNP6
1	archeo	1, 1, 1	1	arc008	49	Ferroglobus placidus DSM 10642
1	archeo	1, 1, 1	1	arc009	49	Geoglobus acetivorans SBH6
1	halo	1, 1, 1	1	arc010	50	Halalkalicoccus jeotgali B3
1	halo	4, 3, 3	1	arc011	49	Haloarcula hispanica ATCC 33960 CGMCC 1.2049
	halo			arc012	49	Haloarcula hispanica N601
1	halo			arc013	50	Haloarcula marismortui ATCC 43049
1	halo			arc014	49	Haloarcula sp. CBA1115
1	halo	1, 1, 1	1	arc015	47	Halobacterium salinarum R1 DSM 671
1	halo			arc016	47	Halobacterium sp. DL1
1	halo			arc017	47	Halobacterium sp. NRC-1
1	halo			arc018	55	Haloferax mediterranei ATCC 33500
	halo	2, 2, 2	1	arc019	57	Haloferax mediterranei ATCC 33500 CGMCC 1.2087
1	halo			arc020	53	Haloferax volcanii DS2
1	halo	2, 2, 2	1	arc021	53	Halogeometricum borinquense DSM 11551 PR 3
1	halo	3, 3, 3	1	arc022	48	Halomicrobium mukohataei DSM 12286
1	halo	4, 3, 3	1	arc023	50	Halopiger xanaduensis SH-6
1	halo			arc024	45	Haloquadratum walsbyi C23
	halo	2, 2, 2	1	arc025	45	Haloquadratum walsbyi DSM 16790 HBSQ001
1	halo	1, 1, 1	1	arc026	48	Halorhabdus tiamatea SARL4B
1	halo			arc027	46	Halorhabdus utahensis DSM 12940
1	halo	1, 1, 1	1	arc028	51	Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239
1	halo	2, 2, 2	1	arc029	48	Halostagnicola larsenii XH-48
1	halo	4, 3, 3	1	arc030	51	Haloterrigena turkmenica DSM 5511
1	halo			arc031	47	Halovivax ruber XH-70
1	halo	5, 3, 4	1	arc032	50	Natrialba magadii ATCC 43099
1	halo	4, 3, 3	1	arc033	49	Natrinema pellirubrum DSM 15624
1	halo			arc034	51	Natrinema sp. J7-2
1	halo	3, 3, 3	1	arc035	51	Natronobacterium gregoryi SP2
1	halo	5, 4, 4	1	arc036	55	Natronococcus occultus SP4
1	halo	1, 1, 1	1	arc037	46	Natronomonas moolapensis 8.8.11
1	halo	1, 1, 1	1	arc038	47	Natronomonas pharaonis DSM 2160 Gabara
1	halo	1, 1, 1	1	arc039	47	Salinarchaeum sp. Harcht-Bsk1
1	Kor	1, 1, 1	1	arc040	46	Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8
1	mbacteria			arc041	46	Methanobacterium formicicum
	mbacteria	3, 2, 2	1	arc042	47	Methanobacterium formicicum BRM9
1	mbacteria			arc043	43	Methanobacterium lacus AL-21
1	mbacteria	3, 3, 3	1	arc044	47	Methanobacterium paludis SWAN1
1	mbacteria			arc045	44	Methanobacterium sp. MB1
1	mbacteria	3, 2, 2	1	arc046	59	Methanobrevibacter ruminantium M1
1	mbacteria			arc047	36	Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 PS DSMZ 861
1	mbacteria	3, 3, 3	1	arc048	36	Methanobrevibacter sp. AbM4
1	mbacteria			arc049	42	Methanosphaera stadtmanae DSM 3091
1	mbacteria			arc050	40	Methanothermobacter marburgensis str. Marburg
1	mbacteria			arc051	39	Methanothermobacter sp. CaT2
1	mbacteria			arc052	39	Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H
1	mbacteria			arc053	41	Methanothermus fervidus DSM 2088
1	mcocci	2, 2, 2	1	arc054	38	Methanocaldococcus fervens AG86
1	mcocci			arc055	38	Methanocaldococcus infernus ME
1	mcocci			arc056	37	Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661
1	mcocci			arc057	37	Methanocaldococcus sp. FS406-22
1	mcocci			arc058	37	Methanocaldococcus sp. JH146
1	mcocci			arc059	38	Methanocaldococcus vulcanius M7
1	mcocci			arc060	39	Methanococcus aeolicus Nankai-3
1	mcocci			arc061	38	Methanococcus maripaludis C5
	mcocci			arc062	38	Methanococcus maripaludis C6
	mcocci			arc063	38	Methanococcus maripaludis C7
	mcocci			arc064	38	Methanococcus maripaludis S2
	mcocci			arc065	38	Methanococcus maripaludis X1
1	mcocci			arc066	38	Methanococcus vannielii SB
1	mcocci	3, 2, 2	1	arc067	40	Methanococcus voltae A3
1	mcocci			arc068	38	Methanothermococcus okinawensis IH1
1	mcocci	2, 2, 2	1	arc069	35	Methanotorris igneus Kol 5
1	microbia	3, 3, 3	1	arc070	54	Methanocella arvoryzae MRE50
1	microbia			arc071	50	Methanocella conradii HZ254
1	microbia			arc072	50	Methanocella paludicola SANAE
1	microbia	6, 3, 3	1	arc073	51	Methanococcoides burtonii DSM 6242
1	microbia			arc074	54	Methanococcoides methylutens MM1
1	microbia	3, 3, 3	1	arc075	53	Methanocorpusculum labreanum Z
1	microbia	1, 1, 1	1	arc076	47	Methanoculleus bourgensis MS2 MS2T
1	microbia			arc077	49	Methanoculleus marisnigri JR1
1	microbia	2, 2, 2	1	arc078	50	Methanohalobium evestigatum Z-7303
1	microbia	3, 3, 3	1	arc079	53	Methanohalophilus mahii DSM 5219
1	microbia	3, 2, 2	1	arc080	48	Methanolacinia petrolearia DSM 11571
1	microbia	1, 1, 1	1	arc081	47	Methanolinea tarda NOBI-1
1	microbia	4, 3, 3	1	arc082	53	Methanolobus psychrophilus R15
1	microbia	2, 2, 2	1	arc083	52	Methanomethylovorans hollandica DSM 15978
1	microbia	1, 1, 1	1	arc084	49	Methanoregula boonei 6A8
1	microbia			arc085	49	Methanoregula formicica SMSP
1	microbia	2, 2, 2	1	arc086	49	Methanosaeta concilii GP6
1	microbia			arc087	48	Methanosaeta harundinacea 6Ac
1	microbia			arc088	48	Methanosaeta thermophila PT
1	microbia	3, 3, 3	1	arc089	50	Methanosalsum zhilinae DSM 4017
1	microbia			arc090	58	Methanosarcina acetivorans C2A
1	microbia			arc091	61	Methanosarcina barkeri 227
	microbia			arc092	60	Methanosarcina barkeri 3
	microbia			arc093	59	Methanosarcina barkeri MS
	microbia	3, 3, 3	1	arc094	63	Methanosarcina barkeri str. Fusaro
	microbia			arc095	63	Methanosarcina barkeri str. Wiesmoor
1	microbia			arc096	60	Methanosarcina horonobensis HB-1 JCM 15518
1	microbia	3, 3, 3	1	arc097	58	Methanosarcina lacustris Z-7289
1	microbia			arc098	59	Methanosarcina mazei C16
	microbia			arc099	57	Methanosarcina mazei Go1
	microbia			arc100	57	Methanosarcina mazei LYC
	microbia			arc101	57	Methanosarcina mazei S-6
	microbia			arc102	57	Methanosarcina mazei SarPi
	microbia			arc103	43	Methanosarcina mazei Tuc01
	microbia			arc104	57	Methanosarcina mazei WWM610
1	microbia			arc105	57	Methanosarcina siciliae C2J
	microbia			arc106	57	Methanosarcina siciliae HI350
	microbia			arc107	57	Methanosarcina siciliae T4/M
1	microbia			arc108	62	Methanosarcina sp. Kolksee
1	microbia			arc109	57	Methanosarcina sp. MTP4
1	microbia	3, 3, 3	1	arc110	56	Methanosarcina sp. WH1
1	microbia			arc111	58	Methanosarcina sp. WWM596
	microbia			arc112	58	Methanosarcina thermophila CHTI-55
1	microbia			arc113	58	Methanosarcina thermophila TM-1
1	microbia			arc114	61	Methanosarcina vacuolata Z-761
1	microbia			arc115	56	Methanosphaerula palustris E1-9c
1	microbia			arc116	51	Methanospirillum hungatei JF-1
1	mpyri			arc117	35	Methanopyrus kandleri AV19
1	nano			arc118	44	Nanoarchaeum equitans Kin4-M
1	protei	1, 1, 1	1	arc119	47	Acidianus hospitalis W1
1	protei	1, 1, 1	1	arc120	46	Acidilobus saccharovorans 345-15
1	protei			arc121	47	Aeropyrum camini SY1 JCM 12091
1	protei			arc122	49	Aeropyrum pernix K1
1	protei			arc123	46	Caldisphaera lagunensis DSM 15908
1	protei	1, 1, 1	1	arc124	48	Caldivirga maquilingensis IC-167
1	protei			arc125	46	Desulfurococcus fermentans DSM 16532
1	protei	1, 1, 1	1	arc126	48	Desulfurococcus kamchatkensis 1221n
1	protei			arc127	46	Desulfurococcus mucosus DSM 2162
1	protei			arc128	45	Fervidicoccus fontis Kam940
1	protei	1, 1, 1	1	arc129	47	Hyperthermus butylicus DSM 5456
1	protei	2, 1, 1	1	arc130	47	Ignicoccus hospitalis KIN4/I
1	protei			arc131	47	Ignisphaera aggregans DSM 17230
1	protei			arc132	46	Metallosphaera cuprina Ar-4
1	protei	1, 1, 1	1	arc133	47	Metallosphaera sedula CuR1
	protei			arc134	47	Metallosphaera sedula DSM 5348
1	protei			arc135	47	Pyrobaculum aerophilum str. IM2
1	protei	1, 1, 1	1	arc136	46	Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514
1	protei			arc137	46	Pyrobaculum calidifontis JCM 11548
1	protei			arc138	46	Pyrobaculum islandicum DSM 4184
1	protei			arc139	49	Pyrobaculum oguniense TE7
1	protei			arc140	47	Pyrobaculum sp. 1860
1	protei	1, 1, 1	1	arc141	48	Pyrolobus fumarii 1A
1	protei			arc142	46	Staphylothermus hellenicus DSM 12710
1	protei	1, 1, 1	1	arc143	46	Staphylothermus marinus F1
1	protei			arc144	50	Sulfolobus acidocaldarius DSM 639
	protei	1, 1, 1	1	arc145	50	Sulfolobus acidocaldarius N8
	protei			arc146	50	Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I
	protei			arc147	46	Sulfolobus acidocaldarius SUSAZ
1	protei			arc148	47	Sulfolobus islandicus HVE10/4
	protei			arc149	47	Sulfolobus islandicus L.D.8.5
	protei			arc150	47	Sulfolobus islandicus L.S.2.15
	protei			arc151	49	Sulfolobus islandicus LAL14/1
	protei			arc152	47	Sulfolobus islandicus M.14.25
	protei			arc153	46	Sulfolobus islandicus M.16.2
	protei			arc154	46	Sulfolobus islandicus M.16.23
	protei			arc155	46	Sulfolobus islandicus M.16.27
	protei			arc156	47	Sulfolobus islandicus M.16.4
	protei			arc157	47	Sulfolobus islandicus M.16.40
	protei			arc158	46	Sulfolobus islandicus M.16.43
	protei			arc159	47	Sulfolobus islandicus M.16.47
	protei			arc160	48	Sulfolobus islandicus REY15A
	protei	1, 1, 1	1	arc161	49	Sulfolobus islandicus Y.G.57.14
	protei			arc162	46	Sulfolobus islandicus Y.N.15.51
1	protei	1, 1, 1	1	arc163	47	Sulfolobus solfataricus 98/2
	protei			arc164	46	Sulfolobus solfataricus 98/2 SULC
	protei			arc165	45	Sulfolobus solfataricus P2
	protei			arc166	47	Sulfolobus solfataricus SULA
	protei			arc167	47	Sulfolobus solfataricus SULB
1	protei	1, 1, 1	1	arc168	47	Sulfolobus tokodaii str. 7
1	protei			arc169	46	Thermofilum carboxyditrophus 1505
1	protei	1, 1, 1	1	arc170	46	Thermofilum pendens Hrk 5
1	protei			arc171	46	Thermofilum sp. 1910b
1	protei	1, 1, 1	1	arc172	46	Thermogladius cellulolyticus 1633
1	protei			arc173	46	Thermoproteus neutrophilus V24Sta
1	protei			arc174	46	Thermoproteus tenax Kra 1
1	protei	1, 1, 1	1	arc175	47	Thermoproteus uzoniensis 768-20
1	protei	1, 1, 1	1	arc176	46	Thermosphaera aggregans DSM 11486
1	protei			arc177	46	Vulcanisaeta distributa DSM 14429
1	protei			arc178	47	Vulcanisaeta moutnovskia 768-28
1	tcocci			arc179	47	Palaeococcus pacificus DY20341
1	tcocci	2, 1, 1	1	arc180	46	Pyrococcus abyssi GE5
1	tcocci	2, 1, 1	1	arc181	46	Pyrococcus furiosus COM1
	tcocci			arc182	46	Pyrococcus furiosus DSM 3638
1	tcocci			arc183	46	Pyrococcus horikoshii OT3
1	tcocci			arc184	46	Pyrococcus sp. NA2
1	tcocci			arc185	46	Pyrococcus sp. ST04
1	tcocci			arc186	47	Pyrococcus yayanosii CH1
1	tcocci	2, 1, 1	1	arc187	46	Thermococcus barophilus MP
1	tcocci			arc188	46	Thermococcus eurythermalis A501
1	tcocci			arc189	47	Thermococcus gammatolerans EJ3 DSM 15229
1	tcocci			arc190	48	Thermococcus kodakarensis KOD1
1	tcocci			arc191	47	Thermococcus litoralis DSM 5473
1	tcocci			arc192	47	Thermococcus nautili 30-1
1	tcocci			arc193	46	Thermococcus onnurineus NA1
1	tcocci			arc194	46	Thermococcus sibiricus MM 739
1	tcocci			arc195	46	Thermococcus sp. 4557
1	tcocci			arc196	46	Thermococcus sp. AM4
1	tcocci			arc197	46	Thermococcus sp. CL1
1	tcocci			arc198	48	Thermococcus sp. ES1
1	thanitrop			arc199	44	Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1
1	thanitrop	1, 1, 1	1	arc200	43	Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2
1	thanitrop			arc201	44	Candidatus Nitrosopumilus sp. D3C
1	thanitrop			arc202	43	Candidatus Nitrosopumilus sp. NF5
1	thanitrop			arc203	44	Nitrosopumilus maritimus SCM1
1	thanitrosp			arc204	48	Candidatus Nitrososphaera evergladensis SR1
1	thanitrosp			arc205	47	Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2
1	thanitrosp	1, 1, 1	1	arc206	46	Nitrososphaera viennensis EN76
1	thaum			arc207	46	Cenarchaeum symbiosum A
1	thaumu	1, 1, 1	1	arc208	46	Candidatus Caldiarchaeum subterraneum
1	thaumu			arc209	47	Thaumarchaeota archaeon SAT1
1	tplasma			arc210	46	Candidatus Methanomassiliicoccus intestinalis Issoire-Mx1
1	tplasma			arc211	46	Candidatus Methanomethylophilus alvus Mx1201
1	tplasma	1, 1, 1	1	arc212	46	Candidatus Methanoplasma termitum MpT1
1	tplasma	1, 1, 1	1	arc213	46	Ferroplasma acidarmanus fer1
1	tplasma	1, 1, 1	1	arc214	47	Picrophilus torridus DSM 9790
1	tplasma	1, 1, 1	1	arc215	46	Thermoplasma acidophilum DSM 1728
1	tplasma	1, 1, 1	1	arc216	46	Thermoplasma volcanium GSS1
1	tplasma	2, 1, 1	1	arc217	46	Thermoplasmatales archaeon BRNA1
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