Proteobacteria

Les protéobactéries sont un groupe très important de bactéries. Ce groupe inclut des bactéries pathogènes, telles Escherichia, Salmonella, Vibrio et Helicobacter. D'autres interviennent dans la fixation biologique de l'azote, la production d'acide acétique (bactéries acétiques) ou l'altération des minéraux (ordre des Burkholderiales)[2].

Proteobacteria

Salmonelles (Salmonella typhimurium), en rouge,
sur une culture de cellules humaines.

Classification
Règne	Bacteria

Embranchement

Proteobacteria
Garrity et al., 2005[1]

Classes de rang inférieur

Voir texte

Classification phylogénétique

Position :

Eubactéries
- Protéobactéries
- groupe :
  - Firmicutes
    - groupe Bacillus / Clostridium
    - Actinobactéries
  - groupe :
    - Cyanobactéries
    - groupe Thermus / Deinococcus
- groupe :
  - Bactéries vertes sulfureuses
  - groupe :
    - Flavobactéries
    - Bactéroïdes
- groupe :
  - Spirochètes
  - Chlamydiales
- Planctomycétales
- Bactéries vertes non sulfureuses
- Aquificales
- Thermotogales

Le terme protéobactéries provient du dieu grec Protée, une divinité marine qui avait la capacité de se métamorphoser, en référence à la grande variété de formes au sein de ce groupe.

La plupart des protéobactéries sont mobiles grâce à un flagelle, mais d'autres peuvent être immobiles ou se déplacer par glissement. Ces derniers sont les Myxobacteria, un groupe unique de bactéries capables de s'agréger formant des corps fructifiants multicellulaires ; elles présentent aussi une grande variété de métabolismes. La plupart sont anaérobies et hétérotrophes, comme les animaux, mais les exceptions sont nombreuses. Certaines protéobactéries, les bactéries pourpres, sont autotrophes et photosynthétiques. Les protéobactéries sont à Gram négatif, c’est-à-dire qu'elles possèdent une membrane externe composée de lipopolysaccharides (LPS) mais pauvre en peptidoglycane.

Selon la théorie endosymbiotique, les mitochondries présentes dans les eukaryotes, et qui leur permettent de « gérer » l'énergie grâce à l'ATP, proviennent de protéobactéries incorporées au sein d'archéobactéries par endosymbiose.

Subdivisions

L'analyse de la séquence du gène codant l'acide ribonucléique ribosomique 16S permet de diviser les protéobactéries en 5 catégories, allant de α à ε. (6 en 2007 avec ζ).

Alpha Proteobacteria

Caulobacterales — par exemple Caulobacter
Parvularculales
Rhizobiales — par exemple Rhizobium
Rhodobacterales
Rhodospirillales — par exemple Acetobacter
Rickettsiales — par exemple Rickettsia
Sphingomonadales — par exemple Sphingomonas

Beta Proteobacteria

Burkholdériales — par exemple Bordetella
Hydrogenophilales
Methylophilales
Neisseriales — par exemple Neisseria
Nitrosomonadales
Rhodocyclales
Procabacteriales
Comamonadaceæ — par exemple Ideonella sakaiensis

Gamma Proteobacteria

Acidithiobacillales
Æromonadales — par exemple Æromonas
Alteromonadales — par exemple Pseudoalteromonas
Cardiobactériales
Chromatiales — bactéries poupres
Enterobactériales — par exemple Escherichia
Legionellales — par exemple Legionella
Methylococcales
Oceanospirillales
Pasteurellales — par exemple Hæmophilus
Pseudomonadales — par exemple Pseudomonas
Thiotrichales — par exemple Thiomargarita
Vibrionales — par exemple Vibrio
Xanthomonadales — par exemple Stenotrophomonas

Delta Proteobacteria

Bdellovibrionales — par exemple Bdellovibrio
Desulfobacterales
Desulfovibrionales
Desulfurellales
Desulfuromonadales — par exemple Geobacter
Myxococcales — Myxobactéries
Syntrophobacterales

Epsilon Proteobacteria

Campylobacterales — par exemple Helicobacter ou Campylobacter jejuni
Nautiliales

Zeta Proteobacteria

Mariprofundales

Phylogénie

Deltaproteobacteria
NN
- Epsilonproteobacteria
- NN
  - Zetaproteobacteria
  - NN
    - Alphaproteobacteria
    - NN
      - Betaproteobacteria
      - Gammaproteobacteria

Notes et références

ITIS, consulté le 12 septembre 2017
Stéphane Uroz, Christophe Calvaruso, Marie-Pierre Turpault, Pascale Frey-Klett, « Altération microbienne des minéraux », Biofutur, n^o 268,‎ 2006, p. 37-41.

Bibliographie

(en) David Emerson, Jeremy A. Rentz, Timothy G. Lilburn, Richard E. Davis, Henry Aldrich, Clara Chan & Craig L. Moyer, « A Novel Lineage of Proteobacteria Involved in Formation of Marine Fe-Oxidizing Microbial Mat Communities », PLoS ONE, vol. 2, n^o 8, 2007 [lire en ligne].

Liens externes

(en) Référence BioLib : Proteobacteria, E. Stackebrandt, E. G. E. Murray & H. G. Trüper, 1988 (consulté le 12 septembre 2017).
(en) Référence Catalogue of Life : Proteobacteria Garrity et al., 2005 (consulté le 11 décembre 2020).
(fr+en) Référence ITIS : Proteobacteria, Garrity & al., 2005 (+ version anglaise) (consulté le 12 septembre 2017).
(en) Référence Tree of Life Web Project : Proteobacteria (consulté le 12 septembre 2017).
(en) Référence uBio : Proteobacteria, Cavalier-Smith, 2002 (consulté le 12 septembre 2017).
(en) Référence World Register of Marine Species : taxon Proteobacteria (+ liste classes + liste ordres) (consulté le 12 septembre 2017).

Portail de la microbiologie

Cet article est issu de Wikipedia. Le texte est sous licence Creative Commons - Attribution - Partage dans les Mêmes. Des conditions supplémentaires peuvent s'appliquer aux fichiers multimédias.

[ITIS12_septembre_2017-1] ITIS, consulté le 12 septembre 2017

[2] Stéphane Uroz, Christophe Calvaruso, Marie-Pierre Turpault, Pascale Frey-Klett, « Altération microbienne des minéraux », Biofutur, n^o 268,‎ 2006, p. 37-41.