Institut Cochin

L'Institut Cochin est un centre de recherches biomédicales rattaché à l'INSERM, au CNRS et à l'Université de Paris. Il est situé dans le 14e arrondissement de Paris sur le campus de l'hôpital Cochin–Port-Royal. Pierre-Olivier Couraud en est le directeur depuis 2008[1].

Historique

L'hôpital et l'institut doivent leur nom au curé Jean-Denis Cochin (1726-1783)[2], qui fonda en 1782 un hospice destiné aux indigents et ouvriers du faubourg Saint-Jacques, devenu par la suite l'hôpital Cochin. Avec la création des centres hospitalo-universitaires en 1958, un centre de recherche fondamentale et clinique est adjoint à l'hôpital Cochin couplé aux bâtiments locaux de la faculté de médecine de Paris.

En 1967, sous l'impulsion de Georges Schapira[3] et de certains médecins-chercheurs biochimistes de son équipe, Jean-Claude Dreyfus[4] et Jacques Kruh, est créé l'Institut de Pathologie Moléculaire, dont l'objectif est d'aborder les maladies génétiques humaines par une approche originale, car alors encore balbutiante, la biologie moléculaire. Cet institut se développe progressivement au sein de l'actuelle faculté de médecine de l'université Paris Descartes, grâce à de nombreuses personnalités issues de cette formation, telles que Jean Rosa[5], Dominique Labie[6], Jean-Claude Kaplan, Axel Kahn[7] ou encore Jacques Hanoune[8] et Jacques Jami. En 1984, Axel Kahn prendra la direction de l'unité INSERM intitulée Génétique et pathologie moléculaires[9]. En parallèle s'est également développé sur le site de l'hôpital Cochin, depuis les années 1970, un laboratoire orienté vers la rétrovirologie murine, dirigé par Jean-Paul Lévy[10], qui développait des approches immunologiques et d'oncogenèse-leucémogenèse. Dans les années 1990, cette unité fut scindée en deux formations dirigées respectivement par Sylvie Gisselbrecht et Jean-Gérard Guillet[11].

En 1990, l'arrivée sur le campus de nouvelles unités de recherches dirigées par Donny Strosberg, Françoise Russo-Marie[12] et Pascale Briand a fait naître l'idée d'un regroupement des unités de recherche présentes sur le site en un institut unique, fonctionnant sur un mode fédératif. Ainsi, est né l'institut Cochin de Génétique Moléculaire (ICGM) à l'initiative d'Axel Kahn et de Jean-Paul Lévy[13]. D'autres formations viendront par la suite enrichir l'ICGM, en particulier le laboratoire CNRS de Jean Girard ouvrant les thématiques déjà développées au métabolisme et les unités INSERM de Richard Benarous et de Paul-Henri Roméo[14].

L'Institut Cochin est officiellement créé au [13]. Il est issu de la fusion, au sein d'une même structure de recherches, de l'ensemble des laboratoires présents dans l'ICGM. Il constitue alors le premier Centre de Recherches en France dont les trois tutelles sont l'INSERM, le CNRS et l'Université de Paris.

Organisation de l'Institut Cochin
L'Institut Cochin.

L'institut regroupe en 2020 38 équipes de recherche et neuf plateformes technologiques qui regroupent environ 650 personnes dont près de 100 chercheurs, enseignants-chercheurs et 70 hospital-universitaires, 200 ingénieurs, techniciens et administratifs, 110 doctorants, 60 étudiants en Master et des stagiaires de courte durée. 55 personnels techniques sont spécifiquement affectés aux plateformes[15]. Plus de 300 publications annuelles référencées sont produites par les membres de l'Institut Cochin, dont 12-15% dans les journaux internationaux à IF élevé (>10). Entre autres, l'IF moyen de publication est en progression, et a été évalué par une instance indépendante à 6,2 en 2009[16].

Directeurs
  • Jean-Paul Lévy (1990-2001), directeur de l'ICGM
  • Axel Kahn (2002-2007), directeur de l'Institut Cochin
  • Pierre-Olivier Couraud (2008- ), directeur de l'Institut Cochin

Départements de recherche et plateformes techniques

L'Institut Cochin compte trois départements scientifiques et un département technologique, développant des activités de recherches fondamentales en lien, pour certaines, avec les activités cliniques de l'hôpital Cochin.

Département endocrinologie, métabolisme, diabète (EMD)

Les principaux axes de recherche du département Endocrinologie, Métabolisme et Diabète portent sur les réponses physiologiques aux signaux nutritionnels, hormonaux et sur la fonction des récepteurs hormonaux membranaires impliqués dans ces réponses. Ainsi, le diabète[17],[18](diabète de type 1 et diabète de type 2), l'obésité, les tumeurs endocrines de la surrénale et de la thyroïde, sont-ils au cœur des préoccupations des équipes de recherches de ce département, en lien avec les services de diabétologie et d'endocrinologie de l'hôpital Cochin.

Département développement, reproduction, cancer (DRC)

Les centres d'intérêt du Département développement, reproduction et cancer convergent sur l'étude des mécanismes cellulaires et moléculaires contrôlant la prolifération, la différenciation et le destin cellulaire, au cours du développement. La régulation génétique et épigénétique, l'étude des cellules souches, les conséquences tissulaires du stress oxydant et de l'inflammation font également l'objet d'études spécifiques. Les cancers du sang, du foie, de l'intestin[19], certaines maladies neurologiques et musculaires ainsi que les pathologies de la reproduction et de la grossesse sont les principales maladies ciblées par ce département, en lien avec les services correspondants d'hématologie, de cancérologie et de la maternité du groupe hospitalier Cochin[20].

Département infection, immunité, inflammation (3I)

Les équipes du département Infection, Immunité et Inflammation étudient au niveau moléculaire les interactions entre certains agents infectieux viraux, parasitaires ou bactériens (virus du SIDA, plasmodium, streptocoque, méningocoque, shigella…) et leurs hôtes cellulaires. Les réponses immunitaires innées et adaptatives sont un des centres d'intérêt de ce département, de même que la physiopathologie des maladies infectieuses associées : SIDA[21], paludisme[22],[23], infections bactériennes du nourrisson et de l'adulte[24],[25], maladies auto-immunes et dérégulations immunitaires lors de cancers[26],[27].

Les équipes de l'Institut Cochin sont activement impliquées dans différents programmes d'investissement d'avenir : laboratoires d'excellence (Labex Who Am I[28], GRex[29], Parafrap[30], Revive[31], Ibeid[32], Inflamex[33]), les départements hospitalo-universitaires (DHU Risques et grossesse[34] et Maladies autoimmunes et hormonales) ou le site de recherches intégrées sur le cancer (SIRIC[35]), dont l'objectif est l'identification de biomarqueurs génétiques ou épigénétiques et la recherche de progrès diagnostiques, pronostiques et thérapeutiques.

Plateformes technologiques

Les équipes de recherche de l'institut Cochin bénéficient de l'activité de nombreuses plateformes technologiques dont la plupart des prestations sont ouvertes aux équipes extérieures à l'Institut, qu'elles soient publiques ou privées. Depuis 2008, toutes les plateformes sont certifiées ISO9001 par l'afaq[36].

  • Cytométrie et immunobiologie ; cette plateforme met à disposition des utilisateurs des analyseurs et trieurs de cellules par cytométrie de flux, et développe de nombreux tests d'immunologie-cellulaire ;
  • Génomique, consacrée à l'étude du génome et du transcriptome, cette plateforme utilise essentiellement la PCR en temps réel et les puces à ADN, et a récemment mis en place le séquençage à très haut débit de nouvelle génération en partenariat avec le service de génétique de l'hôpital Cochin ;
  • Histologie et microdissection laser ; cette plateforme offre de multiples prestations liées à l'analyse histologique de tissus humains et murins ;
  • Deux plateformes d'imagerie cellulaire photonique et électronique pemettant l'analyse par imagerie de fluorescence (microscopie confocale ou bi-photonique) ou par microscopie électronique en transmission de cellules en culture et de tissus sains ou pathologiques, infectés ou non par les agents pathogènes étudiés ;
  • Protéomique, plateforme labellisée par l'Université de Paris (plateforme Protéomique 3P5[37]), elle propose divers types d'analyse de complexes protéiques par spectrométrie de masse ainsi que l'analyse différentielle de cellules ou tissus par électrophorèse bidimensionnelle ;
  • Recombinaison homologue, transfert d'embryons et cryoconservation ; l'objectif de cette plateforme est la création de modèles murins de maladies humaines par ingénierie génétique (invalidation génique ou réexpression génique). Elle assure également la congélation des lignées de souris produites et leur reviviscence par transfert d'embryons.
  • Plateau technique de biomécanique de la cellule[38].
  • Plateforme d'analyse métabolique des petits animaux[39].

Activité de formation et de vulgarisation

En dehors de son activité principale de recherche fondamentale et biomédicale, l'institut Cochin a vocation de formation par la recherche. Il accueille en effet environ 70 chercheurs non statutaires de toutes nationalités et 110 doctorants, ainsi qu'une soixantaine d'étudiants en Master. Ces jeunes chercheurs sont regroupés au sein de l'association JeCCo[40] (« Jeunes chercheurs de Cochin ») qui organise régulièrement des manifestations scientifiques[41], des rencontres professionnelles[42] et des réunions d'échanges avec des associations de jeunes chercheurs sur d'autres sites.

Enfin, l'institut Cochin participe également à différentes initiatives de formation et d'information du public, en accueillant en particulier des collégiens et lycéens des arrondissements voisins dans le cadre de l'action "Apprentis chercheurs" soutenue par l'association Arbre des Connaissances[43]. En partenariat avec des associations de malades ou des fondations caritatives, comme Vaincre la mucoviscidose ou le Sidaction, des visites de l'institut sont organisées pour des donateurs ou des patients et leurs familles[44],[45]. L'institut participe activement à la Fête de la Science depuis 2014.

Notes et références
  1. « Nominations de l'Administration centrale des laboratoires », sur www.dgdr.cnrs.fr,
  2. « Histoire des hôpitaux », sur paris-promeneurs.com
  3. « Histoire de l'Inserm - Georges Schapira », sur histoire.inserm.fr
  4. « Histoire de l'Inserm - Jean-Claude Dreyfus », sur histoire.inserm.fr
  5. « Histoire de l'Inserm - Jean Rosa », sur histoire.inserm.fr
  6. « Histoire de l'Inserm - Dominique Labie », sur histoire.inserm.fr
  7. « Histoire de l'Inserm - Axel Kahn », sur histoire.inserm.fr
  8. « Histoire de l'Inserm - Jacques Hanoune », sur histoire.inserm.fr
  9. « Actualité de l'INSERM n°40 avril 1986 », sur histoire.inserm.fr,
  10. « Histoire de l'Inserm - Jean-Paul Lévy », sur histoire.inserm.fr
  11. « Histoire de l'Inserm - Jean-Gérard Guillet », sur histoire.inserm.fr
  12. « Histoire de l'Inserm - Françoise Russo-Marie », sur histoire.inserm.fr
  13. « Histoire de l'Hôpital Cochin », sur histoire.inserm.fr
  14. « Biographie Paul-Henri Roméo », sur www.aviesan.fr
  15. (en) « Activity report Institut Cochin 2016 », sur http://www.institutcochin.fr
  16. « Evaluation par l'Aeres de l'Institut Cochin 2009 », sur www.aeres-evalutation.fr,
  17. « Des lymphocytes font le lien entre obésité et diabète de type 2 », sur www.industrie.com,
  18. « Diabète : 4 projets de recherche récompensés », sur www.doctissimo.fr,
  19. « AUTOPHAGIE ET CANCER DU CÔLON : UNE NOUVELLE PISTE », sur www.medecine.parisdescartes.fr
  20. « Département DRC », sur www.institutcochin.fr
  21. « Institut COCHIN », sur sidasciences.inist.fr,
  22. « Le Viagra serait efficace pour lutter contre... le paludisme », sur www.europe1.fr,
  23. « Equipe Lavazec », sur www.institutcochin.fr
  24. « Equipe Barrières et Pathogènes », sur www.institutcochin.fr
  25. « Streptocoques B : des mutations détectées chez certains nourrissons », sur www.ladepeche.fr,
  26. « Origine des maladies auto-immunes : le scénario se confirme », sur www.futura-sciences.com,
  27. « Maladies auto-immunes », sur www.institutcochin.fr
  28. « Labex Who Am I? », sur www.labex-whoami.fr
  29. « Labex GRex », sur www.labex-grex.com
  30. « Labex Parafrap », sur www.labex-parafrap.fr
  31. « Labex Revive », sur www.pasteur.fr
  32. « Labex Ibeid », sur www.pasteur.fr
  33. « Labex Inflamex », sur www.inflamex.fr
  34. « DHU "Risque et grossesse" », sur www.u953.idf.inserm.fr
  35. « SIRIC », sur www.e-cancer.fr
  36. « Certification ISO9001 de 2008 », sur www.ibisa.net,
  37. « page web 3P5 université Paris Descartes », sur 3p5.medecine.univ-paris5.fr
  38. Plate-forme de biomécanique de la cellule, Institut Cochin, consulté le 14 avril 2021.
  39. Métabolique, Institut Cochin, consulté le 14 avril 2021.
  40. « Association JeCCo », sur www.institutcochin.fr
  41. « Symposia Jecco », sur www.jeccoteam.wixsite.com
  42. « PETIT DÉJEUNER PRO DU 2 JUIN 2015 », sur www.doc-up.info,
  43. « Association l'Arbre des Connaissances », sur www.arbre-des-connaissances-apsr.org
  44. « Visite du Sidaction à l'institut Cochin », sur www.institutcochin.fr,
  45. « VAINCRE LA MUCOVISCIDOSE VISITE LE SITE DE COCHIN », sur /www.vaincrelamuco.org,

Lien externe
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