OBO Foundry

Le Consortium d'Open Biological and Biomedical Ontologies (OBO) ("OBO Foundry" en anglais) est un groupe de personnes dédiées à la construction et à la maintenance d'ontologies liées aux sciences de vie et qui suivent le format de Open Biomedical Ontologies (OBO) .[1] La fonderie OBO établit un ensemble de principes pour le développement d'ontologies pour créer une suite d'ontologies de référence interopérables dans le domaine biomédical. Actuellement, il existe plus d'une centaine d'ontologies qui suivent les principes de la fonderie OBO.

OBO Foundry

L'effort OBO Foundry facilite l'intégration des résultats biomédicaux et les analyses de Bio-informatique. Il le fait en offrant une référence structurée pour les termes de différents domaines de recherche et leurs interconnexions (par exemple: un phénotype dans un modèle de souris et son phénotype associé chez le poisson-zèbre).[2]

Références

« The OBO Foundry: coordinated evolution of ontologies to support biomedical data integration », Nature Biotechnology, vol. 25, n^o 11,‎ novembre 2007, p. 1251–5 (PMID 17989687, PMCID 2814061, DOI 10.1038/nbt1346)
Christopher J Mungall, Georgios V Gkoutos, Smith et Melissa A Haendel, « Integrating phenotype ontologies across multiple species », Genome Biology, vol. 11, n^o 1,‎ 2010, R2 (ISSN 1465-6906, PMID 20064205, PMCID 2847714, DOI 10.1186/gb-2010-11-1-r2)

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[:0-1] « The OBO Foundry: coordinated evolution of ontologies to support biomedical data integration », Nature Biotechnology, vol. 25, n^o 11,‎ novembre 2007, p. 1251–5 (PMID 17989687, PMCID 2814061, DOI 10.1038/nbt1346)

[2] Christopher J Mungall, Georgios V Gkoutos, Smith et Melissa A Haendel, « Integrating phenotype ontologies across multiple species », Genome Biology, vol. 11, n^o 1,‎ 2010, R2 (ISSN 1465-6906, PMID 20064205, PMCID 2847714, DOI 10.1186/gb-2010-11-1-r2)