MetaCyc

La base de données MetaCyc contient un grand nombre d'informations sur le métabolisme et les enzymes de nombreux êtres vivants : structure des enzymes, cofacteurs, activateurs et inhibiteurs, spécificités de substrat, et, dans certains cas, constantes cinétiques. Elle fournit également des commentaires et des références dans la littérature. MetaCyc recueille essentiellement des données expérimentales sur les voies métaboliques[1]^,[2].

MetaCyc est utilisée comme jeu de données de référence en vue de prédire le métabolisme d'êtres vivants en fonction du séquençage de leur génome ; cela a été notamment le cas de centaines d'organismes, y compris ceux du BioCyc Database Collection.

Références

(en) « Publications MetaCyc »
(en) Caspi R, Foerster H, Fulcher CA, et al., « The MetaCyc Database of metabolic pathways and enzymes and the BioCyc collection of Pathway/Genome Databases », Nucleic Acids Res., vol. 36,‎ janvier 2008, D623–31 (PMID 17965431, PMCID 2238876, DOI 10.1093/nar/gkm900, lire en ligne)

Lien externe

MetaCyc.org

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[1] (en) « Publications MetaCyc »

[2] (en) Caspi R, Foerster H, Fulcher CA, et al., « The MetaCyc Database of metabolic pathways and enzymes and the BioCyc collection of Pathway/Genome Databases », Nucleic Acids Res., vol. 36,‎ janvier 2008, D623–31 (PMID 17965431, PMCID 2238876, DOI 10.1093/nar/gkm900, lire en ligne)