Liaison secondaire

Le pont disulfure est la seule liaison secondaire covalente existante; elle est le résultat de l'association de deux groupements thiol ( -SH), ce qui donne donc le pont disulfure ( S-S ), avec bien entendu un dégagement d'atomes d'hydrogène. Le groupement thiol se retrouve en particulier sur un acide aminé nommé cystéine, appartenant aux acides aminés contenant un groupement thiol dans leur radical (la méthionine fait également partie de ce groupe). L'exemple le plus simple étant la formation d'une molécule de cystine à partir de l'oxydation de deux molécules de cystéine.

La liaison hydrogène correspond à une forte attraction électrostatique entre un atome d'hydrogène électropositif d'une molécule polaire et un atome électronégatif appartenant à une molécule polaire voisine. L'atome formant la liaison avec celui d'hydrogène doit alors être suffisamment électronégatif pour le rendre beaucoup plus électropositif.

Aussi, seuls les atomes d'oxygène, d'azote, de fluor et de soufre sont en général assez électronégatifs pour engendrer une dépolarisation suffisante. De même, seuls les atomes d'oxygène, d'azote, de soufre (à condition de n'être couplé qu'à un seul radical et de posséder une charge négative) et de fluor peuvent établir une liaison hydrogène avec l'atome d'hydrogène polarisé. Une telle liaison est caractérisée par une énergie de liaison de -10 à -40 kJ/mol. En phase liquide elles sont sans cesse rompues et reformées tandis qu'en phase solide elles assurent la cohésion du cristal (eau sous forme de glace par exemple). Elles permettent ainsi de favoriser certaines réactions acido-basiques.

Les forces de van der Waals sont des forces qui se créent au niveau des atomes et qui fixent les distances inter-atomiques ; c'est donc une attraction non spécifique entre deux atomes.