Facteur de fertilité

Le facteur de fertilité (nommé facteur F par sa découvreuse Esther Lederberg au milieu du XXe siècle ; aussi nommé plasmide F, ou encore sex factor chez E. coli ou F sex factor ; ou encore plasmide-F)[1],[2],[3] permet le transfert de gènes d'une bactérie portant ce facteur à une autre bactérie dépourvue du facteur par conjugaison.

Ce facteur F est porté sur l'épisome F, le premier épisome découvert. Contrairement aux autres plasmides, le facteur F est constitutif des protéines de transfert en raison d'une mutation du gène finO[4]. Le plasmide F appartient à une classe de plasmides dits « conjugatifs » qui contrôlent les fonctions sexuelles de bactéries dotées d'un système d'inhibition de la fertilité.

Découverte

Esther M. Lederberg et Luigi L. Cavalli-Sforza ont découvert F[5], travail ensuite publié avec Joshua Lederberg en 1952[6]. Une fois ces résultats annoncés, deux autres laboratoires ont rejoint les études. « Ce ne fut pas une découverte indépendante simultanée de F (je nomme comme facteur de fertilité jusqu'à ce qu'il soit compris). Nous avons écrit à Hayes, Jacob et Wollman qui ont ensuite poursuivi leurs travaux[7]. » La découverte de F a parfois été confondue avec la découverte par le généticien William Hayes d'un « facteur sexuel », bien qu'il n'ait jamais revendiqué la primauté. En effet, « il [Hayes] pensait que F était vraiment lambda, et lorsque nous l'avons convaincu [qu'il n'en était rien], il a alors commencé son travail »[8].

Structure

Les segments fonctionnels les plus courants constituant les facteurs F sont[9] :

  • OriT (origin fo transfert) : séquence marquant le point de départ du transfert conjugatif ;
  • OriC (Origine of replication) : séquence marquant le point de départ, à partir duquel l'ADN plasmidique sera répliqué dans la cellule réceptrice ;
  • tra-region (gènes de transfert) : gènes codant le processus de transfert du F-Pilus et de l'ADN ;
  • IS (Insertion séquence) : éléments d'insertion composés d'une copie d'IS2, de deux copies d'IS3 et d'une copie d'IS1000 : gènes dits « égoïstes » (fragments de séquence pouvant intégrer des copies d'eux-mêmes à des emplacements différents)[10].

Certains gènes plasmidiques F et leur fonction :

Relation avec le génome

L'épisome qui héberge le facteur F peut exister sous forme de plasmide indépendant, ou s'intègre dans le génome de la cellule bactérienne. Il existe plusieurs noms pour différents états possibles :

  • cellule Hfr (pour high-frequency recombination cell), qui possèdent la totalité de l'épisome F intégrée dans le génome bactérien ;
  • bactérie F+ qui possède le facteur F comme plasmide indépendant du génome bactérien. Le plasmide F ne contient que l'ADN du facteur F, et aucun ADN du génome bactérien ;
  • bactérie F (F-prime), formée par une excision incorrecte du chromosome, ce qui entraîne la présence dans le plasmide F de séquences bactériennes situées à proximité de l'endroit où l'épisome F a été inséré ;
  • bactérie F−, qui ne contient pas de facteur F et agit comme réceptrice.

Fonction

Lorsqu'une cellule F+ se conjugue / s'accouple avec une cellule F−, il en résulte deux cellules F+, toutes deux capables de transmettre le plasmide à d'autres cellules F− par conjugaison. Le plasmide F appartient à une classe de plasmides conjugatifs qui contrôlent les fonctions sexuelles de bactéries avec un système d'inhibition de la fertilité. Dans ce système, un facteur agissant en trans-, FinO, et des ARN antisens, FinP, se combinent pour réprimer l'expression du gène activateur TraJ. TraJ est un facteur de transcription qui régule à la hausse l'opéron tra. L'opéron tra comprend les gènes nécessaires à la conjugaison et au transfert de plasmide. Ceci signifie qu'une bactérie F+ peut toujours agir en tant que cellule donneuse. Le gène finO du plasmide F d'origine (dans Escherichia coli K12) est interrompu par une insertion de IS3, entraînant une expression constitutive du tra-opéron[11],[12]. Les cellules F+ ont également à leur surface des « protéines d'exclusion » TraS et TraT. Ces protéines empêchent les événements de couplage secondaires impliquant des plasmides appartenant au même groupe d'incompatibilité (Inc). Ainsi, chaque bactérie F+ ne peut héberger qu'un seul type de plasmide d'un groupe d'incompatibilité donné.

Dans le cas du transfert de Hfr, les transconjugués résultants sont rarement Hfr. Le résultat de la conjugaison Hfr/F− est une souche F− avec un nouveau génotype. Lorsque les plasmides F-prime sont transférés dans une cellule bactérienne receveuse, ils portent des fragments de l'ADN du donneur qui peuvent devenir importants pour la recombinaison.

Dans le domaine du génie génétique, les bioingénieurs ont ainsi pu créer des plasmides F pouvant contenir de l’ADN étranger inséré ; c'est ce qu'on appelle un « chromosome artificiel bactérien ».

Voir aussi

Articles connexes

Références
  1. Gordon Dugger, A dictionary of life sciences., Londres, Macmillan), , 232 p. (ISBN 978-0-333-19436-2), p. 130
  2. Robert Hine, A dictionary of biology, Oxford, Oxford University Press, , 6e éd., 736 p. (ISBN 978-0-19-920462-5), p. 592
  3. TD Lawley, WA Klimke, MJ Gubbins et LS Frost, « F factor conjugation is a true type IV secretion system. », FEMS Microbiology Letters, vol. 224, no 1,‎ , p. 1–15 (PMID 12855161, DOI 10.1016/S0378-1097(03)00430-0)
  4. Y Yoshioka, H Ohtsubo et E Ohtsubo, « Repressor gene finO in plasmids R100 and F: constitutive transfer of plasmid F is caused by insertion of IS3 into F finO. », Journal of Bacteriology, vol. 169, no 2,‎ , p. 619–623 (ISSN 0021-9193, PMID 3027040, PMCID 211823, DOI 10.1128/jb.169.2.619-623.1987)
  5. Esther Lederberg : « At this same time, L. Cavalli in Milan Italy, discovered the phenomenon of sterility from a different angle. Exchange of data showed that if I had done an experiment, he had planned to do it, but had completed another that we had planned. So we decided to pool forces and collaborate. » http://www.estherMlederberg.com/Clark_MemorialVita/HISTORY52.html
  6. Lederberg, J., Cavalli, L. L. et Lederberg, E. M., Nov. 1952, Sex compatibility in Escherichia coli, Genetics, 37(6):720-730
  7. http://www.estherMlederberg.com/Clark_MemorialVita/Eric%202%20FFactor5.html
  8. http://www.estherMlederberg.com/Clark_MemorialVita/Eric%201%20FFactor5.html
  9. (en) Denis Arutyunov et Laura S. Frost, « F conjugation: Back to the beginning », Plasmid, vol. 70, no 1,‎ , p. 18–32 (ISSN 0147-619X, PMID 23632276, DOI 10.1016/j.plasmid.2013.03.010, lire en ligne)
  10. Leland Hartwell, Leroy Hood, Michael L. Goldberg, Ann E. Reynolds et Lee M. Silver, Genetics : From Genes to Genomes, New York, NY, McGraw-Hill, , 4e éd., 816 p. (ISBN 978-0-07-352526-6)
  11. LJ Jerome, van Biesen T et Frost LS, « Degradation of FinP antisense RNA from F-like plasmids: the RNA-binding protein, FinO, protects FinP from ribonuclease E », J. Mol. Biol., vol. 285, no 4,‎ , p. 1457–1473 (PMID 9917389, DOI 10.1006/jmbi.1998.2404)
  12. Arthur DC, Ghetu AF, Gubbins MJ, Edwards RA, Frost LS et Glover JN, « FinO is an RNA chaperone that facilitates sense-antisense RNA interactions », EMBO J., vol. 22, no 23,‎ , p. 6346–55 (PMID 14633993, PMCID 291848, DOI 10.1093/emboj/cdg607)
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