Chloroflexi

Les Chloroflexi sont une classe de l'embranchement Chlorobacteria qui produisent de l'énergie grâce à la photosynthèse. Ils constituent l'essentiel des phototrophes anoxygeniques filamenteux (anciennement connus sous le nom des bactéries vertes non sulfureuses), même si certains sont classés séparément comme les Thermomicrobia. Ils sont nommés ainsi pour leur pigment vert, le plus souvent trouvé dans les organites photosynthétiques appelés chlorosomes.

Chloroflexi

Classification
Règne	Bacteria
Sous-règne	Negibacteria
Infra-règne	Glidobacteria
Embranchement	Chlorobacteria

Classe

Chloroflexi
Garrity & Holt 2001

Classification phylogénétique

Position :

Eubactéries
- Protéobactéries
- groupe :
  - Firmicutes
    - groupe Bacillus / Clostridium
    - Actinobactéries
  - groupe :
    - Cyanobactéries
    - groupe Thermus / Deinococcus
- groupe :
  - Bactéries vertes sulfureuses
  - groupe :
    - Flavobactéries
    - Bactéroïdes
- groupe :
  - Spirochètes
  - Chlamydiales
- Planctomycétales
- Bactéries vertes non sulfureuses
- Aquificales
- Thermotogales

Les chloroflexes sont généralement filamenteux. Ils sont facultativement aérobies, mais ne produisent pas de dioxygène lors de la photosynthèse, contrairement par exemple aux cyanobactéries dont ils sont phylogénétiquement très éloignés. Ils ne peuvent pas non plus fixer biologiquement le dioxyde de carbone, ils sont donc photohétérotrophes. (à l’exception de Chloroflexus aurantiacus qui possède la voie métabolique du 3-Hydroxyproniate bi-cycle permettant la fixation du carbone inorganique en carbone organique[1])

Classification

Classe Chloroflexi

Kouleothrix♠
- Kouleothrix aurantiaca♠
Chloroflexales
- Dehalobium♠
  - Dehalobium chlorocoercia♠
- Chloroflexaceae
  - Chloroflexus
    - C. aggregans
    - C. aurantiacus
  - Chloronema
    - Chloronema giganteum
  - Heliothrix
    - Heliothrix oregonensis
  - Roseiflexus
    - Roseiflexus castenholzii
- Oscillochloridaceae
  - Oscillochloris
    - O. chrysea
    - O. trichoides
Herpetosiphonales
- Herpetosiphonaceae
  - Herpetosiphon
    - H. aurantiacus
    - H. geysericola

Note: ♠ Strain found at the National Center for Biotechnology Information (NCBI) but not recognised by List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) or published by International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB/IJSEM).

Arbre phylogénétique de base des chloroflèxes

Cet arbre simplifié permet de naviguer directement vers les catégories les plus importantes. La classification phylogénétique détaillée du groupe considéré est stockée dans les catégories indiquées.

─o CHLOROFLEXI
 ├─o HERPETOSIPHONALES
 └─o CHLOROFLEXALES
   ├─o Chloroflexaceae
   └─o Oscillochloridaceae

Position dans l’arbre phylogénétique

─o BACTERIA
 ├─o CHLOROBACTERIA
 │ ├─o Dehalococcoidetes
 │ ├─o Thermomicrobia
 │ │ ├─o Sphaerobacterales
 │ │ └─o Thermomicrobiales
 │ └─o
 │   ├─o Anaerolinaeles
 │   └─o CHLOROFLEXI
 └─o
   ├─o Hadobacteria
   └─o
     ├─o Cyanobacteria
     └─o
       ├─o Gracilicutes
       └─o Eurybacteria

Liens externes

(en) Référence Tree of Life Web Project : Chloroflexi
(en) Référence Catalogue of Life : Chloroflexi Garrity & Holt, 2002 (consulté le 11 décembre 2020)
(en) Référence NCBI : Chloroflexi (taxons inclus)

Bibliographie

Euzéby, J.P. (1997). "List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a folder available on the Internet". Int J Syst Bacteriol 47 (2): 590-2. (ISSN 0020-7713). PMID 9103655. http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/47/2/590.
Hugenholtz P, Stackebrandt E (2004). "Reclassification of Sphaerobacter thermophilus from the subclass Sphaerobacteridae in the phylum Actinobacteria to the class Thermomicrobia (emended description) in the phylum Chloroflexi (emended description)". ""Int. J. Syst. Evol. Microbiol.
Maymo-Gatell, X., Chien, Y., Gossett, J.M., and Zinder, S.H. "Isolation of a bacterium that reductively dechlorinates tetrachloroethene to ethene." Science (1997) 276:1568-1571.
Moe, W.M., Yan, J., Nobre, M.F., da Costa, M.S., and Rainey, F.A. "Dehalogenimonas lykanthroporepellens gen. nov., sp. nov., a reductive dehalogenating bacterium isolated from chlorinated solvent-contaminated groundwater." Int. J. Syst. Evol. Microbiol. (in press)

Notes et références

Jan Zarzycki, Volker Brecht, Michael Müller et Georg Fuchs, « Identifying the missing steps of the autotrophic 3-hydroxypropionate CO2 fixation cycle in Chloroflexus aurantiacus », Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 106, n^o 50,‎ 15 décembre 2009, p. 21317–21322 (PMID 19955419, PMCID PMC2795484, DOI 10.1073/pnas.0908356106, lire en ligne, consulté le 6 août 2018)

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[1] Jan Zarzycki, Volker Brecht, Michael Müller et Georg Fuchs, « Identifying the missing steps of the autotrophic 3-hydroxypropionate CO2 fixation cycle in Chloroflexus aurantiacus », Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 106, n^o 50,‎ 15 décembre 2009, p. 21317–21322 (PMID 19955419, PMCID PMC2795484, DOI 10.1073/pnas.0908356106, lire en ligne, consulté le 6 août 2018)