Xanthomonas

Xanthomonas est un genre de Protéobacteries de la famille des Xanthomonadaceae, dont beaucoup d'espèces causent des maladies des plantes.

Xanthomonas

infection par Xanthomonas campestris pv. hederae
sur feuille de lierre

Classification
Règne	Bacteria
Division	Proteobacteria
Classe	Gammaproteobacteria
Ordre	Xanthomonadales
Famille	Xanthomonadaceae

Genre

Xanthomonas
Dowson, 1939

C'est un genre de bactéries très étudié, car affectant des organismes d'intérêt économique pour l'humanité.

Ainsi, des collections de référence de cultures de souches de Xanthomonas ont été rassemblées par la National Collection of Plant Pathogenic Bacteria (NCPPB) au Royaume-Uni, par l' International Collection of Microorganisms from Plants (ICMP) en Nouvelle-Zélande, par la Collection française de bactéries associées aux plantes (CFBP) en France et la Collection russe de micro-organismes (VKM) en Russie et la Microbial type culture collection and gene bank (MTCC) en Inde.

C'est par ailleurs chez cette bactérie qu'ont été découverts les domaines protéiques TALE qui sont utilisés en biotechnologie.

Pathogenèse

Xanthomonas peut infecter beaucoup d'espèces cultivées telles que le poivre, le riz, le citron, le coton, la prune, la cerise, la pêche, la tomate et le soja[1].

Certaines espèces de Xanthomonas causent des taches localisées sur les feuilles ou des cercosporioses tandis que d'autres espèces se propagent de manière systémique dans la plante (pourriture noire, maladie de la brûlure des feuilles)[2]. Ces bactéries contournent les défenses immunitaires de leurs hôtes et injectent un certain nombre de protéines effectrices (TAL effecteurs notamment), dans la plante via leur système de sécrétion de type III. Ces protéines peuvent se lier aux séquences de gènes promoteurs et activer l'expression de certains gènes de la plante d'une manière qui favorise l'infection par la bactérie.

Des plantes, notamment une variété de riz, sont en cours de sélection pour développer la résistance aux Xanthomonas. Pour cela, la technique des TALENs, justement découverte chez ce genre de bactéries, sert à créer des gènes de résistance[3]^,[4].

Liste d'espèces

Selon Catalogue of Life (23 juillet 2014)[5] :

Xanthomonas albilineans
Xanthomonas arboricola
Xanthomonas axonopodis
Xanthomonas bromi
Xanthomonas campestris
Xanthomonas cassavae
Xanthomonas citri
Xanthomonas codiaei
Xanthomonas cucurbitae
Xanthomonas cynarae
Xanthomonas euvesicatoria
Xanthomonas fragariae
Xanthomonas gardneri
Xanthomonas hortorum
Xanthomonas hyacinthi
Xanthomonas melonis
Xanthomonas oryzae
Xanthomonas perforans
Xanthomonas phaseoli
Xanthomonas pisi
Xanthomonas populi
Xanthomonas saccari
Xanthomonas sacchari
Xanthomonas theicola
Xanthomonas translucens
Xanthomonas vasicola
Xanthomonas vesicatoria

Liste des espèces, sous-espèces, variétés et non-classés

Selon NCBI (23 juillet 2014)[6] :

Pseudomonas cissicola
Xanthomonas albilineans
Xanthomonas alfalfae
- sous-espèce Xanthomonas alfalfae subsp. alfalfae
- sous-espèce Xanthomonas alfalfae subsp. citrumelonis
  - non-classé Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1
Xanthomonas arboricola
- non-classé Xanthomonas arboricola pv. celebensis
- non-classé Xanthomonas arboricola pv. corylina
- non-classé Xanthomonas arboricola pv. fragariae
- non-classé Xanthomonas arboricola pv. juglandis
- non-classé Xanthomonas arboricola pv. populi
- non-classé Xanthomonas arboricola pv. pruni
Xanthomonas axonopodis
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. alfalfae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. allii
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. aurantifolii
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. axonopodis
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. bauhiniae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. begonia
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. begoniae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. betlicola
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. biophyti
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. cajani
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. cassavae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. cassiae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. clitoriae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. commiphorae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. coracanae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. cyamopsidis
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. desmodii
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. desmodiigangetici
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. desmodiilaxiflori
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. desmodiirotundifolii
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. erythrinae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. fascicularis
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. fici
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. glycines
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. khayae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. lespedezae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. maculifoliigardeniae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. martyniicola
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. melhusii
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. nakataecorchori
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. patelii
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. pedalii
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. phyllanthi
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. physalidicola
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. poinsettiicola
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. punicae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. rhynchosiae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. ricini
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. rosa
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. sesbaniae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. spondiae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. syngonii
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. tamarindi
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. vasculorum
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. vignaeradiatae
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. vignicola
- non-classé Xanthomonas axonopodis pv. vitians
Xanthomonas bromi
Xanthomonas campestris
- non-classé Xanthomonas campestris pv. aberrans
- non-classé Xanthomonas campestris pv. alangii
- non-classé Xanthomonas campestris pv. amaranthicola
- non-classé Xanthomonas campestris pv. amoraciae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. amorphophalli
- non-classé Xanthomonas campestris pv. aracearum
- non-classé Xanthomonas campestris pv. arecae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. argemones
- non-classé Xanthomonas campestris pv. armoraciae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. arracaciae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. azadirachtae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. badrii
- non-classé Xanthomonas campestris pv. barbareae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. begoniae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. betae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. blepharidis
- non-classé Xanthomonas campestris pv. campestris
- non-classé Xanthomonas campestris pv. cannabis
- non-classé Xanthomonas campestris pv. cannae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. capsularii
- non-classé Xanthomonas campestris pv. carissae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. carotae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. centellae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. clerodendri
- non-classé Xanthomonas campestris pv. convolvuli
- non-classé Xanthomonas campestris pv. coriandri
- non-classé Xanthomonas campestris pv. cyanopsidis
- non-classé Xanthomonas campestris pv. daturae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. dieffenbachiae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. durantae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. esculenti
- non-classé Xanthomonas campestris pv. euphorbiae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. fici
- non-classé Xanthomonas campestris pv. glycines
- non-classé Xanthomonas campestris pv. guizotiae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. gummisudans
- non-classé Xanthomonas campestris pv. hederae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. heliotropii
- non-classé Xanthomonas campestris pv. incanae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. ionidii
- non-classé Xanthomonas campestris pv. lantanae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. lawsoniae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. leeana
- non-classé Xanthomonas campestris pv. leersiae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. malloti
- non-classé Xanthomonas campestris pv. merremiae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. mirabilis
- non-classé Xanthomonas campestris pv. musacearum
- non-classé Xanthomonas campestris pv. nigromaculans
- non-classé Xanthomonas campestris pv. olitorii
- non-classé Xanthomonas campestris pv oryzae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. papavericola
- non-classé Xanthomonas campestris pv. parthenii
- non-classé Xanthomonas campestris pv. paulliniae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. pelargonii
- non-classé Xanthomonas campestris pv. pennamericanum
- non-classé Xanthomonas campestris pv. phaseoli
- non-classé Xanthomonas campestris pv. phormiicola
- non-classé Xanthomonas campestris pv. physalidis
- non-classé Xanthomonas campestris pv. plantaginis
- non-classé Xanthomonas campestris pv. poinsettiicola
- non-classé Xanthomonas campestris pv. raphani
- non-classé Xanthomonas campestris pv. sesami
- non-classé Xanthomonas campestris pv. spermacoces
- non-classé Xanthomonas campestris pv. syngonii
- non-classé Xanthomonas campestris pv. thespesiae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. thirumalacharii
- non-classé Xanthomonas campestris pv. tribuli
- non-classé Xanthomonas campestris pv. trichodesmae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. uppalii
- non-classé Xanthomonas campestris pv. vasculorum
- non-classé Xanthomonas campestris pv. vasicola
- non-classé Xanthomonas campestris pv. veroniae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. viegasii
- non-classé Xanthomonas campestris pv. vignicola
- non-classé Xanthomonas campestris pv. vitians
- non-classé Xanthomonas campestris pv. viticola
- non-classé Xanthomonas campestris pv. vitiscarnosae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. vitistrifoliae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. vitiswoodrowii
- non-classé Xanthomonas campestris pv. zantedeschiae
- non-classé Xanthomonas campestris pv. zingibericola
- non-classé Xanthomonas campestris pv. zinniae
Xanthomonas cassavae
non-classé Xanthomonas citri group
- Xanthomonas citri
  - non-classé Xanthomonas citri pv. anacardii
  - non-classé Xanthomonas citri pv. aurantifolii
  - non-classé Xanthomonas citri pv. bauhiniae
  - non-classé Xanthomonas citri pv. bilvae
  - non-classé Xanthomonas citri pv. cajani
  - non-classé Xanthomonas citri pv. citri
  - non-classé Xanthomonas citri pv. clitoriae
  - non-classé Xanthomonas citri pv. desmodiilaxiflori
  - non-classé Xanthomonas citri pv. glycines
  - non-classé Xanthomonas citri pv. malvacearum
  - non-classé Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae
  - variété Xanthomonas citri pv. phaseoli var. fuscans
  - non-classé Xanthomonas citri pv. rhynchosiae
  - non-classé Xanthomonas citri pv. sesbaniae
  - non-classé Xanthomonas citri pv. vignicola
  - sous-espèce Xanthomonas citri subsp. citri
  - sous-espèce Xanthomonas citri subsp. malvacearum
- Xanthomonas fuscans
  - sous-espèce Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii
  - sous-espèce Xanthomonas fuscans subsp. fuscans
Xanthomonas codiaei
Xanthomonas cucurbitae
Xanthomonas cynarae
Xanthomonas dyei
- non-classé Xanthomonas dyei pv. dysoxyli
- non-classé Xanthomonas dyei pv. eucalypti
- non-classé Xanthomonas dyei pv. laureliae
Xanthomonas euvesicatoria
Xanthomonas fragariae
Xanthomonas gardneri
Xanthomonas hortorum
- non-classé Xanthomonas hortorum pv. carotae
- non-classé Xanthomonas hortorum pv. hederae
- non-classé Xanthomonas hortorum pv. pelargonii
- non-classé Xanthomonas hortorum pv. taraxaci
- non-classé Xanthomonas hortorum pv. vitians
Xanthomonas hyacinthi
Xanthomonas melonis
Xanthomonas oryzae
- non-classé Xanthomonas oryzae pv oryzae
- non-classé Xanthomonas oryzae pv. oryzicola
Xanthomonas perforans
Xanthomonas pisi
Xanthomonas populi
Xanthomonas retroflexus
Xanthomonas sacchari
Xanthomonas theicola
Xanthomonas translucens
- non-classé Xanthomonas translucens pv. arrhenatheri
- non-classé Xanthomonas translucens pv. cerealis
- non-classé Xanthomonas translucens pv. graminis
- non-classé Xanthomonas translucens pv. hordei
- non-classé Xanthomonas translucens pv. phlei
- non-classé Xanthomonas translucens pv. phleipratensis
- non-classé Xanthomonas translucens pv. pistacia
- non-classé Xanthomonas translucens pv. poae
- non-classé Xanthomonas translucens pv. secalis
- non-classé Xanthomonas translucens pv. translucens
- non-classé Xanthomonas translucens pv. undulosa
Xanthomonas vasicola
- non-classé Xanthomonas vasicola pv. vasculorum
Xanthomonas vesicatoria

Notes et références

(en) Boch J, Bonas U, « XanthomonasAvrBs3 Family-Type III Effectors: Discovery and Function », Annual Review of Phytopathology, vol. 48,‎ septembre 2010, p. 419–36 (PMID 19400638, DOI 10.1146/annurev-phyto-080508-081936).
Xantomonas
High-efficiency TALEN-based gene editing produces disease-resistant rice, Ting Li, Bo Liun Martin H Spalding, Donald P Weeks et Bing Yang, Nature Biotechnology
TALEN, ciseaux moléculaires de la nouvelle génération de NBT, info NBT
Catalogue of Life, consulté le 23 juillet 2014
NCBI, consulté le 23 juillet 2014

Voir aussi

Liens externes

(en) Référence AlgaeBase : genre Xanthomonas Scagel & J.Stein Non valide (consulté le 23 juillet 2014)
(en) Référence Catalogue of Life : Xanthomonas (consulté le 23 juillet 2014)
(en) Référence NCBI : Xanthomonas (consulté le 23 juillet 2014)
(en) Référence uBio : Xanthomonas W. J. Dowson, 1939 (consulté le 23 juillet 2014)

Bibliographie

(en) Lucia Civetta, Xanthomonas, Springer Netherlands, 2012, 399 p. (ISBN 9789401046664).

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