Kinome

Le kinome est l'ensemble des kinases exprimées dans une cellule, une partie d'une cellule (membranes, organites) ou un groupe de cellules (organe, organisme, groupe d'organismes) dans des conditions données et à un moment donné. Il est à ce titre un sous-protéome, un sous-ensemble d'un protéome. Ce terme a été utilisé pour la première fois en 2002 dans deux articles du groupe de recherche dirigé par Manning analysant les 518 protéine kinases humaines[1] et l'évolution de ces kinases chez les eucaryotes[2].

L'étude d'un kinome se fait avec les outils de la protéomique, le plus souvent en utilisant la spectrométrie de masse après enrichissement de l'échantillon en kinases. Cet enrichissement peut se faire par affinité entre une matrice fonctionnalisée avec des inhibiteurs de kinases (en compétition avec l'ATP) et le lysat que l'on souhaite étudier [3].

Notes et références

(en) Manning G, Whyte DB, Martinez R, Hunter T, Sudarsanam S, « The protein kinase complement of the human genome », Science, vol. 298, n^o 5600,‎ décembre 2002, p. 1912–34 (PMID 12471243, DOI 10.1126/science.1075762)
(en) Manning G, Plowman GD, Hunter T, Sudarsanam S, « Evolution of protein kinase signaling from yeast to man », Trends Biochem. Sci., vol. 27, n^o 10,‎ octobre 2002, p. 514–20 (PMID 12368087, DOI 10.1016/S0968-0004(02)02179-5)
(en) Bantscheff M et al., « Quantitative chemical proteomics reveals mechanisms of action of clinical ABL kinase inhibitors », Nat Biotech, vol. 25, n^o 9,‎ août 2007, p. 1035–1044 (PMID 17721511, DOI 10.1038/nbt1328)

Articles connexes

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[Human_Kinome-1] (en) Manning G, Whyte DB, Martinez R, Hunter T, Sudarsanam S, « The protein kinase complement of the human genome », Science, vol. 298, n^o 5600,‎ décembre 2002, p. 1912–34 (PMID 12471243, DOI 10.1126/science.1075762)

[Kinome_Evolution-2] (en) Manning G, Plowman GD, Hunter T, Sudarsanam S, « Evolution of protein kinase signaling from yeast to man », Trends Biochem. Sci., vol. 27, n^o 10,‎ octobre 2002, p. 514–20 (PMID 12368087, DOI 10.1016/S0968-0004(02)02179-5)

[Protéomique_Chimique-3] (en) Bantscheff M et al., « Quantitative chemical proteomics reveals mechanisms of action of clinical ABL kinase inhibitors », Nat Biotech, vol. 25, n^o 9,‎ août 2007, p. 1035–1044 (PMID 17721511, DOI 10.1038/nbt1328)